The Non-Covalent Interactions index, commonly referred to as simply Non-Covalent Interactions (NCI) is a visualization index based in the Electron density (ρ) and the reduced density gradient (s). It is based on the empirical observation that Non-covalent interactions can be associated with the regions of small reduced density gradient at low electronic densities. In quantum chemistry, the non-covalent interactions index is used to visualize non-covalent interactions in three-dimensional space. in which kF is the Fermi momentum of the free electron gas.
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| - Índice de interacciones no covalentes (es)
- Non-covalent interactions index (en)
- 非共價作用力指數 (zh)
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| - 非共價作用力指數一般來說是根據(ρ)以及簡化密度梯度 (s)來使非共價作用力(NCI)具體化的數值。由實證研究得知非共價作用力在低電子密度下與低簡化密度梯度區域相關聯。量子化學中，非共價作用力指數在三維空間下可以被用來具體化非共價交互作用。 其具體化是藉由不同著色深淺度(強度)來表現簡化密度梯度的等值曲面。其深淺度通常透過電子密度以及各個在等值曲面其電子密度的第二特徵值 (λH) 來量測，吸引或是排斥的特性則由λH的正負號決定。因此可以直接在三維空間中展現非共價作用力以及其特性，如氫鍵和空間位阻。基於電子密度和導出的純量場，非共價作用力指數不會因的轉化而改變。此外，一系統的電子密度可以藉由實驗以及理論波函數計算來推算。 簡化密度梯度 (s)為一電子密度的純量場(ρ)，其可表示如下: 在密度泛函理論框架中，簡化密度梯度起源於廣義密度梯度近似(GGA)的交換泛函，最初的定義為: kF 在此表示的。 (zh)
- El Índice de Interacciones no covalentes o más comúnmente referido por sus siglas del inglés: NCI (Non-Covalent Interactions) es un índice de visualización basado en el cálculo de la densidad electrónica (ρ) y sus correspondientes derivadas a través del gradiente de la densidad reducida (s). Se basa en la observación empírica de que las interacciones no covalentes pueden asociarse a las regiones de menor gradiente de densidad reducida a bajas densidades electrónicas. En el campo de la química cuántica, el índice de interacciones no covalentes se utiliza para visualizar este tipo de interacciones en un espacio tridimensional. (es)
- The Non-Covalent Interactions index, commonly referred to as simply Non-Covalent Interactions (NCI) is a visualization index based in the Electron density (ρ) and the reduced density gradient (s). It is based on the empirical observation that Non-covalent interactions can be associated with the regions of small reduced density gradient at low electronic densities. In quantum chemistry, the non-covalent interactions index is used to visualize non-covalent interactions in three-dimensional space. in which kF is the Fermi momentum of the free electron gas. (en)
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| - El Índice de Interacciones no covalentes o más comúnmente referido por sus siglas del inglés: NCI (Non-Covalent Interactions) es un índice de visualización basado en el cálculo de la densidad electrónica (ρ) y sus correspondientes derivadas a través del gradiente de la densidad reducida (s). Se basa en la observación empírica de que las interacciones no covalentes pueden asociarse a las regiones de menor gradiente de densidad reducida a bajas densidades electrónicas. En el campo de la química cuántica, el índice de interacciones no covalentes se utiliza para visualizar este tipo de interacciones en un espacio tridimensional. Dicha representación visual se forma a través de la isosuperficie del gradiente de densidad reducida coloreado siguiendo una determinada escala de fuerza. Esta fuerza se calcula generalmente a través del producto de la densidad de electrones y el segundo autovalor λH del hessiano de la densidad de electrones para cada punto de la isosuperficie. El carácter atractivo o repulsivo vendrá determinado por el signo de λH. Esto permitirá una representación directa y la caractarecización de las interacciones no covalentes en el espacio tridimensional, incluyendo enlaces de hidrógeno y colisiones estéricas.Basándose en la densidad de electrones y en los campos escalares derivados, los índices del NCI son invariables con respecto a la modificación de los orbitales moleculares. Además, la densidad electrónica de un sistema puede calcularse mediante experimentos de difracción de rayos X y cálculos teóricos de la función de onda. El gradiente de densidad reducida (s) es un campo escalar de la densidad electrónica (ρ) y puede definirse como: Dentro del marco de trabajo de la teoría del funcional de la densidad (DFT) el gradiente de la densidad reducida surge de la definición de la Aproximación Generalizada del Gradiente del funcional de intercambio. Su definición original es: en donde kF es el momento de Fermi del 'gas de electrones libres'(Jellium). (es)
- The Non-Covalent Interactions index, commonly referred to as simply Non-Covalent Interactions (NCI) is a visualization index based in the Electron density (ρ) and the reduced density gradient (s). It is based on the empirical observation that Non-covalent interactions can be associated with the regions of small reduced density gradient at low electronic densities. In quantum chemistry, the non-covalent interactions index is used to visualize non-covalent interactions in three-dimensional space. Its visual representation arises from the isosurfaces of the reduced density gradient colored by a scale of strength. The strength is usually estimated through the product of the electron density and the second eigenvalue (λH) of the Hessian of the electron density in each point of the isosurface, with the attractive or repulsive character being determined by the sign of λH. This allows for a direct representation and characterization of non-covalent interactions in three-dimensional space, including hydrogen bonds and steric clashes. Being based on the electron density and derived scalar fields, NCI indexes are invariant with respect to the transformation of molecular orbitals. Furthermore, the electron density of a system can be calculated both by X-ray diffraction experiments and theoretical wavefunction calculations. The reduced density gradient (s) is a scalar field of the electron density (ρ) that can be defined as Within the Density Functional Theory framework the reduced density gradient arises in the definition of the Generalized Gradient Approximation of the exchange functional. The original definition is in which kF is the Fermi momentum of the free electron gas. The NCI was developed by Canadian computational chemist Erin Johnson while she was a postdoctoral fellow at Duke University in the group of Weitao Yang. (en)
- 非共價作用力指數一般來說是根據(ρ)以及簡化密度梯度 (s)來使非共價作用力(NCI)具體化的數值。由實證研究得知非共價作用力在低電子密度下與低簡化密度梯度區域相關聯。量子化學中，非共價作用力指數在三維空間下可以被用來具體化非共價交互作用。 其具體化是藉由不同著色深淺度(強度)來表現簡化密度梯度的等值曲面。其深淺度通常透過電子密度以及各個在等值曲面其電子密度的第二特徵值 (λH) 來量測，吸引或是排斥的特性則由λH的正負號決定。因此可以直接在三維空間中展現非共價作用力以及其特性，如氫鍵和空間位阻。基於電子密度和導出的純量場，非共價作用力指數不會因的轉化而改變。此外，一系統的電子密度可以藉由實驗以及理論波函數計算來推算。 簡化密度梯度 (s)為一電子密度的純量場(ρ)，其可表示如下: 在密度泛函理論框架中，簡化密度梯度起源於廣義密度梯度近似(GGA)的交換泛函，最初的定義為: kF 在此表示的。 (zh)
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