About: SYNE2     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : dbo:Protein, within Data Space : dbpedia.demo.openlinksw.com associated with source document(s)
QRcode icon
http://dbpedia.demo.openlinksw.com/c/Uk49vDF3o

Nesprin-2 is a protein that in humans is encoded by the SYNE2 gene. The human SYNE2 gene consists of 116 exons and encodes nesprin-2, a member of the nuclear envelope (NE) spectrin-repeat (nesprin) family. Nesprins are modular proteins with a central extended spectrin-repeat (SR) rod domain and a C-terminal Klarsicht/ANC-1/Syne homology (KASH) transmembrane domain, which acts as a NE-targeting motif. Nesprin-2 (Nesp2) binds to cytoplasmic F-actin, tethering the nucleus to the cytoskeleton and maintaining the structural integrity of the nucleus.

AttributesValues
rdf:type
rdfs:label
  • SYNE2 (ar)
  • SYNE2 (en)
  • SYNE2 (uk)
rdfs:comment
  • SYNE2‏ (Spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SYNE2 في الإنسان. (ar)
  • Nesprin-2 is a protein that in humans is encoded by the SYNE2 gene. The human SYNE2 gene consists of 116 exons and encodes nesprin-2, a member of the nuclear envelope (NE) spectrin-repeat (nesprin) family. Nesprins are modular proteins with a central extended spectrin-repeat (SR) rod domain and a C-terminal Klarsicht/ANC-1/Syne homology (KASH) transmembrane domain, which acts as a NE-targeting motif. Nesprin-2 (Nesp2) binds to cytoplasmic F-actin, tethering the nucleus to the cytoskeleton and maintaining the structural integrity of the nucleus. (en)
  • SYNE2 (англ. Spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 6 885 амінокислот, а молекулярна маса — 796 442. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин (uk)
Wikipage page ID
Wikipage revision ID
Link from a Wikipage to another Wikipage
sameAs
dbp:wikiPageUsesTemplate
has abstract
  • SYNE2‏ (Spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SYNE2 في الإنسان. (ar)
  • Nesprin-2 is a protein that in humans is encoded by the SYNE2 gene. The human SYNE2 gene consists of 116 exons and encodes nesprin-2, a member of the nuclear envelope (NE) spectrin-repeat (nesprin) family. Nesprins are modular proteins with a central extended spectrin-repeat (SR) rod domain and a C-terminal Klarsicht/ANC-1/Syne homology (KASH) transmembrane domain, which acts as a NE-targeting motif. Nesprin-2 (Nesp2) binds to cytoplasmic F-actin, tethering the nucleus to the cytoskeleton and maintaining the structural integrity of the nucleus. The human SYNE2 gene encodes a protein of 6,885 amino acids (isoform 1, Nesp2 giant); alternative mRNA splicing produces transcripts encoding a larger isoform and numerous smaller isoforms, some of which are specific to various tissues; alternative start and termination sites within the mRNA also allow translation of smaller isoforms, many possessing unique N- or C-terminal sequences encoded by retained introns. Two mechanisms create splice variants of nesprin-2 with the KASH domain deleted (deltaKASH). In deltaKASH1 variants, deletion of cassette exons 111-112 results in a frame shift that disrupts the KASH domain but retains the 3' untranslated region (UTR) in exon 116 utilized for isoforms containing the KASH domain. This mechanism, which also occurs in SYNE1 mRNA encoding nesprin-1 (enaptin), generates deltaKASH1 isoforms terminating with a distinct 11-amino acid tail (GIAGHSATPPA replacing YPMLRYTNGPPPT in isoforms with KASH). Utilization of an alternative stop codon in exon 115, which is followed by a distinct 3' UTR, generates deltaKASH2 variants. This mechanism truncates larger isoforms without generating a distinct C-terminal sequence. Expression of deltaKASH1 variants occurs largely in brain and kidney, with smaller amounts in heart; deltaKASH2 variants are detected in heart and spleen. (en)
  • SYNE2 (англ. Spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 6 885 амінокислот, а молекулярна маса — 796 442. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, клітинних контактах, саркоплазматичному ретикулумі. (uk)
gold:hypernym
prov:wasDerivedFrom
page length (characters) of wiki page
foaf:isPrimaryTopicOf
is Link from a Wikipage to another Wikipage of
is Wikipage redirect of
is foaf:primaryTopic of
Faceted Search & Find service v1.17_git147 as of Sep 06 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 08.03.3332 as of Dec 5 2024, on Linux (x86_64-generic-linux-glibc212), Single-Server Edition (378 GB total memory, 59 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software