| rdfs:comment
| - Un site AP (site apurinique/apyrimidique), ou site abasique, est un emplacement de l'ADN où la base (purine ou pyrimidine) est manquante. En termes de séquence génétique, c'est donc un site « vacant ». (fr)
- Miejsce AP, miejsce apurynowe/apirymidynowe – miejsce w DNA nie posiadające ani zasady purynowej (depurynacja), ani pirymidynowej (depirymidynacja), zwykle w wyniku uszkodzenia nici DNA. Jeśli uszkodzenie nie zostanie usunięte, podczas replikacji DNA może zostać wprowadzona mutacja, ponieważ podczas syntezy nici komplementarnej w takim miejscu może znaleźć się losowy nukleotyd. (pl)
- 在生物化學和分子遺傳學之中，AP位點(缺嘌呤/缺嘧啶位點)，也被稱作是缺鹼基位點，通常位在由嘌呤或是嘧啶組成的DNA之內(也有極小機率出現在双链RNA之內)，不是自發的話就是由DNA損傷造成。在一般生理條件下，一個細胞每天估計產生約10,000個缺嘌呤位點和500個缺嘧啶位點。 AP位點能夠由自發的產生，但也可能充當鹼基切除修復機制中的中間產物。在這過程之中，識別受損的鹼基，並切下N-糖苷鍵結，使鹼基脫去產生AP位點。不同的N-糖苷酶能夠分別不同類型的損傷，其中包含過氧化或是甲基化的鹼基，或是尿嘧啶出現在DNA之中。AP位點在這之後被切除, 生成3'羥基和5'磷酸脫氧核糖的末端(參見DNA 結構)。在另一種方法之中，雙功能的糖基化酶-裂解酶能切除AP位點，生成一個5'磷酸鹽並鄰接著一個3'α,β-未飽和的醛類。兩種機制最後都造成單股DNA斷裂，之後被長-補丁和短-補丁鹼基切除修復的機制所補齊，形成雙股的DNA。 如果有未修復的情況，半保留複製進行時，AP位點將能夠導致突變發生。AP位點能造成複製叉停止，以及被跨損傷修復機制所略過。對於E. coli，腺嘌呤會被優先插入，並略過AP位點，這個過程被稱作"A規則"。跨損傷修復機制在高等的真核生物之中會更為複雜，不同的鹼基在不同的生物和實驗條件下，會顯現不同的偏好。 (zh)
- Eine AP-Stelle ist eine Stelle in der DNA, die weder Purine noch Pyrimidine enthält, meist wegen eines DNA-Schadens oder einer DNA-Glykosylase. Die Abkürzung AP steht für apurinic bzw. apyrimidinic site.Falls eine AP-Stelle unrepariert bleibt, kann sie zu einer Mutation während der Replikation der DNA führen, da dabei eine zufällige Base im Gegenstrang einfügt wird. Von vielen Polymerasen wird bevorzugt Adenin eingebaut (A-rule). (de)
- In biochemistry and molecular genetics, an AP site (apurinic/apyrimidinic site), also known as an abasic site, is a location in DNA (also in RNA but much less likely) that has neither a purine nor a pyrimidine base, either spontaneously or due to DNA damage. It has been estimated that under physiological conditions 10,000 apurinic sites and 500 apyrimidinic may be generated in a cell daily. (en)
- En bioquímica y genética molecular, un sitio AP (sitio apurínico/apirimidínico), también conocido como sitio abásico, es una ubicación en el ADN (también en el ARN pero mucho menos probable) que no tiene una base de purina o pirimidina, ya sea espontáneamente o debido al daño en el ADN. Se ha estimado que, en condiciones fisiológicas, se pueden generar 10.000 sitios apurínicos y 500 apirimidínicos en una célula diariamente. (es)
- AP-site, apurin/apyrimidin site, är i molekylärbiologi ett område på DNA-strängen som saknar den kvävebas som egentligen borde finnas där sett till den komplementära DNA-strängen. Området uppkommer vanligtvis på grund av DNA-skada. AP-siter kan formas genom spontant bas-bortfall, men kan också bildas som intermediär i Base excision repair. (sv)
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| - In biochemistry and molecular genetics, an AP site (apurinic/apyrimidinic site), also known as an abasic site, is a location in DNA (also in RNA but much less likely) that has neither a purine nor a pyrimidine base, either spontaneously or due to DNA damage. It has been estimated that under physiological conditions 10,000 apurinic sites and 500 apyrimidinic may be generated in a cell daily. AP sites can be formed by spontaneous depurination, but also occur as intermediates in base excision repair. In this process, a DNA glycosylase recognizes a damaged base and cleaves the N-glycosidic bond to release the base, leaving an AP site. A variety of glycosylases that recognize different types of damage exist, including oxidized or methylated bases, or uracil in DNA. The AP site can then be cleaved by an AP endonuclease, leaving 3'-hydroxyl and termini (see DNA structure). In alternative fashion, bifunctional glycosylase-lyases can cleave the AP site, leaving a 5' phosphate adjacent to a 3' α,β-unsaturated aldehyde. Both mechanisms form a single-strand break, which is then repaired by either short-patch or long-patch base excision repair. If left unrepaired, AP sites can lead to mutation during semiconservative replication. They can cause replication fork stalling and are bypassed by translesion synthesis. In E. coli, adenine is preferentially inserted across from AP sites, known as the "A rule". The situation is more complex in higher eukaryotes, with different nucleotides showing a preference depending on the organism and experimental conditions. (en)
- Eine AP-Stelle ist eine Stelle in der DNA, die weder Purine noch Pyrimidine enthält, meist wegen eines DNA-Schadens oder einer DNA-Glykosylase. Die Abkürzung AP steht für apurinic bzw. apyrimidinic site.Falls eine AP-Stelle unrepariert bleibt, kann sie zu einer Mutation während der Replikation der DNA führen, da dabei eine zufällige Base im Gegenstrang einfügt wird. Von vielen Polymerasen wird bevorzugt Adenin eingebaut (A-rule). AP-Stellen werden häufig von repariert. Diese entfernen einzelne oder einige Nukleotide auf der 5'-Seite von der AP-Stelle und fügen neue Nukleotide mit Hilfe des unbeschädigten Gegenstranges als Matrize ein. Wenn nur ein Nukleotid zu reparieren ist, wird ein sogenannter „kurzkettige Reparatur“ (engl. „short patch repair“) Mechanismus angewandt, wobei unter anderem die DNA-Ligase II zum Einsatz kommt. Wenn mehr als ein Nukleotid ersetzt werden muss, dann wird ein sogenannter „langkettige Reparatur“ (engl. „long patch“) Mechanismus eingesetzt, wobei hier die DNA Ligase I, zusammen mit einigen anderen Faktoren die Lücke wieder auffüllt. (de)
- En bioquímica y genética molecular, un sitio AP (sitio apurínico/apirimidínico), también conocido como sitio abásico, es una ubicación en el ADN (también en el ARN pero mucho menos probable) que no tiene una base de purina o pirimidina, ya sea espontáneamente o debido al daño en el ADN. Se ha estimado que, en condiciones fisiológicas, se pueden generar 10.000 sitios apurínicos y 500 apirimidínicos en una célula diariamente. Los sitios AP pueden formarse por depurinación espontánea, pero también ocurren como intermedios en la . En este proceso, una reconoce una base dañada y corta el enlace N-glucosídico para liberar la base, dejando un sitio AP. Existe una variedad de glicosilasas que reconocen diferentes tipos de daños, incluidas las bases oxidadas o metiladas, o el uracilo en el ADN. El sitio AP puede ser escindido por una , dejando 3' hidroxilo y 5' desoxirribosfosfato terminales (ver estructura del ADN). De forma alternativa, las glucosilasa liasa bifuncionales pueden escindir el sitio AP, dejando un fosfato 5 'adyacente a un aldehído 3' α, β-insaturado. Ambos mecanismos forman una ruptura de un solo filamento, que luego se repara mediante reparación de escisión de base de parche corto o largo. Si no se reparan, los sitios AP pueden provocar mutaciones durante la . Pueden causar el estancamiento de la horquilla de replicación y se evitan mediante la síntesis de translesión. En E. coli, la adenina se inserta preferentemente frente a los sitios AP, conocida como la "regla A". La situación es más compleja en eucariotas superiores, con diferentes nucleótidos que muestran una preferencia dependiendo del organismo y las condiciones experimentales. (es)
- Un site AP (site apurinique/apyrimidique), ou site abasique, est un emplacement de l'ADN où la base (purine ou pyrimidine) est manquante. En termes de séquence génétique, c'est donc un site « vacant ». (fr)
- Miejsce AP, miejsce apurynowe/apirymidynowe – miejsce w DNA nie posiadające ani zasady purynowej (depurynacja), ani pirymidynowej (depirymidynacja), zwykle w wyniku uszkodzenia nici DNA. Jeśli uszkodzenie nie zostanie usunięte, podczas replikacji DNA może zostać wprowadzona mutacja, ponieważ podczas syntezy nici komplementarnej w takim miejscu może znaleźć się losowy nukleotyd. (pl)
- AP-site, apurin/apyrimidin site, är i molekylärbiologi ett område på DNA-strängen som saknar den kvävebas som egentligen borde finnas där sett till den komplementära DNA-strängen. Området uppkommer vanligtvis på grund av DNA-skada. AP-siter kan formas genom spontant bas-bortfall, men kan också bildas som intermediär i Base excision repair. Om en AP-site lämnas oreparerad kan den leda till mutationer vid kopieringen, replikationen, av DNA. Hos E. coli, sätts framförallt adenin-baser in i AP-sites, något som också kallas "A-law", eller "A-regeln". Situationen är mer komplicerad när det kommer till komplexa eukaryoter, med olika nukleotider som föredras beroende på organism och experimentella villkor. (sv)
- 在生物化學和分子遺傳學之中，AP位點(缺嘌呤/缺嘧啶位點)，也被稱作是缺鹼基位點，通常位在由嘌呤或是嘧啶組成的DNA之內(也有極小機率出現在双链RNA之內)，不是自發的話就是由DNA損傷造成。在一般生理條件下，一個細胞每天估計產生約10,000個缺嘌呤位點和500個缺嘧啶位點。 AP位點能夠由自發的產生，但也可能充當鹼基切除修復機制中的中間產物。在這過程之中，識別受損的鹼基，並切下N-糖苷鍵結，使鹼基脫去產生AP位點。不同的N-糖苷酶能夠分別不同類型的損傷，其中包含過氧化或是甲基化的鹼基，或是尿嘧啶出現在DNA之中。AP位點在這之後被切除, 生成3'羥基和5'磷酸脫氧核糖的末端(參見DNA 結構)。在另一種方法之中，雙功能的糖基化酶-裂解酶能切除AP位點，生成一個5'磷酸鹽並鄰接著一個3'α,β-未飽和的醛類。兩種機制最後都造成單股DNA斷裂，之後被長-補丁和短-補丁鹼基切除修復的機制所補齊，形成雙股的DNA。 如果有未修復的情況，半保留複製進行時，AP位點將能夠導致突變發生。AP位點能造成複製叉停止，以及被跨損傷修復機制所略過。對於E. coli，腺嘌呤會被優先插入，並略過AP位點，這個過程被稱作"A規則"。跨損傷修復機制在高等的真核生物之中會更為複雜，不同的鹼基在不同的生物和實驗條件下，會顯現不同的偏好。 (zh)
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