A slippery sequence is a small section of codon nucleotide sequences (usually UUUAAAC) that controls the rate and chance of ribosomal frameshifting. A slippery sequence causes a faster ribosomal transfer which in turn can cause the reading ribosome to "slip." This allows a tRNA to shift by 1 base (−1) after it has paired with its anticodon, changing the reading frame. A −1 frameshift triggered by such a sequence is a Programmed −1 Ribosomal Frameshift. It is followed by a spacer region, and an RNA secondary structure. Such sequences are common in virus polyproteins.
Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
rdfs:label
| - تسلسل زلق (ar)
- Séquence glissante (fr)
- Sequência escorregadia (pt)
- Slippery sequence (en)
- Слизька послідовність (uk)
|
rdfs:comment
| - En biologie moléculaire et en génétique, une séquence glissante est une courte section d'ARN messager dont la séquence nucléotidique, généralement UUUAAAC, induit une accélération de la vitesse de lecture de l'ARN messager par le ribosome, conduisant ce dernier à « sauter » un nucléotide et à poursuivre la traduction de l'ARN messager avec un décalage +1 du cadre de lecture. (fr)
- Em biologia molecular e genética, uma sequência escorregadia é uma curta secção do ARN mensageiro, cuja sequência de nucleótidos, geralmente UUUAAAC, induz a uma aceleração da velocidade de leitura do ARN mensageiro pelo ribossoma, levando este último a "saltar" um nucleótido e continuar a tradução do ARN mensageiro com uma +1 do . (pt)
- التسلسل الزلق (بالإنجليزية: Slippery sequence) هو تسلسل قصير (عادة UUUAAAC) يتحكم في معدل واحتمال حدوث انزياح الإطار الريبوسومي. يتسبب التسلسل الزلق في انتقالٍ ريبوسوميٍ أسرع والذي يمكن أن يسبب بدوره «انزلاقا» لإطار القراءة الذي يقوم الريبوسوم بقراءته. يسمح هذا للرنا الناقل بالانزياح بقاعدة واحدة (-1) نحو النهاية 5' بعد أن يكون الكودون المضاد الخاص به قد ارتبط مع كودونٍ من الرنا الرسول وهو ما يغير إطار القراءة. يُعرف انزياح الإطار -1 الذي يسببه هذا التسلسل بانزياح الإطار الريبوسومي -1 المبرمج. يلي هذا التسلسل الزلق منطقة فاصلة وبنية رنا ثانوية وتواجده شائع لدى الفيروسات التي تشفر عديدات البروتين. (ar)
- A slippery sequence is a small section of codon nucleotide sequences (usually UUUAAAC) that controls the rate and chance of ribosomal frameshifting. A slippery sequence causes a faster ribosomal transfer which in turn can cause the reading ribosome to "slip." This allows a tRNA to shift by 1 base (−1) after it has paired with its anticodon, changing the reading frame. A −1 frameshift triggered by such a sequence is a Programmed −1 Ribosomal Frameshift. It is followed by a spacer region, and an RNA secondary structure. Such sequences are common in virus polyproteins. (en)
- Слизька́ послідо́вність (англ. slippery sequence) — це невелика частина кодонної нуклеотидної послідовності (зазвичай УУУАААС), яка контролює швидкість і шанс рибосомального зсуву рамки зчитування. Слизька послідовність спричиняє швидше рибосомальне пересування, що, у свою чергу, може спричинити «ковзання» зчитування рибосоми. Це дозволяє тРНК зсуватися на 1 основу (-1) після того, як вона спарується зі своїм антикодоном, змінюючи рамку зчитування. −1 зсув рамки зчитування, запущений такою послідовністю, є запрограмованим рибосомальним зсувом рамки зчитування. За ним йде спейсерна область та вторинна структура РНК. Такі послідовності поширені у вірусних . (uk)
|
name
| - Coronavirus frameshifting stimulation element (en)
|
foaf:depiction
| |
dcterms:subject
| |
Wikipage page ID
| |
Wikipage revision ID
| |
Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
Link from a Wikipage to an external page
| |
sameAs
| |
dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
thumbnail
| |
id
| |
has abstract
| - التسلسل الزلق (بالإنجليزية: Slippery sequence) هو تسلسل قصير (عادة UUUAAAC) يتحكم في معدل واحتمال حدوث انزياح الإطار الريبوسومي. يتسبب التسلسل الزلق في انتقالٍ ريبوسوميٍ أسرع والذي يمكن أن يسبب بدوره «انزلاقا» لإطار القراءة الذي يقوم الريبوسوم بقراءته. يسمح هذا للرنا الناقل بالانزياح بقاعدة واحدة (-1) نحو النهاية 5' بعد أن يكون الكودون المضاد الخاص به قد ارتبط مع كودونٍ من الرنا الرسول وهو ما يغير إطار القراءة. يُعرف انزياح الإطار -1 الذي يسببه هذا التسلسل بانزياح الإطار الريبوسومي -1 المبرمج. يلي هذا التسلسل الزلق منطقة فاصلة وبنية رنا ثانوية وتواجده شائع لدى الفيروسات التي تشفر عديدات البروتين. يحدث انزياح الإطار بسبب ترابط ووبل. تعطي طاقة غيبس الحرة الخاصة بالبنى الثانوية التي تلي التسلسل تلميحا وفكرة عن معدل حدوث انزياح الإطار. يلعب التوتر الحاصل في جزيء الرنا الرسول دورا في الانزياح كذلك. قائمة بالتسلسلات الزلقة الموجودة لدى الحيوانات متوفرة في ورقة هوانغ وزملائه. التسلسلات الزلقة التي تسبب انزياحا بـ -2 قاعدة (انزياح إطار -2) تم إنشاؤها اعتمادا على تسلسل فيروس عوز المناعة البشري UUUUUUA . (ar)
- En biologie moléculaire et en génétique, une séquence glissante est une courte section d'ARN messager dont la séquence nucléotidique, généralement UUUAAAC, induit une accélération de la vitesse de lecture de l'ARN messager par le ribosome, conduisant ce dernier à « sauter » un nucléotide et à poursuivre la traduction de l'ARN messager avec un décalage +1 du cadre de lecture. (fr)
- A slippery sequence is a small section of codon nucleotide sequences (usually UUUAAAC) that controls the rate and chance of ribosomal frameshifting. A slippery sequence causes a faster ribosomal transfer which in turn can cause the reading ribosome to "slip." This allows a tRNA to shift by 1 base (−1) after it has paired with its anticodon, changing the reading frame. A −1 frameshift triggered by such a sequence is a Programmed −1 Ribosomal Frameshift. It is followed by a spacer region, and an RNA secondary structure. Such sequences are common in virus polyproteins. The frameshift occurs due to wobble pairing. The Gibbs free energy of secondary structures downstream give a hint at how often frameshift happens. Tension on the mRNA molecule also plays a role. A list of slippery sequences found in animal viruses is available from Huang et al. Slippery sequences that cause a 2-base slip (−2 frameshift) have been constructed out of the HIV UUUUUUA sequence. (en)
- Em biologia molecular e genética, uma sequência escorregadia é uma curta secção do ARN mensageiro, cuja sequência de nucleótidos, geralmente UUUAAAC, induz a uma aceleração da velocidade de leitura do ARN mensageiro pelo ribossoma, levando este último a "saltar" um nucleótido e continuar a tradução do ARN mensageiro com uma +1 do . (pt)
- Слизька́ послідо́вність (англ. slippery sequence) — це невелика частина кодонної нуклеотидної послідовності (зазвичай УУУАААС), яка контролює швидкість і шанс рибосомального зсуву рамки зчитування. Слизька послідовність спричиняє швидше рибосомальне пересування, що, у свою чергу, може спричинити «ковзання» зчитування рибосоми. Це дозволяє тРНК зсуватися на 1 основу (-1) після того, як вона спарується зі своїм антикодоном, змінюючи рамку зчитування. −1 зсув рамки зчитування, запущений такою послідовністю, є запрограмованим рибосомальним зсувом рамки зчитування. За ним йде спейсерна область та вторинна структура РНК. Такі послідовності поширені у вірусних . Зсув рамки зчитування відбувається через зміщене (воблівське) спаровування основ. Знижена вільна енергія Гіббза вторинних структур вказує на те, як часто відбувається зсув рамки зчитування. Напруження на молекулі мРНК також відіграє певну роль. Список слизьких послідовностей, виявлених у вірусів тварин, наведено у публікації Хуан та ін. Слизькі послідовності, які спричиняють 2-основне «ковзання» (−2 зсув рамки зчитування), були побудовані з УУУУУУА-послідовності ВІЛ. (uk)
|
gold:hypernym
| |
prov:wasDerivedFrom
| |
page length (characters) of wiki page
| |
foaf:isPrimaryTopicOf
| |
is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
is foaf:primaryTopic
of | |