Polony sequencing is an inexpensive but highly accurate multiplex sequencing technique that can be used to “read” millions of immobilized DNA sequences in parallel. This technique was first developed by Dr. George Church's group at Harvard Medical School. Unlike other sequencing techniques, Polony sequencing technology is an open platform with freely downloadable, open source software and protocols. Also, the hardware of this technique can be easily set up with a commonly available epifluorescence microscopy and a computer-controlled flowcell/fluidics system. Polony sequencing is generally performed on paired-end tags library that each molecule of DNA template is of 135 bp in length with two 17–18 bp paired genomic tags separated and flanked by common sequences. The current read length of
| Attributes | Values |
|---|
| rdfs:label
| - Polony sequencing (en)
- Полони-секвенирование (ru)
|
| rdfs:comment
| - Polony sequencing is an inexpensive but highly accurate multiplex sequencing technique that can be used to “read” millions of immobilized DNA sequences in parallel. This technique was first developed by Dr. George Church's group at Harvard Medical School. Unlike other sequencing techniques, Polony sequencing technology is an open platform with freely downloadable, open source software and protocols. Also, the hardware of this technique can be easily set up with a commonly available epifluorescence microscopy and a computer-controlled flowcell/fluidics system. Polony sequencing is generally performed on paired-end tags library that each molecule of DNA template is of 135 bp in length with two 17–18 bp paired genomic tags separated and flanked by common sequences. The current read length of (en)
- Полони-секвенирование (англ. polymerase colony — «полимеразная колония») — технология секвенирования нового поколения (NGS) без электрофоретического разделения, позволяющая прочитывать миллионы коротких иммобилизованных последовательностей ДНК, значительно более дешевая по сравнению с секвенированием по Сэнгеру. (ru)
|
| foaf:depiction
| |
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| Link from a Wikipage to an external page
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| thumbnail
| |
| has abstract
| - Polony sequencing is an inexpensive but highly accurate multiplex sequencing technique that can be used to “read” millions of immobilized DNA sequences in parallel. This technique was first developed by Dr. George Church's group at Harvard Medical School. Unlike other sequencing techniques, Polony sequencing technology is an open platform with freely downloadable, open source software and protocols. Also, the hardware of this technique can be easily set up with a commonly available epifluorescence microscopy and a computer-controlled flowcell/fluidics system. Polony sequencing is generally performed on paired-end tags library that each molecule of DNA template is of 135 bp in length with two 17–18 bp paired genomic tags separated and flanked by common sequences. The current read length of this technique is 26 bases per amplicon and 13 bases per tag, leaving a gap of 4–5 bases in each tag. (en)
- Полони-секвенирование (англ. polymerase colony — «полимеразная колония») — технология секвенирования нового поколения (NGS) без электрофоретического разделения, позволяющая прочитывать миллионы коротких иммобилизованных последовательностей ДНК, значительно более дешевая по сравнению с секвенированием по Сэнгеру. Технология была разработана в лаборатории доктора Джорджа Черча в Гарварде (Гарвардская медицинская школа). По сравнению с другими методиками секвенирования — полони-секвенирование проводится на платформе с открытым исходным кодом и протоколами. Аппаратная платформа данного метода может быть легко комбинирована с широкодоступной и микрофлюидными системами под управлением компьютера. Основная идея метода — генерация большого числа уникальных 'полоний' (молекулярных колоний, сгенерированных полимеразой), которые секвенируются в случайном порядке. Полони-секвенирование проводится для библиотеки парных концевых тэгов: каждая молекула ДНК имеет длину 135 п.о. (пар оснований), содержит два тэга длиной 17-18 п.о., разделённых и фланкированных общей последовательностью. Текущая длина прочтения для этой методики составляет 26 п.о. для ампликона и 13 п.о. для тэга (на каждом тэге остается непрочитанный зазор 4-5 п.о.). (ru)
|
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
| is Wikipage redirect
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)
