About: Open reading frame     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : owl:Thing, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/describe/?url=http%3A%2F%2Fdbpedia.org%2Fresource%2FOpen_reading_frame

In molecular biology, open reading frames (ORFs) are defined as spans of DNA sequence between the start and stop codons. Usually, this is considered within a studied region of a prokaryotic DNA sequence, where only one of the will be "open" (the "reading", however, refers to the RNA produced by transcription of the DNA and its subsequent interaction with the ribosome in translation). Such an ORF may contain a start codon (usually AUG in terms of RNA) and by definition cannot extend beyond a stop codon (usually UAA, UAG or UGA in RNA). That start codon (not necessarily the first) indicates where translation may start. The transcription termination site is located after the ORF, beyond the translation stop codon. If transcription were to cease before the stop codon, an incomplete protein wo

AttributesValues
rdfs:label
  • قالب قراءة مفتوح (ar)
  • Marc obert de lectura (ca)
  • Offener Leserahmen (de)
  • ORF (eu)
  • Marco abierto de lectura (es)
  • Rangka baca terbuka (in)
  • Cadre de lecture ouvert (fr)
  • Open reading frame (it)
  • オープンリーディングフレーム (ja)
  • 오픈 리딩 프레임 (ko)
  • Open reading frame (en)
  • Open leesraam (nl)
  • Fase de leitura aberta (pt)
  • Otwarta ramka odczytu (pl)
  • Открытая рамка считывания (ru)
  • 開放閱讀框 (zh)
  • Відкрита рамка зчитування (uk)
rdfs:comment
  • Rangka baca terbuka atau open reading frame di dalam bahasa Inggris adalah bagian tanpa dari rangka baca ADN. Di dalam proses , setiap tiga basa (kodon) diterjemahkan menjadi satu asam amino. Menggunakan prinsip ini terdapat 6 rangka baca yang mungkin di dalam menerjemahkan kodon, yaitu +1, +2, +3, -1, -2, dan -3, di mana tanda + melambangkan utas sense, dan - melambangkan utas nonsense. Pada praktiknya, rangka baca terbuka cenderung merupakan rangka baca yang menghasilkan utas protein paling panjang. (in)
  • 분자유전학에서 오픈 리딩 프레임(open reading frame, ORF)은 mRNA로 전사되어 단백질이 될 가능성이 있는 염기서열들을 의미하며, 1. 어떤 ATG(AUG) 서열을 시작으로 보는지에 따라 2. 염기서열을 3개씩 코돈으로 묶을 때 어떻게 묶느냐에 따라 3. DNA의 반대편 strand의 염기서열에서 전사되는지에 따라 시작코돈과 종결코돈에 변화가 생기기 때문에, 열려있다고 한다. ORF는 mRNA로 전사될 가능성이 있는 염기서열들의 집합이므로, 실제로 mRNA로 전사되는지의 여부는 실험적으로 확인해야 한다. 전사 종결자 정지 지점은 열린 번역 틀 다음에 위치하는데, 만약 전사가 종결 코돈 전에 멈추게 되면, 번역과정 동안 불완전한 단백질이 만들어진다.일반적으로, 열린 번역 틀 지역의 시작코돈 이후의 삽입은 프레임쉬프트 돌연변이를 일으켜서 종결 코돈의 위치를 이동시키게 한다. (ko)
  • Open Reading Frame (sigla ORF), in italiano quadro (o cornice) di lettura aperto è la fase di lettura che consente di codificare un’intera proteina, senza incontrare codoni di stop prematuri e quindi formare una proteina tronca. Le ORF vengono normalmente individuate spostandosi lungo i frammenti di DNA durante la ricerca della localizzazione di un gene. Considerando che vi sono organismi che presentano delle variazioni nella sequenza del codone d'inizio, la ricerca di una ORF può essere differente, sfruttando ad esempio degli algoritmi costruiti su tutti i genomi esistenti (inclusi quelli alterati) e su tutte le possibili modalità di lettura. (it)
  • 分子遺伝学において、オープンリーディングフレーム(英: open reading frame、ORF)とは、翻訳される能力を持つリーディングフレームの部分のことである。ORFとは、開始コドン(通常はAUG)で始まり、終止コドン(通常はUAA、UAG、UGA)で終わるコドンの連続した一続きである。ORF(必ずしも最初のものとは限らない)内のATGコドン(RNAで言うAUG)は、翻訳が開始される場所を示している可能性がある。転写終結部位は、ORFの後に、翻訳終止コドンの先にある。もし、転写が終止コドンの手前で止まると、翻訳時に不完全なタンパク質が作られる。複数のエクソンを持つ真核生物の遺伝子では、転写後にイントロンが除去され、エクソンが結合されて、タンパク質翻訳のための最終的なmRNAが生成される。イントロンには終止コドンが含まれていたり、リーディングフレーム間のずれが発生する可能性があるため、(gene prediction)においては、ORFの開始-終止の定義は、ゲノムDNAではなく、スプライスされたmRNAにのみ適用される。別の定義は、ORFは3で割り切れる長さを持ち、終止コドンで囲まれた配列である。この、より一般的な定義は、トランスクリプトミクスおよび(または)メタゲノミクスの分野においても有用であり、得られた配列に開始コドン/終止コドンが存在しない場合もある。このようなORFは、完全な遺伝子ではなく、遺伝子の一部に対応する。 (ja)
  • Em genética, chama-se fase de leitura aberta (em inglês open reading frame) a cada uma das sequências de ADN compreendidas entre um codão de início (AUG) da tradução e um codão de terminação, descontando as sequências que correspondem aos intrões no caso de os haver. Encontram-se delimitados pelos UTRs, ou sequências não traduzidas. (pt)
  • Открытая рамка считывания (англ. Open Reading Frame, ORF) — последовательность нуклеотидов в составе ДНК или РНК, потенциально способная кодировать белок. Основным признаком наличия ORF служит отсутствие стоп-кодонов (в случае РНК — обычно UAA, UGA и UAG) на достаточно длинном участке последовательности после стартового кодона (в подавляющем большинстве случаев — AUG). Поскольку в некоторых случаях стартовый и терминирующие кодоны отличаются от канонических, а также ввиду возможности супрессии (подавления действия) стоп-кодонов при трансляции у некоторых организмов, при определении рамки считывания применяются алгоритмы, которые учитывают эти различия. (ru)
  • 開放閱讀框(英語:Open reading frame;縮寫:ORF;其他譯名:開放閱讀框架、開放讀架等)是指在給定的閱讀框架中,不包含终止密碼子的一串序列。這段序列是生物個體的基因組中,可能作為蛋白質編碼序列的部分。基因中的ORF包含並位於開始編碼與終止編碼之間。由於一段DNA或RNA序列有多種不同讀取方式,因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。有一些電腦程式可分析出最有可能编码蛋白质的序列。 (zh)
  • إطار القراءة المفتوح أو قالب القراءة المفتوح (بالإنجليزية: open reading frame)‏ هو جزء من إطار قراءة يملك قابلية أن يُترجم إلى ناتج جيني (بروتين أو رنا غير مشفر وظيفي)، وهو مفهوم في علم الأحياء الحاسوبي يُعرَّف على أنه امتداد مستمر من الكودونات (الرامزات) يبدأ بكودون بداية (عادة AUG) وينتهي بكودون توقف (عادة UAA أو UAG أو UGA) ويُستخدم كوسيلة للتنبؤ الأولي بالجينات. جاءت كلمة مفتوح من ترجمة كلمة Open في العبارة "open for translation" أي له قابلية للترجمة وهي إشارة إلى احتمال وجود جين مشفر للبروتين. (ar)
  • Una pauta oberta o marc obert de lectura, també coneguda per l'acrònim ORF (de l'expressió anglesa open reading frame), és una seqüència de nucleòtids que potencialment pot codificar una proteïna, ja que està compresa entre una seqüència d'inici (codó d'inici) i una seqüència de terminació (codó d'aturada o codó de stop). També ha de tenir una llargada coherent per una proteïna. Els extrems del ORF no delimiten l'ARNm, que sol ésser més llarg, ja que presenta altres regions no codificadores. (ca)
  • Als offener Leserahmen (OLR) oder offenes Leseraster (als Übersetzung von engl. open reading frame, ORF) wird in der Genetik derjenige Bereich der DNA bzw. RNA (Virus-RNA oder mRNA) bezeichnet, dessen Leserahmen zwischen einem Startcodon und dem ersten Stopcodon im gleichen Leseraster liegt. Der offene Leserahmen codiert potenziell die Aminosäuresequenz eines Peptids (kurze Sequenz) oder Proteins (lange Sequenz). Eine alternative Definition besagt, dass ein ORF bei Stopcodons beginnt und endet. (de)
  • Genetika molekularrean, irakurtarau ireki edo ORF bat (Open reading frame ingelesez) hasierako kodoi baten (AUG) eta bukaera kodoi baten arteko DNA sekuentzia bat da, introiei dagokien sekuentziak kontuan hartu gabe. UTRen artean agertzen dira, hau da, itzultzen ez diren sekuentziak. Sei irakurtarau hauek +1, +2, +3, -1, -2 eta -3 izena hartzen dute 5' aactgcagtacgtaacgtca 3' sekuentzia adibide gisa hartuta, hauek dira irakurtarauak: Irakurtarau bakoitzak sekuentzia proteiko zeharo ezberdina emango du. (eu)
  • En genética, se llama marco abierto de lectura o marco de lectura abierta (ORF, del inglés open reading frame) a la secuencia de ARN comprendida entre un codón de inicio (AUG) de la traducción y un codón de terminación, descontando las secuencias que corresponden a los intrones, en caso de haberlas. Se encuentra acotado por los UTR (es decir, las secuencias no traducidas). El nombre se debe a que, una vez establecido uno de los tres posibles marcos de lectura por el codón de iniciación, la secuencia se encuentra "abierta" para la transcripción, que continúa más allá del codón de terminación. (es)
  • En génétique moléculaire, un cadre de lecture ouvert, ou phase ouverte de lecture (open reading frame ou ORF en anglais), est une partie d'un cadre de lecture susceptible d'être traduit en protéine ou en peptide. C'est une suite de codons comprenant le codon start et un codon stop, généralement UAA, UAG ou UGA. Un codon d'initiation AUG du cadre de lecture ouvert — codon qui n'est pas nécessairement le premier de celui-ci — peut indiquer le début de la traduction. Le site de terminaison de la transcription est situé après le cadre de lecture ouvert, au-delà du codon stop. La notion de cadre de lecture ouvert est très utilisée pour la prédiction de gènes. (fr)
  • In molecular biology, open reading frames (ORFs) are defined as spans of DNA sequence between the start and stop codons. Usually, this is considered within a studied region of a prokaryotic DNA sequence, where only one of the will be "open" (the "reading", however, refers to the RNA produced by transcription of the DNA and its subsequent interaction with the ribosome in translation). Such an ORF may contain a start codon (usually AUG in terms of RNA) and by definition cannot extend beyond a stop codon (usually UAA, UAG or UGA in RNA). That start codon (not necessarily the first) indicates where translation may start. The transcription termination site is located after the ORF, beyond the translation stop codon. If transcription were to cease before the stop codon, an incomplete protein wo (en)
  • In de moleculaire genetica is in het DNA of RNA een open leesraam (Engels: open reading frame (ORF)) het gedeelte van het leesraam dat getranscribeerd (DNA) of getransleerd (mRNA) kan worden. Het bestaat uit tripletten. Het open leesraam begint met het startcodon en eindigt met het stopcodon. Een AUG- (in RNA) of ATG-startcodon (in DNA) geeft aan waar de translatie van het mRNA of de transcriptie van het DNA begint. De transcriptieterminatorplaats of translatieterminatorplaats ligt na het open leesraam, voorbij het stopcodon van de transcriptie of translatie. Als de translatie of transcriptie stopt voor het stopcodon wordt er geen volwaardig eiwit aangemaakt. (nl)
  • Otwarta ramka odczytu lub ORF (z ang. Open Reading Frame) – część sekwencji nukleotydów między kodonem START (AUG) a kodonem STOP, włącznie z odcinkami niekodującymi. Jest odcinkiem DNA, który nie zawiera kodonu terminacyjnego przed utworzeniem kompletnego polipeptydu, czyli potencjalnie może ulec translacji na białko. (pl)
  • Відкрита рамка зчитування або ORF (від англ. open reading frame) — фрагмент геному організмів, який містить нуклеотидну послідовність, що потенційно могла б транслюватися в білок. Початок і кінець ORF не еквівалентні до кінців мРНК, але вони зазвичай містяться в межах мРНК. У гені, ORF розміщуються між кодом початку трансляції (старт-кодоном) і кодом зупинки (стоп-кодоном). (uk)
foaf:depiction
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Sampleorf.png
  • http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/Open_reading_frame.jpg
dcterms:subject
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
Link from a Wikipage to an external page
sameAs
Faceted Search & Find service v1.17_git139 as of Feb 29 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3330 as of Mar 19 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 67 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software