About: HaeIII     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : yago:WikicatRestrictionEnzymes, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/c/9hx2oaBUrN

HaeIII is one of many restriction enzymes (endonucleases) a type of prokaryotic DNA that protects organisms from unknown, foreign DNA. It is a restriction enzyme used in molecular biology laboratories. It was the third endonuclease to be isolated from the Haemophilus aegyptius bacteria. The enzyme's recognition site—the place where it cuts DNA molecules—is the GGCC nucleotide sequence which means it cleaves DNA at the site 5′-GG/CC-3. The recognition site is usually around 4-8 bps.This enzyme's gene has been sequenced and cloned. This is done to make DNA fragments in blunt ends. HaeIII is not effective for single stranded DNA cleavage.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • HaeIII (de)
  • HaeIII (es)
  • HaeIII (en)
  • HaeIII (pl)
  • HaeIII (sv)
rdfs:comment
  • HaeIII is one of many restriction enzymes (endonucleases) a type of prokaryotic DNA that protects organisms from unknown, foreign DNA. It is a restriction enzyme used in molecular biology laboratories. It was the third endonuclease to be isolated from the Haemophilus aegyptius bacteria. The enzyme's recognition site—the place where it cuts DNA molecules—is the GGCC nucleotide sequence which means it cleaves DNA at the site 5′-GG/CC-3. The recognition site is usually around 4-8 bps.This enzyme's gene has been sequenced and cloned. This is done to make DNA fragments in blunt ends. HaeIII is not effective for single stranded DNA cleavage. (en)
  • HaeIII es una enzima de restricción de tipo II (EC 3.1.21.4)​ producida por el microorganismo que posee una diana de restricción en el ADN de cadena doble dependiente de una secuencia no metilada, palindrómica y no escalonada, sobre la cual su actividad catalítica hidrolasa genera extremos romos. La diana de restricción puede representarse según este diagrama: (es)
  • HaeIII är ett restriktionsenzym som finns i Haemophilus aegyptius. Dess funktion är att klyva DNA-strängar vid sekvensen GGCC. Den klyver rakt av vilket kallas , tvärt emot klistriga ändar. (sv)
  • Das Enzym HaeIII gehört zu den Restriktionsendonukleasen und ist in der Lage DNA an spezifischen Stellen zu schneiden. HaeIII ist ein TypII-Restriktionsenzym und ist das dritte aus dem Bakterium Haemophilus aegyptius isolierte Restriktionsenzym. Das codierende Gen wurde sequenziert und kloniert, wodurch es für viele Anwendungen in der Molekularbiologie genutzt werden kann. Die molare Masse des Enzyms beträgt 37.126 Da. Wie viele andere Restriktionsenzyme bindet HaeIII an Stellen der DNA, die eine bestimmte Nukleotid-Sequenz aufweisen. (de)
  • HaeIII – endonukleaza wyizolowana po raz pierwszy ze szczepu Haemophilus aegyptius, o masie cząsteczkowej 37 126 Da, wykazująca aktywność star. W biologii molekularnej enzym HaeIII jest używany jako restrykcyjny. Przy cięciu DNA tnie on obie nici w dokładnie przeciwległych miejscach i tworzy (czyli nie końce lepkie). Sekwencją rozpoznawaną i ciętą przez enzym jest sekwencja palindromowa 5'-GG▼CC-3' ( 3'-CC▲GG-5'). Metylacja drugiej guaniny w sekwencji (GGm5CC) chroni DNA przed cięciem, natomiast efektu tego nie ma metylacja cytozyny (GGCm5C). (pl)
name
  • HaeIIIR (en)
  • Type-2 restriction enzyme HaeIII (en)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/HaeIII-methyltransferase-dna-pdb-1DCT.png
dct:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
thumbnail
caption
  • The crystal structure of HaeIII enzyme convalently complexed to DNA: an extrahelical cytosine and rearranged base pairing. (en)
ECnumber
InterPro
  • IPR019059 (en)
Organism
  • Haemophilus aegyptius (en)
Pfam
  • PF09556 (en)
symbol
  • RE_HaeIII (en)
  • haeIIIR (en)
taxId
UniProt
  • O68584 (en)
has abstract
  • Das Enzym HaeIII gehört zu den Restriktionsendonukleasen und ist in der Lage DNA an spezifischen Stellen zu schneiden. HaeIII ist ein TypII-Restriktionsenzym und ist das dritte aus dem Bakterium Haemophilus aegyptius isolierte Restriktionsenzym. Das codierende Gen wurde sequenziert und kloniert, wodurch es für viele Anwendungen in der Molekularbiologie genutzt werden kann. Die molare Masse des Enzyms beträgt 37.126 Da. Wie viele andere Restriktionsenzyme bindet HaeIII an Stellen der DNA, die eine bestimmte Nukleotid-Sequenz aufweisen. Beim Schneiden der doppelsträngigen DNA entsteht ein glatter Schnitt ohne Überhänge. Die Enden der DNA-Bruchstücke werden deswegen als glatte Enden oder blunt ends bezeichnet. (de)
  • HaeIII is one of many restriction enzymes (endonucleases) a type of prokaryotic DNA that protects organisms from unknown, foreign DNA. It is a restriction enzyme used in molecular biology laboratories. It was the third endonuclease to be isolated from the Haemophilus aegyptius bacteria. The enzyme's recognition site—the place where it cuts DNA molecules—is the GGCC nucleotide sequence which means it cleaves DNA at the site 5′-GG/CC-3. The recognition site is usually around 4-8 bps.This enzyme's gene has been sequenced and cloned. This is done to make DNA fragments in blunt ends. HaeIII is not effective for single stranded DNA cleavage. (en)
  • HaeIII es una enzima de restricción de tipo II (EC 3.1.21.4)​ producida por el microorganismo que posee una diana de restricción en el ADN de cadena doble dependiente de una secuencia no metilada, palindrómica y no escalonada, sobre la cual su actividad catalítica hidrolasa genera extremos romos. La diana de restricción puede representarse según este diagrama: (es)
  • HaeIII – endonukleaza wyizolowana po raz pierwszy ze szczepu Haemophilus aegyptius, o masie cząsteczkowej 37 126 Da, wykazująca aktywność star. W biologii molekularnej enzym HaeIII jest używany jako restrykcyjny. Przy cięciu DNA tnie on obie nici w dokładnie przeciwległych miejscach i tworzy (czyli nie końce lepkie). Sekwencją rozpoznawaną i ciętą przez enzym jest sekwencja palindromowa 5'-GG▼CC-3' ( 3'-CC▲GG-5'). Metylacja drugiej guaniny w sekwencji (GGm5CC) chroni DNA przed cięciem, natomiast efektu tego nie ma metylacja cytozyny (GGCm5C). Enzym ten został w pełni zsekwencjonowany; znana jest także jego struktura krystaliczna. (pl)
  • HaeIII är ett restriktionsenzym som finns i Haemophilus aegyptius. Dess funktion är att klyva DNA-strängar vid sekvensen GGCC. Den klyver rakt av vilket kallas , tvärt emot klistriga ändar. (sv)
Chromosome
  • Genomic (en)
EntrezChromosome
  • NC_014920.1 (en)
GenLoc end
GenLoc start
RefSeqProtein
  • WP_006996034.1 (en)
gold:hypernym
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
Faceted Search & Find service v1.17_git147 as of Sep 06 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3331 as of Sep 2 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software