About: Orsay virus     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : dbo:Disease, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FOrsay_virus&invfp=IFP_OFF&sas=SAME_AS_OFF

Orsay virus is a positive-sense single-stranded RNA virus that infects Caenorhabditis elegans nematode. It resembles nodaviruses (family Nodaviridae), but has yet to be formally classified. Orsay virus has a (+)ssRNA genome consisting of two segments, termed RNA1 and RNA2. The RNA1 segment encodes an RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) of 982 amino acids. The RNA2 segment has two open reading frames (ORFs) that code for a capsid protein and a non-structural protein with unknown function. The virus is composed of two structural domains, a shell (S) and a protrusion (P) domain.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Virus d'Orsay (fr)
  • Orsay virus (en)
  • Orsayvirus (nl)
rdfs:comment
  • Le virus d'Orsay est un virus à ARN qui infecte le ver rond Caenorhabditis elegans. Ce virus doit son nom à la ville d'Orsay, en France où on l'a découvert. Ce virus ressemble à un , mais nécessite d'être classifié formellement pour rejoindre ce genre. (fr)
  • Orsay virus is a positive-sense single-stranded RNA virus that infects Caenorhabditis elegans nematode. It resembles nodaviruses (family Nodaviridae), but has yet to be formally classified. Orsay virus has a (+)ssRNA genome consisting of two segments, termed RNA1 and RNA2. The RNA1 segment encodes an RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) of 982 amino acids. The RNA2 segment has two open reading frames (ORFs) that code for a capsid protein and a non-structural protein with unknown function. The virus is composed of two structural domains, a shell (S) and a protrusion (P) domain. (en)
  • Het orsayvirus is een RNA virus dat Caenorhabditis elegans rondwormen kan infecteren. Het is verwant aan nodavirussen, maar moet nog formeel geclassificeerd worden. Het orsayvirus heeft een (+)ssRNA genoom dat bestaat uit twee RNA moleculen, RNA1 en RNA2. Het RNA1-molecuul codeert voor een RNA-afhankelijke RNA polymerase (RdRP) van 982 aminozuren lang. Het RNA2 molecuul heeft twee open leesramen (ORFs) die coderen voor een manteleiwit en voor een eiwit met een nog onbekende functie. (nl)
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
virus
  • Orsay virus (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate
parent
  • Nodaviridae (en)
has abstract
  • Le virus d'Orsay est un virus à ARN qui infecte le ver rond Caenorhabditis elegans. Ce virus doit son nom à la ville d'Orsay, en France où on l'a découvert. Ce virus ressemble à un , mais nécessite d'être classifié formellement pour rejoindre ce genre. (fr)
  • Orsay virus is a positive-sense single-stranded RNA virus that infects Caenorhabditis elegans nematode. It resembles nodaviruses (family Nodaviridae), but has yet to be formally classified. Orsay virus has a (+)ssRNA genome consisting of two segments, termed RNA1 and RNA2. The RNA1 segment encodes an RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) of 982 amino acids. The RNA2 segment has two open reading frames (ORFs) that code for a capsid protein and a non-structural protein with unknown function. The virus is composed of two structural domains, a shell (S) and a protrusion (P) domain. Orsay virus was discovered in 2011 in Caenorhabditis elegans nematodes in rotting fruit in Orsay, France. Just before the time of the discovery, standardized methods were developed for the wild isolation of nematodes. Using these methods, Caenorhabditis briggsae and C. elegans nematodes were found that displayed abnormalities in the intestines, such as extensive convolutions of the apical intestinal border. The lysate of infected nematodes was added to healthy nematodes, which led to infection. Since for the lysate a filter was used that only allows virus particles to penetrate, this suggested that a virus was the cause of the intestinal abnormalities. Electron microscopy showing viral particles confirmed the role of a virus. On infection of a susceptible nematode, the viral particles are mainly localized to intestinal cells. The small structure of Orsay virus, its resemblance to the well-studied nodaviruses and its tropism to intestinal cells of C. elegans, together with its lack of infectivity for humans, make Orsay virus a useful virus for studying host–virus interactions. (en)
  • Het orsayvirus is een RNA virus dat Caenorhabditis elegans rondwormen kan infecteren. Het is verwant aan nodavirussen, maar moet nog formeel geclassificeerd worden. Het orsayvirus heeft een (+)ssRNA genoom dat bestaat uit twee RNA moleculen, RNA1 en RNA2. Het RNA1-molecuul codeert voor een RNA-afhankelijke RNA polymerase (RdRP) van 982 aminozuren lang. Het RNA2 molecuul heeft twee open leesramen (ORFs) die coderen voor een manteleiwit en voor een eiwit met een nog onbekende functie. Het Orsay virus werd ontdekt in 2011 in Caenorhabditis elegans rondwormen in rottend fruit in Orsay, Frankrijk. Rond de tijd van de ontdekking waren methoden ontwikkeld die het isoleren van nematoden uit de natuur mogelijk maakten. Met gebruikmaking van deze methoden werden Caenorhabditis briggsae en C. elegans rondwormen gevonden die darmafwijkingen vertoonden, zoals overmatige windingen van de darmwand. Om aan te tonen dat een virus de oorzaak was van deze darmafwijkingen, werd het lysaat van geïnfecteerde rondwormen toegevoegd aan gezonde rondwormen, wat leidde tot infectie. Omdat voor het lysaat een filter was gebruikt dat alleen virusdeeltjes doorlaat, moest de infectie wel door een virus komen. Dit werd nog eens bevestigd door elektronenmicroscopie, die virusdeeltjes liet zien. Bij infectie van een rondworm hopen de virusdeeltjes zich op in darmcellen. Samen met deze eigenschap maken de kleine structuur van het Orsay virus, zijn gelijkenis met de goed gekarakteriseerde nodavirussen, en zijn onschadelijkheid voor mensen het virus tot een handig virus voor experimenteel onderzoek. (nl)
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is foaf:primaryTopic of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 67 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software