About: Zymography     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:WikicatProteinMethods, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/c/5DobCVDpY1

Zymography is an electrophoretic technique for the detection of hydrolytic enzymes, based on the substrate repertoire of the enzyme. Three types of zymography are used; in gel zymography, in situ zymography and in vivo zymography For instance, gelatin embedded in a polyacrylamide gel will be digested by active gelatinases run through the gel. After Coomassie staining, areas of degradation are visible as clear bands against a darkly stained background.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Zimografia (ca)
  • Zymographie (de)
  • Zimografía (es)
  • Zimogramma (it)
  • Зимография (ru)
  • Zymography (en)
rdfs:comment
  • La zimografia o zimograma és una tècnica electroforètica que permet observar l'activitat d'enzims. Es realitza amb poliacrilamida i, a diferència de les electroforesis de proteïnes en condicions desnaturalitzants, (SDS-PAGE), es tracta d'utilitzar condicions suaus (sense agents reductors) per evitar la pèrdua d'activitat dels enzims estudiats. (ca)
  • Die Zymographie ist ein auf der SDS-PAGE basierendes Verfahren, bei dem ein Substrat für ein zu untersuchendes Enzym oder Proteingemisch ins Gel gegeben wurde. (de)
  • La zimografía o zimograma es una técnica electroforética que permite observar actividad de enzimas. Se realiza con poliacrilamida y a diferencia de las electroforesis de proteínas en condiciones desnaturalizantes (SDS-PAGE) se trata de utilizar condiciones suaves (sin agentes reductores) para evitar la pérdida de actividad de las enzimas estudiadas. (es)
  • Zymography is an electrophoretic technique for the detection of hydrolytic enzymes, based on the substrate repertoire of the enzyme. Three types of zymography are used; in gel zymography, in situ zymography and in vivo zymography For instance, gelatin embedded in a polyacrylamide gel will be digested by active gelatinases run through the gel. After Coomassie staining, areas of degradation are visible as clear bands against a darkly stained background. (en)
  • Lo zimogramma è una tecnica elettroforetica, basata sull'elettroforesi SDS-PAGE, che include un substrato copolimerizzato in un gel di poliacrilammide per la rilevazione dell'attività enzimatica.I campioni sono preparati in una SDS-PAGE standard ma non vengono bolliti (inattivati) e non si usano agenti riducenti. In seguito all'elettroforesi l'SDS è rimosso dal gel (o zimogramma) grazie a dei lavaggi con -100, in seguito al lavaggio lo zimogramma viene incubato in un appropriato buffer di digestione alla temperatura ottimale di circa 37 °C.Lo zimogramma è successivamente colorato (comunemente con nero d'amido o Blu di Coomassie), le aree ove è avvenuta la digestione appariranno chiare di contro le zone ove non è avvenuta la digestione appariranno scure.È possibile sviluppare uno zimogramma (it)
  • Зимография — электрофоретическая технология, основанная на SDS-PAGE, которая включает субстратную сополимеризацию с полиакриламидным гелем, для обнаружения ферментативной активности. Образцы готовят в стандартно обработанном SDS-PAGE буфере, но без кипячения и без редуцирующего агента. После электрофореза, SDS удаляется из геля (или зимограммы) выдерживанием в небуферезированном Тритон X-100, затем следует выдерживание в подходящем расщепляющем буфере, за оптимальный отрезок времени при 37 °C. Далее, зимограмма окрашивается (обычно Амидным Чёрным и Кумасси брильянтовым голубым), при этом, в том месте, где субстрат был расщеплён ферментом, проявляются области расщепления в виде отчётливых полосок на тёмно окрашенном фоне. Эти протоколы, однако, нуждаются в сильных уточнениях. Например, пище (ru)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Plasmodium_knowlesi_hemoglobinase_imprint.jpg
dct:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
has abstract
  • La zimografia o zimograma és una tècnica electroforètica que permet observar l'activitat d'enzims. Es realitza amb poliacrilamida i, a diferència de les electroforesis de proteïnes en condicions desnaturalitzants, (SDS-PAGE), es tracta d'utilitzar condicions suaus (sense agents reductors) per evitar la pèrdua d'activitat dels enzims estudiats. (ca)
  • Die Zymographie ist ein auf der SDS-PAGE basierendes Verfahren, bei dem ein Substrat für ein zu untersuchendes Enzym oder Proteingemisch ins Gel gegeben wurde. (de)
  • La zimografía o zimograma es una técnica electroforética que permite observar actividad de enzimas. Se realiza con poliacrilamida y a diferencia de las electroforesis de proteínas en condiciones desnaturalizantes (SDS-PAGE) se trata de utilizar condiciones suaves (sin agentes reductores) para evitar la pérdida de actividad de las enzimas estudiadas. (es)
  • Zymography is an electrophoretic technique for the detection of hydrolytic enzymes, based on the substrate repertoire of the enzyme. Three types of zymography are used; in gel zymography, in situ zymography and in vivo zymography For instance, gelatin embedded in a polyacrylamide gel will be digested by active gelatinases run through the gel. After Coomassie staining, areas of degradation are visible as clear bands against a darkly stained background. Modern usage of the term zymography has been adapted to define the study and cataloging of fermented products, such as beer or wine, often by specific brewers or winemakers or within an identified category of fermentation such as with a particular strain of yeast or species of bacteria.Zymography also refers to a collection of related, fermented products, considered as a body of work. For example, all of the beers produced by a particular brewery could collectively be referred to as its zymography. See also Zymology or the applied science of zymography. Zymology relates to the biochemical processes of fermentation, especially the selection of fermenting yeast and bacteria in brewing, winemaking, and other fermented foods. For example, beer-making involves the application of top (ale) or bottom fermenting yeast (lager), to produce the desired variety of beer. The synthesis of the yeast can impact the flavor profile of the beer, i.e. diacetyl (taste or aroma of buttery, butterscotch). (en)
  • Lo zimogramma è una tecnica elettroforetica, basata sull'elettroforesi SDS-PAGE, che include un substrato copolimerizzato in un gel di poliacrilammide per la rilevazione dell'attività enzimatica.I campioni sono preparati in una SDS-PAGE standard ma non vengono bolliti (inattivati) e non si usano agenti riducenti. In seguito all'elettroforesi l'SDS è rimosso dal gel (o zimogramma) grazie a dei lavaggi con -100, in seguito al lavaggio lo zimogramma viene incubato in un appropriato buffer di digestione alla temperatura ottimale di circa 37 °C.Lo zimogramma è successivamente colorato (comunemente con nero d'amido o Blu di Coomassie), le aree ove è avvenuta la digestione appariranno chiare di contro le zone ove non è avvenuta la digestione appariranno scure.È possibile sviluppare uno zimogramma oppure un anti-zimogramma, la differenza tra le due metodiche è diretta a rilevare o l'attività di un enzima specifico oppure di un inibitore di uno specifico enzima. Nello zimogramma il gel polimerizzato di poliacrilammide contenente il substrato della digestione ove avviene la corsa elettroforetica dell'enzima (temporaneamente inibito dall'SDS) dopo la separazione delle proteine (corsa elettroforetica) viene lavato in modo da togliere l'inattivante e la reazione (digestione) avviene immergendo il gel in un buffer ottimizzante le cui bande chiare indicheranno l'attività dell'enzima su uno sfrondo interamente colorato (il colorante si lega al substrato dell'enzima).L'anti-zimogramma segue un percorso leggermente differente, il gel contiene sempre il substrato, ma visto che si cercano gli inibitori di un enzima (posti a correre nel gel dell'elettroforesi) non si utilizza l'SDS ma nel buffer ottimizzante di reazione si aggiunge l'enzima di interesse, così l'enzima digerirà tutto il substrato tranne nei punti in cui si trovano gli inibitori dello stesso. La successiva rivelazione darà zone scure ove gli inibitori hanno operato su di uno sfondo chiaro. (it)
  • Зимография — электрофоретическая технология, основанная на SDS-PAGE, которая включает субстратную сополимеризацию с полиакриламидным гелем, для обнаружения ферментативной активности. Образцы готовят в стандартно обработанном SDS-PAGE буфере, но без кипячения и без редуцирующего агента. После электрофореза, SDS удаляется из геля (или зимограммы) выдерживанием в небуферезированном Тритон X-100, затем следует выдерживание в подходящем расщепляющем буфере, за оптимальный отрезок времени при 37 °C. Далее, зимограмма окрашивается (обычно Амидным Чёрным и Кумасси брильянтовым голубым), при этом, в том месте, где субстрат был расщеплён ферментом, проявляются области расщепления в виде отчётливых полосок на тёмно окрашенном фоне. Эти протоколы, однако, нуждаются в сильных уточнениях. Например, пищеварительная гликозидаза D. melanogaster выживает в редуцированных условиях (то есть в присутствии 2-меркаптоэтанола или DTT) и при объёмном подогреве. Действительно, разделение дальнейшим нагреванием до 50 °C приводит к явному увеличению разрешения полос, без существенных потерь активностей. Желатин — это наиболее стандартный из используемых субстратов и может быть полезен для демонстрации активности желатин разрушающих протеаз, но зимография может быть применена и к широкому кругу ферментов, включающему ксиланазы, протеазы, липазы, хитаназы, и т. д. Общий протокол, используемый в прошлом для зимографии альфа-амилазной активностей, был назван протоколом тонкого слоя крахмала W. W. Doane. По этому протоколу исходный PAGE гель запускался для разделения белков в гомогенате. После этого тонкий гель с растворённым в нём крахмалом (или точнее, суспензированным) покрывался сверху исходным гелем на некоторое время. Крахмал окрашивался раствором Люголя. Обратная зимография сополимеризует как субстрат, так и фермент с акриламидом, и это полезно для демонстрации активности ингибитора фермента. При последующем окрашивании, участки ингибирования визуализируются как тёмные пятна на чистом (или светлоокрашенном фоне). (ru)
gold:hypernym
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is Wikipage redirect of
is foaf:primaryTopic of
Faceted Search & Find service v1.17_git147 as of Sep 06 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3332 as of Dec 5 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 67 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software