Local elevation is a technique used in computational chemistry or physics, mainly in the field of molecular simulation (including molecular dynamics (MD) and Monte Carlo (MC) simulations). It was developed in 1994 by Huber, Torda and van Gunsterento enhance the searching of conformational space in molecular dynamics simulations and is available in the GROMOS software for molecular dynamics simulation (since GROMOS96). The method was, together with the conformational flooding method, the first to introduce memory dependence into molecular simulations. Many recent methods build on the principles of the local elevation technique, including the Engkvist-Karlström, adaptive biasing force, Wang–Landau, metadynamics, adaptively biased molecular dynamics, adaptive reaction coordinate forces, and
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| - Local elevation (en)
- 局所上昇法 (ja)
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| - 局所上昇法（きょくしょじょうしょうほう、英語: Local Elevation）は、計算化学や計算物理学において主に分子シミュレーション（分子動力学法 (MD) およびモンテカルロ法 (MC) など）に用いられる手法である。1994年に分子動力学法において配座空間上における探索を加速するために Huber, Torda, van Gunsteren により開発され、分子動力学シミュレーション用ソフトウェアGROMOS96以降で利用可能である。この手法は、配座フラッディング法と共に、分子シミュレーションに履歴依存性を導入した初めての例である。Engkvist–Karlström法、適応バイアス力法、ワン・ランダウ法、メタダイナミクス法、適応バイアス分子動力学法、適応反応座標力法、局所上昇アンブレラサンプリング法などの多くの新規手法が同様の原理に基いて開発された。この手法の基礎原理は、シミュレーション中に履歴に依存するポテンシャルエネルギー項を導入し、既にサンプリング済みの配座の再実現を阻害することで新しい配座の発見確率を上げるというものである。この手法はタブーサーチ法の連続版と見做すことができる。 (ja)
- Local elevation is a technique used in computational chemistry or physics, mainly in the field of molecular simulation (including molecular dynamics (MD) and Monte Carlo (MC) simulations). It was developed in 1994 by Huber, Torda and van Gunsterento enhance the searching of conformational space in molecular dynamics simulations and is available in the GROMOS software for molecular dynamics simulation (since GROMOS96). The method was, together with the conformational flooding method, the first to introduce memory dependence into molecular simulations. Many recent methods build on the principles of the local elevation technique, including the Engkvist-Karlström, adaptive biasing force, Wang–Landau, metadynamics, adaptively biased molecular dynamics, adaptive reaction coordinate forces, and (en)
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| - Local elevation is a technique used in computational chemistry or physics, mainly in the field of molecular simulation (including molecular dynamics (MD) and Monte Carlo (MC) simulations). It was developed in 1994 by Huber, Torda and van Gunsterento enhance the searching of conformational space in molecular dynamics simulations and is available in the GROMOS software for molecular dynamics simulation (since GROMOS96). The method was, together with the conformational flooding method, the first to introduce memory dependence into molecular simulations. Many recent methods build on the principles of the local elevation technique, including the Engkvist-Karlström, adaptive biasing force, Wang–Landau, metadynamics, adaptively biased molecular dynamics, adaptive reaction coordinate forces, and local elevation umbrella samplingmethods.The basic principle of the method is to add a memory-dependent potential energy term in the simulation so as to prevent the simulation to revisit already sampled configurations, which leads to the increased probability of discovering new configurations. The method can be seen as a continuous variant of the Tabu search method. (en)
- 局所上昇法（きょくしょじょうしょうほう、英語: Local Elevation）は、計算化学や計算物理学において主に分子シミュレーション（分子動力学法 (MD) およびモンテカルロ法 (MC) など）に用いられる手法である。1994年に分子動力学法において配座空間上における探索を加速するために Huber, Torda, van Gunsteren により開発され、分子動力学シミュレーション用ソフトウェアGROMOS96以降で利用可能である。この手法は、配座フラッディング法と共に、分子シミュレーションに履歴依存性を導入した初めての例である。Engkvist–Karlström法、適応バイアス力法、ワン・ランダウ法、メタダイナミクス法、適応バイアス分子動力学法、適応反応座標力法、局所上昇アンブレラサンプリング法などの多くの新規手法が同様の原理に基いて開発された。この手法の基礎原理は、シミュレーション中に履歴に依存するポテンシャルエネルギー項を導入し、既にサンプリング済みの配座の再実現を阻害することで新しい配座の発見確率を上げるというものである。この手法はタブーサーチ法の連続版と見做すことができる。 (ja)
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