About: Cancer genome sequencing     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : dbo:BiologicalDatabase, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FCancer_genome_sequencing&invfp=IFP_OFF&sas=SAME_AS_OFF

Cancer genome sequencing is the whole genome sequencing of a single, homogeneous or heterogeneous group of cancer cells. It is a biochemical laboratory method for the characterization and identification of the DNA or RNA sequences of cancer cell(s). Similar to whole genome sequencing, the information generated from this technique include: identification of nucleotide bases (DNA or RNA), copy number and sequence variants, mutation status, and structural changes such as chromosomal translocations and fusion genes.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • سلسلة جينوم السرطان (ar)
  • Secuenciación del genoma del cáncer (es)
  • Cancer genome sequencing (en)
  • Секвенування ракового геному (uk)
rdfs:comment
  • سلسلة جينوم السرطان، هي السلسلة الجينومية الكاملة لمجموعة واحدة متجانسة أو غير متجانسة من الخلايا السرطانية، وأحد طرق توصيف تسلسل الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين أو الحمض النووي الريبوزي للخلايا السرطانية، وتمييزه في مخابر الكيمياء الحيوية. تعتمد هذه الطريقة على السلسلة المباشرة لأنسجة الورم الأولي أو الأنسجة الطبيعية المجاورة أو البعيدة أو خلايا البيئة الدقيقة للورم كالخلايا الليفية/ السدوية أو خلايا الورم النقيلي، على عكس مشاريع سلسلة الجينوم الكامل التي تستخدم عادةً خلايا الدم أو اللعاب أو الخلايا الظهارية أو العظمية، كمشاريع جيمس واتسون وكريغ فينتر. (ar)
  • Cancer genome sequencing is the whole genome sequencing of a single, homogeneous or heterogeneous group of cancer cells. It is a biochemical laboratory method for the characterization and identification of the DNA or RNA sequences of cancer cell(s). Similar to whole genome sequencing, the information generated from this technique include: identification of nucleotide bases (DNA or RNA), copy number and sequence variants, mutation status, and structural changes such as chromosomal translocations and fusion genes. (en)
  • La secuenciación del genoma del cáncer es la secuenciación del genoma completo de un grupo único, homogéneo o heterogéneo de células cancerosas. Es un método de laboratorio bioquímico para la caracterización e identificación de las secuencias de ADN o ARN de las células cancerosas Al igual que la secuenciación del genoma completo, la información generada por esta técnica incluye: la identificación de las bases nucleotídicas (ADN o ARN), el número de copias y las variantes de la secuencia, el estado de las mutaciones y los cambios estructurales, como las translocaciones cromosómicas y los . (es)
  • Секвенування ракового геному — це визначення послідовності нуклеотидів цілого геному або екзому однієї або групи злоякісно перероджених клітин. Більшість злоякісних пухлин людини виникають внаслідок серії від двох до восьми послідовних соматичних мутацій, що розвиваються впродовж 20—30 років, окрім цих «рушійних» змін кожна ракова клітина містить ще в середньому кілька десятків «баластних» мутацій. Ці зміни можна виявити для кожного пацієнта за допомогою секвенування геному ракових клітин. Отримані дані використовуються для підбору молекуляно-спрямованої терапії, визначення оптимальних доз і поєднань препаратів, а також для розробки нових специфічних ліків. Секвенування ракових геномів є невід'ємною складовою персоналізованої медицини для онкохворих. Також ці результати важливі для фундаме (uk)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/2nd_Generation_Sequencing.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/3rd_Generation_Sequencing.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Cancer_genome_sequencing_workflow.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
Link from a Wikipa... related subject.
has abstract
  • سلسلة جينوم السرطان، هي السلسلة الجينومية الكاملة لمجموعة واحدة متجانسة أو غير متجانسة من الخلايا السرطانية، وأحد طرق توصيف تسلسل الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين أو الحمض النووي الريبوزي للخلايا السرطانية، وتمييزه في مخابر الكيمياء الحيوية. تعتمد هذه الطريقة على السلسلة المباشرة لأنسجة الورم الأولي أو الأنسجة الطبيعية المجاورة أو البعيدة أو خلايا البيئة الدقيقة للورم كالخلايا الليفية/ السدوية أو خلايا الورم النقيلي، على عكس مشاريع سلسلة الجينوم الكامل التي تستخدم عادةً خلايا الدم أو اللعاب أو الخلايا الظهارية أو العظمية، كمشاريع جيمس واتسون وكريغ فينتر. على غرار سلسلة الجينوم الكامل، تشمل المعلومات الناتجة عن هذه الطريقة: معرفة قواعد النوكليوتيدات (سواء كان حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين أو حمض نووي ريبوزي) والأنواع المختلفة بأرقام النسخ والتسلسل ووضع الطفرات والتغييرات البنيوية، كما في الانتقال الكروموسومي وجينات الاندماج. لا تقتصر سلسلة الجينوم السرطاني على السلسلة الجينومية الكاملة، فقد تشمل أيضًا سلسلة الإكسوم والترنسكريبتوم والميكرونوم وتنميط التسلسل النهائي. يمكن استخدام هذه الطرق لتحديد مقدار التعبير الجيني والتعبير عن الحمض النووي الريبوزي الميكروي ومعرفة حالات الوصل البديلة بالإضافة إلى بيانات التسلسل. ظهر أول تقرير عن سلسلة الجينوم السرطاني في عام 2006. في هذه الدراسة، سلسل الباحثون 13023 جين في 11 حالة ورم ثدي و11 حالة ورم قولون ومستقيم. نشرت متابعة لاحقة في عام 2007، أضيف فيها إلى نفس المجموعة أكثر من 5000 جين جديد ونحو 8000 نسخة لإكمال إكسومات 11 ورم ثدي وقولون ومستقيم. في نوفمبر 2008، أنجزت دراسة لاي وآخرون أول سلسلة كاملة لجينوم سرطاني لحالة ابيضاض نقوي حاد طبيعي من ناحية الوراثيات الخلوية. وفي أكتوبر 2009، أتمت دراسة شاه وآخرون سلسلة أول ورم ثدي. وأنجزت دراسة بليزنس وآخرون سلسلة أول ورم رئة وجلد في يناير 2010، بينما أتمت دراسة بيرجر وآخرون أول ورم بروستاتا في فبراير 2011. (ar)
  • Cancer genome sequencing is the whole genome sequencing of a single, homogeneous or heterogeneous group of cancer cells. It is a biochemical laboratory method for the characterization and identification of the DNA or RNA sequences of cancer cell(s). Unlike whole genome (WG) sequencing which is typically from blood cells, such as J. Craig Venter's and James D. Watson’s WG sequencing projects, saliva, epithelial cells or bone - cancer genome sequencing involves direct sequencing of primary tumor tissue, adjacent or distal normal tissue, the tumor micro environment such as fibroblast/stromal cells, or metastatic tumor sites. Similar to whole genome sequencing, the information generated from this technique include: identification of nucleotide bases (DNA or RNA), copy number and sequence variants, mutation status, and structural changes such as chromosomal translocations and fusion genes. Cancer genome sequencing is not limited to WG sequencing and can also include exome, transcriptome, micronome sequencing, and end-sequence profiling. These methods can be used to quantify gene expression, miRNA expression, and identify alternative splicing events in addition to sequence data. The first report of cancer genome sequencing appeared in 2006. In this study 13,023 genes were sequenced in 11 breast and 11 colorectal tumors. A subsequent follow up was published in 2007 where the same group added just over 5,000 more genes and almost 8,000 transcript species to complete the exomes of 11 breast and colorectal tumors. The first whole cancer genome to be sequenced was from cytogenetically normal acute myeloid leukaemia by Ley et al. in November 2008. The first breast cancer tumor was sequenced by Shah et al. in October 2009, the first lung and skin tumors by Pleasance et al. in January 2010, and the first prostate tumors by Berger et al. in February 2011. (en)
  • La secuenciación del genoma del cáncer es la secuenciación del genoma completo de un grupo único, homogéneo o heterogéneo de células cancerosas. Es un método de laboratorio bioquímico para la caracterización e identificación de las secuencias de ADN o ARN de las células cancerosas A diferencia de la secuenciación del genoma completo (WGS siglas en inglés de Whole Genome Sequencing), que suele realizarse a partir de células sanguíneas, como en los proyectos de secuenciación del WGS de J. Craig Venter​ y James D. Watson,​ de la saliva, de las células epiteliales o de los huesos, la secuenciación del genoma del cáncer implica la secuenciación directa del tejido tumoral primario, del tejido normal adyacente o distal, del microentorno tumoral, como los fibroblastos/células estromales, o de las zonas tumorales metastásicas. Al igual que la secuenciación del genoma completo, la información generada por esta técnica incluye: la identificación de las bases nucleotídicas (ADN o ARN), el número de copias y las variantes de la secuencia, el estado de las mutaciones y los cambios estructurales, como las translocaciones cromosómicas y los . La secuenciación del genoma del cáncer no se limita a la secuenciación WGS y también puede incluir la secuenciación del exoma, el transcriptoma, el micrónoma y el . Estos métodos se pueden utilizar para cuantificar la expresión génica, la expresión de miARN y para identificar eventos de corte y empalme alternativos además de los datos de secuencia. El primer informe sobre la secuenciación del genoma del cáncer apareció en 2006. En este estudio se secuenciaron 13.023 genes en 11 tumores de mama y 11 tumores colorrectales.​ En 2007 se publicó un seguimiento posterior en el que el mismo grupo añadió algo más de 5.000 genes más y casi 8.000 especies de transcripción para completar los exomas de 11 tumores de mama y colorrectales.​ El primer genoma completo del cáncer que se secuenció fue el de una leucemia mieloide aguda citogenéticamente normal, realizado por Ley et al. en noviembre de 2008. ​ El primer tumor de cáncer de mama fue secuenciado por Shah et al. en octubre de 2009,​ los primeros tumores de pulmón y piel por Pleasance et al. en enero de 2010,​​ y los primeros tumores de próstata por Berger et al. en febrero de 2011.​ (es)
  • Секвенування ракового геному — це визначення послідовності нуклеотидів цілого геному або екзому однієї або групи злоякісно перероджених клітин. Більшість злоякісних пухлин людини виникають внаслідок серії від двох до восьми послідовних соматичних мутацій, що розвиваються впродовж 20—30 років, окрім цих «рушійних» змін кожна ракова клітина містить ще в середньому кілька десятків «баластних» мутацій. Ці зміни можна виявити для кожного пацієнта за допомогою секвенування геному ракових клітин. Отримані дані використовуються для підбору молекуляно-спрямованої терапії, визначення оптимальних доз і поєднань препаратів, а також для розробки нових специфічних ліків. Секвенування ракових геномів є невід'ємною складовою персоналізованої медицини для онкохворих. Також ці результати важливі для фундаментальних досліджень, зокрема відкриття рушійних мутацій, виявлення «підписів» соматичних мутацій і характеризації клональної еволюції ракових клітин. Вперше раковий геном був секвенований 2008 року із застосування секвенування другого покоління, за наступні 4 роки були отримані повні нуклеотидні послідовності близько 800 геномів злоякісних пухлин принаймні 25 різних типів. (uk)
gold:hypernym
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is Wikipage redirect of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software