About: Pseudouridine     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:WikicatPyrimidines, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FPseudouridine&invfp=IFP_OFF&sas=SAME_AS_OFF&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org&graph=http%3A%2F%2Fdbpedia.org

Pseudouridine (abbreviated by the Greek letter psi- Ψ) is an isomer of the nucleoside uridine in which the uracil is attached via a carbon-carbon instead of a nitrogen-carbon glycosidic bond. (In this configuration, uracil is sometimes referred to as 'pseudouracil'.) Pseudouridine in rRNA and tRNA has been shown to fine-tune and stabilize the regional structure and help maintain their functions in mRNA decoding, ribosome assembly, processing and translation. Pseudouridine in snRNA has been shown to enhance spliceosomal RNA-pre-mRNA interaction to facilitate splicing regulation.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • سودويوريدين (ar)
  • Pseudouridin (cs)
  • Pseudouridin (de)
  • Pseudouridine (fr)
  • シュードウリジン (ja)
  • Pseudouridine (en)
  • Псевдоуридин (ru)
  • 假尿嘧啶核苷 (zh)
  • Псевдоуридин (uk)
rdfs:comment
  • Pseudouridin (abgekürzt nach dem griechischen Buchstaben Psi, Ψ) ist ein natürlich vorkommendes Nukleosid. Es besteht aus der β-D-Ribose (Zucker) und der Nukleinbase Uracil. Pseudouridin ist ein Isomer des Uridins; Ψ-Synthasen katalysieren die Umlagerung. (de)
  • La pseudouridine (notée ψ) est un ribonucléoside dérivé de l'uridine. On la trouve dans certains ARN non codants, comme les ARN de transfert ou les ARN ribosomiques. La pseudouridine n'est pas incorporée lors du processus de transcription, mais résulte d'une modification post-transcriptionnelle de certains résidus d'uridine. C'est la modification de base la plus fréquente dans l'ARN, elle est retrouvée chez l'ensemble des organismes vivants. (fr)
  • 假尿嘧啶核苷(Pseudouridine,簡稱Ψ或Q)或稱5-核糖尿嘧啶(5-ribosyluracil)、假尿苷,是尿苷(U)的一種同分異構物,有別於尿苷中尿嘧啶以碳-氮鍵(C1-N1)與核糖相連,假尿嘧啶核苷中尿嘧啶和核糖是以碳-碳鍵(C1-C5)連接,故其結構較有彈性,比尿苷多出了一個可形成氫鍵的位點,且在RNA中產生的重疊效應高於尿苷。假尿嘧啶核苷最早於1951年發現,為細胞RNA中最常見的修飾,在三域生物中皆有,有A、U、C、G之外的「第五種核苷」之稱。 假尿嘧啶核苷是細胞中最常見的RNA修飾,是轉錄後修飾的機制之一,在轉錄結束後由(PUS)自尿苷轉化而來,此修飾可能影響RNA的結構、功能、位置與半衰期。mRNA、tRNA、rRNA、snRNA與snoRNA中均有發現假尿嘧啶核苷修飾,在tRNA與rRNA中可穩定RNA的結構,與其轉譯的功能相關;在snRNA中則可促進剪接體對的切割;在mRNA中的功能仍不清楚,有研究顯示終止密碼子中的假尿嘧啶核苷可能會造成(translation readthrough)。假尿嘧啶核苷還可能被細胞用作識別自身與外來RNA的機制,即RIG-I和等先天免疫蛋白可識別不含有假尿嘧啶核苷的病毒RNA而啟動免疫反應。 (zh)
  • Псевдоуридин, ψ (від грецької літери «псі») — 5'рибозил-урацил, ізомер уридину (1'рибозил урацилу) — піримідин, найпоширеніший вид модифікацій РНК, які виникають після її синтезу з ДНК-матриці під час процесингу та модифікації. Присутність псевдоуридину в молекулах РНК надає більшої жорсткості фосфодіестеразному «хребту» молекули, та додає міцності комплементарній парі ψ-А (замість У-А), звідси псевдоуридинова модифікація грає роль у функціонуванні мяРНК у складі сплайсосом та трансляції у складі рРНК та тРНК. Нещодавно було відкрито присутність ψ у мРНК.. (uk)
  • السودويوريدين (بالإنجليزية: Pseudouridine )‏ ويختصر بالرمز الإغريقي بسي Ψ هو مماكب نوكليوسيد اليوريدين تكون فيه قاعدة اليوراسيل مرتبطة بالريبوز عن طريق رابطة كربون-كربون بدل الرابطة الغليكوسيدية نيتروجين-كربون (يسمى أحيانا اليوراسيل في هذا التركيب سودويوراسيل) وهو أكثر النوكليوسيدات المعدلة انتشارا من بين المئات الموجودة في الحمض النووي الريبوزي. يوجد Ψ في جميع الأجناس وفي العديد من أنواع الرنا ويتم إنتاجه بواسطة إنزيم يسمى Ψ سينثاز الذي يماكب نوكليوسيدات يوريدين محددة أثناء تعديلات ما بعد النسخ في عملية تسمى السودويوريدينلة (pseudouridylation). تم حتى الآن تحديد حوالي 9500 تعديل سودويوريدين (Ψ) لدى الثديات والخميرة وتم وضعها في قاعدة بيانات RMBase. (ar)
  • Pseudouridin (Ψ, systematicky 5-β-D-ribofuranosyluracil či 5-ribosyluracil) je neobvyklý nukleosid tvořený ribózou a uracilem, jenž je připojen na ribózu C-glykosidickou vazbou. Od uridinu se liší konkrétní pozicí cyklu, jímž je uracil k ribóze připojen (u uridinu je to 1' dusík, u pseudouridinu 5' uhlík uracilu). Syntéza pseudouridinu z uridinu (cs)
  • Pseudouridine (abbreviated by the Greek letter psi- Ψ) is an isomer of the nucleoside uridine in which the uracil is attached via a carbon-carbon instead of a nitrogen-carbon glycosidic bond. (In this configuration, uracil is sometimes referred to as 'pseudouracil'.) Pseudouridine in rRNA and tRNA has been shown to fine-tune and stabilize the regional structure and help maintain their functions in mRNA decoding, ribosome assembly, processing and translation. Pseudouridine in snRNA has been shown to enhance spliceosomal RNA-pre-mRNA interaction to facilitate splicing regulation. (en)
  • シュードウリジン (英: pseudouridine、ギリシャ文字のΨや英文字のQで略記される) は、ヌクレオシドであるウリジンの異性体。リボース環とウラシルの間のグリコシド結合のN-C結合がC-C結合に置き換わっている。RNAに知られている100を超える修飾塩基としては最も一般的で、Ψはすべての生物種、ほとんどのRNAに見出されている。 転写やその後の合成過程の後、RNAは化学的に異なる100以上の修飾を受ける。こうした修飾は転写後の段階でRNAの発現を調節している可能性があり、RNAの翻訳、局在、安定化などさまざまな役割を果たしている可能性がある。シュードウリジル化もそうした修飾の1つであり、ウリジンがC5-グリコシド結合型異性体であるシュードウリジンへ変換される。ウリジンには一般的なリボースのC1位とウラシルのN1位の間のC-N結合が存在するのに対し、シュードウリジンではリボースのC1位とウラシルのC5位がC-C結合を形成している。C-C結合は、より大きな回転自由度と立体配座の柔軟性を与える。さらに、シュードウリジンにはN1位に余分な水素結合供与体が存在する。シュードウリジンは5-リボシルウラシルとしても知られ、tRNA、rRNA、snRNA、snoRNAなどの構造的RNAの構成要素として普遍的に存在している。近年では、タンパク質をコードするmRNAにも発見されている。シュードウリジンは最も豊富に存在する修飾塩基であり、生物の3つのドメインすべてに存在し、最初に発見された修飾塩基である。このヌクレオチドは「5番目のヌクレオチド」であると見なされており、酵母のtRNAの4%を占めている。この塩基修飾はRNAを安定化し、余分なイミノ基を介して水分子と水素結合を形成することで塩基のスタッキングを強化する。大腸菌Escherichia coliのrRNAにはシュードウリジンが (ja)
  • Псевдоуридин (сокращённо обозначается греческой буквой Ψ) — это C-гликозид, изомер нуклеозида уридина. Это наиболее часто встречающееся модифицированное основание из более чем сотни различных модифицированных оснований, которые встречаются в РНК. Псевдоуридин встречается во всех видах и многих классах РНК. Он синтезируется ферментом псевдоуридинсинтазой, который посттранскрипционно изомеризует определённые остатки уридина в РНК. Такой процесс называют псевдоуридинилирование. (ru)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Pseudouridine.svg
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/PDB_2nr0_EBI.jpg
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Pseudouridine-synthase.jpg
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/TRNA-Ala_yeast.svg
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 55 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software