About: Sortase     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:WikicatEnzymes, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FSortase&invfp=IFP_OFF&sas=SAME_AS_OFF

Sortase refers to a group of prokaryotic enzymes that modify surface proteins by recognizing and cleaving a carboxyl-terminal sorting signal. For most substrates of sortase enzymes, the recognition signal consists of the motif LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), then a highly hydrophobic transmembrane sequence, followed by a cluster of basic residues such as arginine. Cleavage occurs between the Thr and Gly, with transient attachment through the Thr residue to the active site Cys residue, followed by transpeptidation that attaches the protein covalently to cell wall components. Sortases occur in almost all Gram-positive bacteria and the occasional Gram-negative bacterium (e.g. Shewanella putrefaciens) or Archaea (e.g. Methanobacterium thermoautotrophicum), where cell wall LPXTG-mediated decoratio

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • Sortase (de)
  • ソルターゼ (ja)
  • Sortase (en)
  • Сортаза (ru)
rdfs:comment
  • Sortasen bilden eine Familie Membran-assoziierter bakterieller Enzyme und werden der Klasse der zugeordnet. (de)
  • ソルターゼ(Sortase)は、原核生物の酵素の一群の一つである。細胞表面タンパク質のC末端に位置する識別シグナルを認識してこれを切断し、表面タンパク質を改変する。ソルターゼはほぼ全てのグラム陰性菌と一部のグラム陽性菌(Shewanella putrefaciensなど)と一部の古細菌(Methanobacterium thermoautotrophicumなど)で確認されている。ソルターゼはアミノ酸配列の類似性から6つのクラス(A~F)に分類される。クラスAソルターゼは、とても広範な標的タンパク質への活性を示すためハウスキーピングソルターゼとも呼ばれる。その他のクラスは基質特異性の高いものが多く、様々な機能を持つクラスB、ピリンの性繊毛への組み立てを触媒するクラスC、胞子の形成にも重要な役割を果たすクラスDなどがあり、クラスEとFについては不明な点が多い。 (ja)
  • Sortase refers to a group of prokaryotic enzymes that modify surface proteins by recognizing and cleaving a carboxyl-terminal sorting signal. For most substrates of sortase enzymes, the recognition signal consists of the motif LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), then a highly hydrophobic transmembrane sequence, followed by a cluster of basic residues such as arginine. Cleavage occurs between the Thr and Gly, with transient attachment through the Thr residue to the active site Cys residue, followed by transpeptidation that attaches the protein covalently to cell wall components. Sortases occur in almost all Gram-positive bacteria and the occasional Gram-negative bacterium (e.g. Shewanella putrefaciens) or Archaea (e.g. Methanobacterium thermoautotrophicum), where cell wall LPXTG-mediated decoratio (en)
  • Сортазы относятся к группе прокариотических ферментов, которые модифицируют поверхностные белки путем распознавания и расщепления карбоксиконцевого сортирующего сигнала. Для большинства субстратов ферментов сортировки сигнал распознавания состоит из мотива LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), следующей высокогидрофобной трансмембранной последовательности, за которой следует кластер основных остатков, таких как аргинин . Между Thr и Gly происходит расщепление с временным присоединением через остаток Thr к остатку Cys в активном центре с последующей транспептидацией, которая ковалентно прикрепляет белок к компонентам клеточной стенки. Сортазы встречаются почти у всех грамположительных бактерий и случайных грамотрицательных бактерий (например, Shewanella putrefaciens) или архей (например, Methanobact (ru)
name
  • Sortase family (en)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/sortase.png
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
SCOP
caption
  • Pilus-related Sortase C of Group B Streptococcus. PDB entry (en)
InterPro
  • IPR005754 (en)
Pfam
  • PF04203 (en)
symbol
  • Sortase (en)
has abstract
  • Sortasen bilden eine Familie Membran-assoziierter bakterieller Enzyme und werden der Klasse der zugeordnet. (de)
  • Sortase refers to a group of prokaryotic enzymes that modify surface proteins by recognizing and cleaving a carboxyl-terminal sorting signal. For most substrates of sortase enzymes, the recognition signal consists of the motif LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), then a highly hydrophobic transmembrane sequence, followed by a cluster of basic residues such as arginine. Cleavage occurs between the Thr and Gly, with transient attachment through the Thr residue to the active site Cys residue, followed by transpeptidation that attaches the protein covalently to cell wall components. Sortases occur in almost all Gram-positive bacteria and the occasional Gram-negative bacterium (e.g. Shewanella putrefaciens) or Archaea (e.g. Methanobacterium thermoautotrophicum), where cell wall LPXTG-mediated decoration has not been reported. Although sortase A, the "housekeeping" sortase, typically acts on many protein targets, other forms of sortase recognize variant forms of the cleavage motif, or catalyze the assembly of pilins into pili. (en)
  • ソルターゼ(Sortase)は、原核生物の酵素の一群の一つである。細胞表面タンパク質のC末端に位置する識別シグナルを認識してこれを切断し、表面タンパク質を改変する。ソルターゼはほぼ全てのグラム陰性菌と一部のグラム陽性菌(Shewanella putrefaciensなど)と一部の古細菌(Methanobacterium thermoautotrophicumなど)で確認されている。ソルターゼはアミノ酸配列の類似性から6つのクラス(A~F)に分類される。クラスAソルターゼは、とても広範な標的タンパク質への活性を示すためハウスキーピングソルターゼとも呼ばれる。その他のクラスは基質特異性の高いものが多く、様々な機能を持つクラスB、ピリンの性繊毛への組み立てを触媒するクラスC、胞子の形成にも重要な役割を果たすクラスDなどがあり、クラスEとFについては不明な点が多い。 (ja)
  • Сортазы относятся к группе прокариотических ферментов, которые модифицируют поверхностные белки путем распознавания и расщепления карбоксиконцевого сортирующего сигнала. Для большинства субстратов ферментов сортировки сигнал распознавания состоит из мотива LPXTG (Leu-Pro-any-Thr-Gly), следующей высокогидрофобной трансмембранной последовательности, за которой следует кластер основных остатков, таких как аргинин . Между Thr и Gly происходит расщепление с временным присоединением через остаток Thr к остатку Cys в активном центре с последующей транспептидацией, которая ковалентно прикрепляет белок к компонентам клеточной стенки. Сортазы встречаются почти у всех грамположительных бактерий и случайных грамотрицательных бактерий (например, Shewanella putrefaciens) или архей (например, Methanobacterium thermoautotrophicum), где LPXTG-опосредованное декорирование клеточной стенки не зарегистрировано. Хотя сортаза A, называемая «домашней» сортазой, обычно действует на многие белковые мишени, другие формы сортаз распознают вариантные формы мотива расщепления или катализируют сборку пилинов в пили. (ru)
CDD
  • cd00004 (en)
OPM family
OPM protein
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
Symbol
  • Sortase
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 59 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software