Single-molecule real-time (SMRT) sequencing is a parallelized single molecule DNA sequencing method. Single-molecule real-time sequencing utilizes a zero-mode waveguide (ZMW). A single DNA polymerase enzyme is affixed at the bottom of a ZMW with a single molecule of DNA as a template. The ZMW is a structure that creates an illuminated observation volume that is small enough to observe only a single nucleotide of DNA being incorporated by DNA polymerase. Each of the four DNA bases is attached to one of four different fluorescent dyes. When a nucleotide is incorporated by the DNA polymerase, the fluorescent tag is cleaved off and diffuses out of the observation area of the ZMW where its fluorescence is no longer observable. A detector detects the fluorescent signal of the nucleotide incorpor
| Attributes | Values |
|---|
| rdfs:label
| - Secuenciación SMRT (es)
- 1分子リアルタイムシーケンシング (ja)
- Single-molecule real-time sequencing (en)
- Одномолекулярное секвенирование в реальном времени (ru)
- Single-Molecule Real-Time-sekvensering (sv)
|
| rdfs:comment
| - 一分子リアルタイムシーケンシング（英:Single-molecule real-time sequencing；SMRT Sequencing）または一分子リアルタイムシーケンスとは、並列化された単一分子DNAシーケンスの手法の一つであり、Pacific Biosciences of California社(アメリカ)から発売されているPacBioシーケンサープラットフォーム上で動作する。SMRTシーケンスでは、ゼロモード導波路（zero-mode waveguide）を利用しており 、DNAポリメラーゼ酵素が一つずつZMWの底部に固定されている。そして、この酵素がテンプレートのDNA分子を一つづつ取り込む。ZMWは、DNAポリメラーゼによって取り込まれるDNAを1ヌクレオチド単位で観察することができるような、極小の蛍光観察を行える場を構成する構造をとっている。4種類のDNA塩基は各々異なる蛍光色素が付着しており、ヌクレオチドがDNAポリメラーゼによって取り込まれることで蛍光タグが切断されて蛍光が発せられ、またその蛍光タグは迅速にZMWの観察領域から拡散することで蛍光が観察されなくなる。検出器は、ヌクレオチド取り込み時に発せられるこの一瞬の蛍光シグナルを検出し、その蛍光色素に対応する塩基に従うことで、ベースコールが行われる。 (ja)
- Одномолекуля́рное секвени́рование в реа́льном вре́мени (англ. Single molecule real time sequencing или SMRT) — метод секвенирования ДНК нового поколения, разработанный компанией . Идея метода состоит в определении последовательности ДНК за счёт наблюдения за работой единичной молекулы ДНК-полимеразы в реальном времени. При этом ДНК-полимераза достраивает вторую цепь исследуемой молекулы ДНК, используя нуклеотиды, меченные различными ; регистрируя данные метки, можно понять, какой нуклеотид ДНК-полимераза встраивает в настоящий момент. (ru)
- La Secuenciación SMRT (del inglés single molecule real time sequencing) o secuenciación a tiempo real de una única molécula de ADN es una tecnología de secuenciación por síntesis de una molécula de ADN fija desarrollada por . Utiliza la guía de onda de "modo cero" (ZMW), desarrollada en los laboratorios de y en la Universidad de Cornell. En el fondo de la ZMW se fija una ADN polimerasa con una molécula de ADN molde. La ZMW permite el estudio de un único nucleótido incorporado a la polimerización. Cada una de las cuatro bases nitrogenadas del ADN se marca con un fluoróforo diferente. Así, cuando un nucleótido se incorpora a la cadena incipiente, se libera el fluoróforo y se observa una señal que es recogida en un detector. La primera secuencia obtenida a través de secuenciación SMRT fue (es)
- Single-molecule real-time (SMRT) sequencing is a parallelized single molecule DNA sequencing method. Single-molecule real-time sequencing utilizes a zero-mode waveguide (ZMW). A single DNA polymerase enzyme is affixed at the bottom of a ZMW with a single molecule of DNA as a template. The ZMW is a structure that creates an illuminated observation volume that is small enough to observe only a single nucleotide of DNA being incorporated by DNA polymerase. Each of the four DNA bases is attached to one of four different fluorescent dyes. When a nucleotide is incorporated by the DNA polymerase, the fluorescent tag is cleaved off and diffuses out of the observation area of the ZMW where its fluorescence is no longer observable. A detector detects the fluorescent signal of the nucleotide incorpor (en)
- Single-molecule real-time-sekvensering (SMRT-sekvensering) är en DNA-sekvenseringsmetod för parallelliserad enkelmolekyl. SMRT-sekvensering använder zero-mode waveguide (ZMW). Ett enda DNA polymeras-enzym är fäst vid botten av en ZMW med en enda DNA-molekyl som mall. ZMW är en struktur som skapar en upplyst observationsvolym som är tillräckligt liten för att endast observera en enda DNA-nukleotid som inkorporeras av DNA polymeras. Var och en av de fyra DNA-baserna är fäst vid en av fyra olika fluorescerande färgämnen. När en nukleotid införlivas av DNA-polymeraset klyvs den fluorescerande taggen och diffunderar ut från observationsområdet för ZMW där dess fluorescens inte längre kan observeras. En detektor detekterar den fluorescerande signalen från nukleotidinkorporeringen och base call g (sv)
|
| foaf:depiction
| |
| dcterms:subject
| |
| Wikipage page ID
| |
| Wikipage revision ID
| |
| Link from a Wikipage to another Wikipage
| |
| Link from a Wikipage to an external page
| |
| sameAs
| |
| dbp:wikiPageUsesTemplate
| |
| thumbnail
| |
| has abstract
| - La Secuenciación SMRT (del inglés single molecule real time sequencing) o secuenciación a tiempo real de una única molécula de ADN es una tecnología de secuenciación por síntesis de una molécula de ADN fija desarrollada por . Utiliza la guía de onda de "modo cero" (ZMW), desarrollada en los laboratorios de y en la Universidad de Cornell. En el fondo de la ZMW se fija una ADN polimerasa con una molécula de ADN molde. La ZMW permite el estudio de un único nucleótido incorporado a la polimerización. Cada una de las cuatro bases nitrogenadas del ADN se marca con un fluoróforo diferente. Así, cuando un nucleótido se incorpora a la cadena incipiente, se libera el fluoróforo y se observa una señal que es recogida en un detector. La primera secuencia obtenida a través de secuenciación SMRT fue publicada en enero de 2009 en la revista Science. (es)
- Single-molecule real-time (SMRT) sequencing is a parallelized single molecule DNA sequencing method. Single-molecule real-time sequencing utilizes a zero-mode waveguide (ZMW). A single DNA polymerase enzyme is affixed at the bottom of a ZMW with a single molecule of DNA as a template. The ZMW is a structure that creates an illuminated observation volume that is small enough to observe only a single nucleotide of DNA being incorporated by DNA polymerase. Each of the four DNA bases is attached to one of four different fluorescent dyes. When a nucleotide is incorporated by the DNA polymerase, the fluorescent tag is cleaved off and diffuses out of the observation area of the ZMW where its fluorescence is no longer observable. A detector detects the fluorescent signal of the nucleotide incorporation, and the base call is made according to the corresponding fluorescence of the dye. (en)
- 一分子リアルタイムシーケンシング（英:Single-molecule real-time sequencing；SMRT Sequencing）または一分子リアルタイムシーケンスとは、並列化された単一分子DNAシーケンスの手法の一つであり、Pacific Biosciences of California社(アメリカ)から発売されているPacBioシーケンサープラットフォーム上で動作する。SMRTシーケンスでは、ゼロモード導波路（zero-mode waveguide）を利用しており 、DNAポリメラーゼ酵素が一つずつZMWの底部に固定されている。そして、この酵素がテンプレートのDNA分子を一つづつ取り込む。ZMWは、DNAポリメラーゼによって取り込まれるDNAを1ヌクレオチド単位で観察することができるような、極小の蛍光観察を行える場を構成する構造をとっている。4種類のDNA塩基は各々異なる蛍光色素が付着しており、ヌクレオチドがDNAポリメラーゼによって取り込まれることで蛍光タグが切断されて蛍光が発せられ、またその蛍光タグは迅速にZMWの観察領域から拡散することで蛍光が観察されなくなる。検出器は、ヌクレオチド取り込み時に発せられるこの一瞬の蛍光シグナルを検出し、その蛍光色素に対応する塩基に従うことで、ベースコールが行われる。 (ja)
- Single-molecule real-time-sekvensering (SMRT-sekvensering) är en DNA-sekvenseringsmetod för parallelliserad enkelmolekyl. SMRT-sekvensering använder zero-mode waveguide (ZMW). Ett enda DNA polymeras-enzym är fäst vid botten av en ZMW med en enda DNA-molekyl som mall. ZMW är en struktur som skapar en upplyst observationsvolym som är tillräckligt liten för att endast observera en enda DNA-nukleotid som inkorporeras av DNA polymeras. Var och en av de fyra DNA-baserna är fäst vid en av fyra olika fluorescerande färgämnen. När en nukleotid införlivas av DNA-polymeraset klyvs den fluorescerande taggen och diffunderar ut från observationsområdet för ZMW där dess fluorescens inte längre kan observeras. En detektor detekterar den fluorescerande signalen från nukleotidinkorporeringen och base call görs enligt färgämnets motsvarande fluorescens. (sv)
- Одномолекуля́рное секвени́рование в реа́льном вре́мени (англ. Single molecule real time sequencing или SMRT) — метод секвенирования ДНК нового поколения, разработанный компанией . Идея метода состоит в определении последовательности ДНК за счёт наблюдения за работой единичной молекулы ДНК-полимеразы в реальном времени. При этом ДНК-полимераза достраивает вторую цепь исследуемой молекулы ДНК, используя нуклеотиды, меченные различными ; регистрируя данные метки, можно понять, какой нуклеотид ДНК-полимераза встраивает в настоящий момент. (ru)
|
| prov:wasDerivedFrom
| |
| page length (characters) of wiki page
| |
| foaf:isPrimaryTopicOf
| |
| is rdfs:seeAlso
of | |
| is Link from a Wikipage to another Wikipage
of | |
| is Wikipage redirect
of | |
| is foaf:primaryTopic
of | |
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)