| has abstract
| - اختبار ربط قليل النيوكليتيد (SOLiD) هو إحدى تقنيات الجيل التالي من تسلسل الحمض النووي المتطورة في تقنيات الحياة وبدأ تداولها تجاريًا منذ عام 2008. وقد نتجت تكنولوجيا الجيل التالي المذكورة عن مئات الملايين والمليارات من السلسلة الصغيرة التي تقرأ في آن واحد. لا يجب الغلط بين هذه الطريقة و"التسلسل بالتركيب"، وهو المبدأ الذي استخدمه روش-454 في سلسلة البايرو (ظهرت في عام 2005، -مما نتج عن 200-400bp تقرأ في 2009)، ونظام سوليكسا (يمتلكه الآن إليمينا) (ظهر في عام 2006، وقد نتج عن مئات الملايين من 50-100bp تقرأ في 2009) خفضت هذه الأساليب التكلفة من 0.01 دولار/قاعدة في عام 2004 لما يقرب من 0.0001 دولار/قاعدة في عام 2006 وزيادة تسلسل القدرة من 1,000,000 قاعدة/آلة/يوم في عام 2004 لما يزيد عن 5,000,000,000 قاعدة/آلة/يوم في عام 2009. هناك أكثر من 30 مقالة تصف أول استخدام لها لتحديد مواقع الجسم النووي من فالويوف وآخرين ملفات التعريف أو العقدة الحساسة لتسلسل الحمض النووي الحساس المعقد مع كلونان وآخرين، ملف التعريف الذي يصف الخلية المفردة مع تانج وآخرين وأخيرًا إعادة حسبة التسلسل البشري مع مكيرنان وآخرين. (ar)
- SOLiD (Sequencing by Oligonucleotide Ligation and Detection) is a next-generation DNA sequencing technology developed by Life Technologies and has been commercially available since 2006. This next generation technology generates 108 - 109 small sequence reads at one time. It uses 2 base encoding to decode the raw data generated by the sequencing platform into sequence data. This method should not be confused with "sequencing by synthesis," a principle used by Roche-454 pyrosequencing (introduced in 2005, generating millions of 200-400bp reads in 2009), and the Solexa system (now owned by Illumina) (introduced in 2006, generating hundreds of millions of 50-100bp reads in 2009) These methods have reduced the cost from $0.01/base in 2004 to nearly $0.0001/base in 2006 and increased the sequencing capacity from 1,000,000 bases/machine/day in 2004 to more than 5,000,000,000 bases/machine/day in 2009. Over 30 publications exist describing its use first for nucleosome positioning from Valouev et al., transcriptional profiling or strand sensitive RNA-Seq with Cloonan et al., single cell transcriptional profiling with Tang et al. and ultimately human resequencing with McKernan et al. The method used by this machine (sequencing-by-ligation) has been reported to have some issue sequencing palindromic sequences. (en)
- La secuenciación SOLiD (del inglés Sequencing by Oligonucleotide Ligation and Detection), también llamada de (codificación con dos bases), es una técnica de secuenciación de ADN de próxima generación desarrollada por y disponible comercialmente desde 2006. Esta técnica genera cientos de millones de pequeñas lecturas de secuencia a la vez. Las librerías pueden ser secuenciadas hasta por 8 sondas de ligación (método de secuenciación en escalera). Además, permite elegir como librería fragmentos de preparación de una librería o una librería completa. En ambos casos, el ADN diana se ajusta un tamaño específico mediante la ligación de adaptadores en los extremos de los fragmentos resultantes. El costo de secuenciación es de aproximadamente 40x10-9 dólares por base, al tiempo que aumenta la capacidad de secuenciar desde 1 000 000 bases/máquina/día a 500 0000 000 bases/máquina/día. En varias publicaciones se menciona su uso en diversos procesos,ya que se puede secuenciar el genoma completo, encontramos estudios que van desde investigaciones del transcriptoma (incluidos perfiles de expresión génica, análisis de ARN pequeños y análisis de transcriptoma completo) ,epigenoma (como ChIPSeq y metilación) hasta resecuenciación dirigida . La longitud de lectura de SOLiD fue inicialmente de 35 pb. La secuenciación por ligación usada tiene algunos problemas a la hora de secuenciar palíndromos.Uno de los problemas comunes de las técnicas NGS es la representación insuficiente o excesiva de GC o AT rico secuencias. Estos sesgos a menudo se generan durante preparación de la biblioteca, principalmente cuando las bibliotecas se someten a una reacción en cadena de polimerasa (PCR) exclusiva, mientras que se cree que las bibliotecas libres de PCR se secuencian con significativamente menos o casi sin sesgo. Sin embargo, cabe destacar que SOLiD como la plataforma ideal de elección para investigadores que tratan con organismos en un similar gama de contenido de GC. (es)
- SOLiD (англ. Sequencing by Oligonucleotide Ligation and Detection) — технология нового поколения секвенирования ДНК, развиваемая компанией Life Technologies (https://web.archive.org/web/20080516181322/http://solid.appliedbiosystems.com/), коммерчески доступна с 2006 года. SOLiD позволяет секвенировать разом сотни миллионов и даже миллиарды коротких последовательностей. SOLiD использует метод лигирования в отличие от других платформ, таких как Roche-454 пиросеквенирование (метод появился в 2005 году, в 2009 году уже создавал миллионы последовательностей длиной 200—400 пар оснований) и система Solexa (сейчас принадлежит Illumina) (метод появился в 2006 году, в 2009 году уже создавал миллионы последовательностей длиной 50-100 пар оснований), которые используют секвенирование с помощью синтеза. Эти все методы снизили стоимость секвенирования в 2006 году с $0.01/основание до, примерно, $0.0001/основание и увеличили мощность с 1 млн оснований/секвенатор/день (2004 год) до более 5 млн оснований/секвенатор/день (2009 год). Существуют более 30 публикаций, описывающих использование метода в нуклеосомном позиционировании, транскрипционном профайлинге или цепь-специфичном RNA-Seq, транскрипционном профайлинге в единичной клетке и пересеквенировании человеческого генома. (ru)
|
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)
