B13R (sometimes called SPI-2) is a protein expressed by vaccinia virus. Vaccinia virus is member of Orthopoxvirus family. These viruses contain approximately 200 genes in their genome. About one third of the genome is not necessary for the viral replication itself. These viral products interfere with the host immune response. SPI-2 is one of these immunomodulatory factors. Vaccinia virus encodes two more serpin - SPI-1 and SPI-3. SPI-1 influences the host range and SPI-3 stops infected cells from fusing together.
| Attributes | Values |
|---|
| rdfs:label
| - B13R (protein) (cs)
- B13R (virus protein) (en)
|
| rdfs:comment
| - B13R (někdy také označovaný jako SPI-2) je protein exprimovaný virem vakcínie. Virus vakcínie je zástupce rodu orthopoxviridae. Tyto viry nesou ve svém genomu zhruba 200 genů, z nichž přibližně třetina není nutná pro samotnou replikaci viru. Tyto exprimované produkty slouží k modulaci imunitní odpovědi hostitele. Jedním z těchto imunomodulačních faktorů je právě SPI-2. Virus vakcínie kóduje ještě dva další sepriny SPI-1 a 3. SPI-1 ovlivňuje hostitelské spektrum viru a SPI-3 brání fúzi infikovaných buněk. (cs)
- B13R (sometimes called SPI-2) is a protein expressed by vaccinia virus. Vaccinia virus is member of Orthopoxvirus family. These viruses contain approximately 200 genes in their genome. About one third of the genome is not necessary for the viral replication itself. These viral products interfere with the host immune response. SPI-2 is one of these immunomodulatory factors. Vaccinia virus encodes two more serpin - SPI-1 and SPI-3. SPI-1 influences the host range and SPI-3 stops infected cells from fusing together. (en)
|
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| Organism
| |
| UniProt
| |
| has abstract
| - B13R (někdy také označovaný jako SPI-2) je protein exprimovaný virem vakcínie. Virus vakcínie je zástupce rodu orthopoxviridae. Tyto viry nesou ve svém genomu zhruba 200 genů, z nichž přibližně třetina není nutná pro samotnou replikaci viru. Tyto exprimované produkty slouží k modulaci imunitní odpovědi hostitele. Jedním z těchto imunomodulačních faktorů je právě SPI-2. SPI-2 je neglykosylovaný polypeptid o velikosti 38,5 kDa. Je exprimován v časné fázi infekce. Iniciační místo transkripce bylo identifikováno 72 nukleotidů upstream od otevřeného čtecího rámce. Translatovnaný protein zůstává v cytosolu hostitelské buňky. SPI-2 sdílí z 92 % aminokyselinovou sekvenci s modifikátorem cytokinové odpovědi viru kravských neštovic crmA. Strukturně patří do rodiny inhibitorů serinových proteáz (neboli serpinů). Serpiny jsou nejrozšířenější rodinou inhibitorů proteáz a byly nalezeny ve všech vícebuněčných eukaryotních organismech. U savců jich je celá řada sekretována do plasmy, kde fungují jako inhibitory proteáz podílejících se na zánětlivých procesech, aktivaci komplementu a srážení krve. SPI-2 inhibuje štěpení neaktivního prekurzoru interleukinu-1β (pro-IL-1β) na aktivní IL-1β. A to vazbou na kaspázu 1 (neboli ICE – interleukin-1 konvertující enzym), která je za normálních okolností aktivovaná po aktivaci a sestavení inflamasomu. Exprese SPI-2 vede rovněž k inhibici apoptotické dráhy aktivované Fas ligandem a TNFα. Delece SPI-2 vede ke značné atenuaci viru (pozorováno v myším modelu po intranasální infekci) ovšem bez výraznějšího vlivu na intenzitu imunitní odpovědi hostitele. Což byl jeden z důvodů, proč byl SPI-2 považován za vhodný terč při přípravě bezpečnější vakcíny proti pravým neštovicím. Bylo ukázáno, že při deleci SPI-2 a 1 a při současné expresi IFNγ vloženého do genomu viru vakcínie dochází ke značné atenuaci, ale zároveň stále k vyvolání silné imunitní odpovědi. Reakce organismu byla srovnatelná s reakcí na MVA (modifikovaný virus Ankara), což je virus sloužící jako vakcína proti pravým neštovicím v dnešní době. Virus vakcínie kóduje ještě dva další sepriny SPI-1 a 3. SPI-1 ovlivňuje hostitelské spektrum viru a SPI-3 brání fúzi infikovaných buněk. (cs)
- B13R (sometimes called SPI-2) is a protein expressed by vaccinia virus. Vaccinia virus is member of Orthopoxvirus family. These viruses contain approximately 200 genes in their genome. About one third of the genome is not necessary for the viral replication itself. These viral products interfere with the host immune response. SPI-2 is one of these immunomodulatory factors. SPI-2 is a nonglycosylated peptide with size of 38,5 kDa. It is expressed in an early phase of infection. The initiation site for transcription was identified about 72 nucleotides upstream from the open reading frame. The translated protein stays in the cytoplasm of the host cell. SPI-2 shares 92% of its amino acid sequence with the cowpox virus modifier of the cytokine response – known as crmA. SPI-2 belongs in superfamily of the inhibitors of serine proteases (serpins). Serpins are the most broadly distributed family of inhibitors of proteases. They were identified in all multicellular eukaryotic organisms. In mammals serpins are secreted in plasma where they serve as inhibitors of proteases involved in blood coagulation, inflammation and complement activation. SPI-2 inhibits processing of an inactive precursor of interleukin-1β (pro-IL-1β) to active form of this cytokine. It does so by binding to caspase 1 (or ICE – interleukin-1 converting enzyme) which is under normal circumstances activated by the formation of inflammasome. SPI-2 expression also inhibits the apoptotic pathway activated by and TNFα. Deletion of SPI-2 leads to virus attenuation in vivo (observed in mice model after intranasal infection) but without any remarkable influence on the host immune response. That was one of the reasons this gene was targeted during search for more safe and efficient vaccine against smallpox. It was shown that immunization with vaccinia virus with deleted SPI-2 and 1 and coexpressing IFNγ leads to strong attenuation but without decreasing host immune response. Host reaction was comparable to that on MVA virus (modified ) which serves as a smallpox vaccine nowadays. The Copenhagen strain of vaccinia virus only has a truncated version of this protein. Vaccinia virus encodes two more serpin - SPI-1 and SPI-3. SPI-1 influences the host range and SPI-3 stops infected cells from fusing together. (en)
|
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
| is Wikipage redirect
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)