About: GLIMMER     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : wikidata:Q7397, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/c/4EaqTxCCSa

In bioinformatics, GLIMMER (Gene Locator and Interpolated Markov ModelER) is used to find genes in prokaryotic DNA. "It is effective at finding genes in bacteria, archea, viruses, typically finding 98-99% of all relatively long protein coding genes". GLIMMER was the first system that used the interpolated Markov model to identify coding regions. The GLIMMER software is open source and is maintained by Steven Salzberg, Art Delcher, and their colleagues at the Center for Computational Biology at Johns Hopkins University. The original GLIMMER algorithms and software were designed by Art Delcher, Simon Kasif and Steven Salzberg and applied to bacterial genome annotation in collaboration with Owen White.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • جليمير (ar)
  • GLIMMER (en)
rdfs:comment
  • في المعلوماتية الحيوية، جليمير (بالإنجليزية: GLIMMER)‏ هو محدد للجينات ومحرف ماركوف يستخدم ل البحث عن الجينات في خلايا بدائية النواة الحمض النووي. «إنه فعال في العثور على الجينات في البكتيريا، آرتشيا، الفيروسات، عادة ما تجد 98-99% من جميع طويلة نسبيا جينات ترميز البروتين». كان جليمير النظام الأول الذي استخدم محرف نموذج ماركوف لتحديد مناطق الترميز. برنامج جليمير مفتوح المصدر ويحتفظ بها ستيفن سالزبيرغ، ديلشر الفن، وزملائهم في مركز البيولوجيا الحاسوبية في جامعة جونز هوبكنز. وقد تم تصميم خوارزميات جليميرالأصلي والبرمجيات من قبل الفن ديلشر، سيمون كاسيف وستيفن سالزبرغ وتطبيقها على الشرح الجينوم البكتيرية بالتعاون مع أوين وايت. (ar)
  • In bioinformatics, GLIMMER (Gene Locator and Interpolated Markov ModelER) is used to find genes in prokaryotic DNA. "It is effective at finding genes in bacteria, archea, viruses, typically finding 98-99% of all relatively long protein coding genes". GLIMMER was the first system that used the interpolated Markov model to identify coding regions. The GLIMMER software is open source and is maintained by Steven Salzberg, Art Delcher, and their colleagues at the Center for Computational Biology at Johns Hopkins University. The original GLIMMER algorithms and software were designed by Art Delcher, Simon Kasif and Steven Salzberg and applied to bacterial genome annotation in collaboration with Owen White. (en)
foaf:name
  • GLIMMER (en)
foaf:homepage
name
  • GLIMMER (en)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Case2.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Case3.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Case4.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Case_1.png
dct:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
developer
  • Steven Salzberg & Arthur Delcher (en)
genre
  • Bioinformatics tool (en)
language
  • C++ (en)
latest release date
latest release version
license
  • OSI Certified Open Source Software under the Artistic License (en)
website
has abstract
  • في المعلوماتية الحيوية، جليمير (بالإنجليزية: GLIMMER)‏ هو محدد للجينات ومحرف ماركوف يستخدم ل البحث عن الجينات في خلايا بدائية النواة الحمض النووي. «إنه فعال في العثور على الجينات في البكتيريا، آرتشيا، الفيروسات، عادة ما تجد 98-99% من جميع طويلة نسبيا جينات ترميز البروتين». كان جليمير النظام الأول الذي استخدم محرف نموذج ماركوف لتحديد مناطق الترميز. برنامج جليمير مفتوح المصدر ويحتفظ بها ستيفن سالزبيرغ، ديلشر الفن، وزملائهم في مركز البيولوجيا الحاسوبية في جامعة جونز هوبكنز. وقد تم تصميم خوارزميات جليميرالأصلي والبرمجيات من قبل الفن ديلشر، سيمون كاسيف وستيفن سالزبرغ وتطبيقها على الشرح الجينوم البكتيرية بالتعاون مع أوين وايت. (ar)
  • In bioinformatics, GLIMMER (Gene Locator and Interpolated Markov ModelER) is used to find genes in prokaryotic DNA. "It is effective at finding genes in bacteria, archea, viruses, typically finding 98-99% of all relatively long protein coding genes". GLIMMER was the first system that used the interpolated Markov model to identify coding regions. The GLIMMER software is open source and is maintained by Steven Salzberg, Art Delcher, and their colleagues at the Center for Computational Biology at Johns Hopkins University. The original GLIMMER algorithms and software were designed by Art Delcher, Simon Kasif and Steven Salzberg and applied to bacterial genome annotation in collaboration with Owen White. (en)
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
latest release date
latest release version
  • 3.02
genre
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is Wikipage redirect of
Faceted Search & Find service v1.17_git147 as of Sep 06 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3332 as of Dec 5 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 49 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software