About: Alignment-free sequence analysis     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : owl:Thing, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FAlignment-free_sequence_analysis

In bioinformatics, alignment-free sequence analysis approaches to molecular sequence and structure data provide alternatives over alignment-based approaches. The emergence and need for the analysis of different types of data generated through biological research has given rise to the field of bioinformatics. Molecular sequence and structure data of DNA, RNA, and proteins, gene expression profiles or microarray data, metabolic pathway data are some of the major types of data being analysed in bioinformatics. Among them sequence data is increasing at the exponential rate due to advent of next-generation sequencing technologies. Since the origin of bioinformatics, sequence analysis has remained the major area of research with wide range of applications in database searching, genome annotation

AttributesValues
rdfs:label
  • التسلسل الخالي من المحاذاة (ar)
  • Alignment-free sequence analysis (en)
rdfs:comment
  • في المعلوماتية الحيوية، طرق تحليل التسلسلات الخالية من المحاذاة إلى تسلسلات جزيئية وبيانات مهيكلة تقدم بدائل عن طرق التسلسلات التي تعتمد على المحاذاةالانبثاق والحاجة لتحليل أنواع مختلفة من البيانات تولدت عن طريق البحوث الحيوية، قدمت نهوضا في مجال المعلومات الحيوية. التسلسلات الجزيئية والبيانات المهيكلة حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين، حمض نووي ريبوزي، وبروتين، جوانب تعبير جيني أو بيانات المصفوفة الدقيقة للاحماض النووية، مسار أيضي (الايض الاستقلابي) هي بعض الانواع الاساسية للبيانات التي تم تحليلها في المعلومات الحيوية. فيما بينهم، بيانات التسلسلات تزيد بمعدل متسارع وذلك يعود إلى ظهور الجيل التالي من تقنيات التسلسل. منذ نشأة المعلومات الحيوية، ظل تحليل التسلسلات مجال البحث الرئيسي مع تطبيقات واسعة المدى في تحليل قواعد البيانات، التعليقات التوضيحية للجينوم، علم الجينوم المقارن، نسالة جزيئية (ع (ar)
  • In bioinformatics, alignment-free sequence analysis approaches to molecular sequence and structure data provide alternatives over alignment-based approaches. The emergence and need for the analysis of different types of data generated through biological research has given rise to the field of bioinformatics. Molecular sequence and structure data of DNA, RNA, and proteins, gene expression profiles or microarray data, metabolic pathway data are some of the major types of data being analysed in bioinformatics. Among them sequence data is increasing at the exponential rate due to advent of next-generation sequencing technologies. Since the origin of bioinformatics, sequence analysis has remained the major area of research with wide range of applications in database searching, genome annotation (en)
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
has abstract
  • في المعلوماتية الحيوية، طرق تحليل التسلسلات الخالية من المحاذاة إلى تسلسلات جزيئية وبيانات مهيكلة تقدم بدائل عن طرق التسلسلات التي تعتمد على المحاذاةالانبثاق والحاجة لتحليل أنواع مختلفة من البيانات تولدت عن طريق البحوث الحيوية، قدمت نهوضا في مجال المعلومات الحيوية. التسلسلات الجزيئية والبيانات المهيكلة حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين، حمض نووي ريبوزي، وبروتين، جوانب تعبير جيني أو بيانات المصفوفة الدقيقة للاحماض النووية، مسار أيضي (الايض الاستقلابي) هي بعض الانواع الاساسية للبيانات التي تم تحليلها في المعلومات الحيوية. فيما بينهم، بيانات التسلسلات تزيد بمعدل متسارع وذلك يعود إلى ظهور الجيل التالي من تقنيات التسلسل. منذ نشأة المعلومات الحيوية، ظل تحليل التسلسلات مجال البحث الرئيسي مع تطبيقات واسعة المدى في تحليل قواعد البيانات، التعليقات التوضيحية للجينوم، علم الجينوم المقارن، نسالة جزيئية (علم الوراثة الجزيئي), تنبؤ بالمورثات الجيني. الطرق الرائدة لتحليل التسلسلات تعتمد على تسلسلات المحاذاة سواء كانت عالمية أو محلية، زوجية أو متعددة. الطرق التي تعتمد على المحاذاة تقدم نتائج ممتازه بشكل عام عندما تكون التسلسلات قيد الدراسة وثيقة الصلة ويمكن محاذاتها بشكل موثوق، ولكن عندما تكون التسلسلات متباينة، لن نتمكن من الحصول على محاذاة موثوقة وبالتالي تطبيقات تسلسلات المحاذاة تكون محدودة. سلبية أخرى للتسلسلات التي تعتمد على المحاذاة هي تعقيقداتها الحسابية واستهلاكها للوقت وبالتالي يقل استخدامها عند التعامل مع بيانات تسلسل واسعة النطاق. نتج عن ظهور الجيل التالي من تقنيات التسلسل توليد بيانات تسلسلات ضخمة.حجم هذه البيانات يفرض تحديات على خوارزميات التسلسلات التي تعتمد على المحاذاة من خلال تجميعها، توضيحها (بوضع ملاحظات), مقارنتها مع دراسات مشابهه. (ar)
  • In bioinformatics, alignment-free sequence analysis approaches to molecular sequence and structure data provide alternatives over alignment-based approaches. The emergence and need for the analysis of different types of data generated through biological research has given rise to the field of bioinformatics. Molecular sequence and structure data of DNA, RNA, and proteins, gene expression profiles or microarray data, metabolic pathway data are some of the major types of data being analysed in bioinformatics. Among them sequence data is increasing at the exponential rate due to advent of next-generation sequencing technologies. Since the origin of bioinformatics, sequence analysis has remained the major area of research with wide range of applications in database searching, genome annotation, comparative genomics, molecular phylogeny and gene prediction. The pioneering approaches for sequence analysis were based on sequence alignment either global or local, pairwise or multiple sequence alignment. Alignment-based approaches generally give excellent results when the sequences under study are closely related and can be reliably aligned, but when the sequences are divergent, a reliable alignment cannot be obtained and hence the applications of sequence alignment are limited. Another limitation of alignment-based approaches is their computational complexity and are time-consuming and thus, are limited when dealing with large-scale sequence data. The advent of next-generation sequencing technologies has resulted in generation of voluminous sequencing data. The size of this sequence data poses challenges on alignment-based algorithms in their assembly, annotation and comparative studies. (en)
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 59 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software