This HTML5 document contains 191 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
n48http://bioinformatics.ua.pt/software/
n44http://www.metazome.net/
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
n42http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/
n22http://hy.dbpedia.org/resource/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/
n18http://www.dcode.org/
dbpedia-arhttp://ar.dbpedia.org/resource/
dbpedia-hehttp://he.dbpedia.org/resource/
dbpedia-frhttp://fr.dbpedia.org/resource/
n10http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
skoshttp://www.w3.org/2004/02/skos/core#
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
n30http://www.cbs.dtu.dk/services/GenomeAtlas/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n24http://www.genomenewsnetwork.org/
n20http://dbpedia.org/resource/File:
dbphttp://dbpedia.org/property/
n40http://conferences.oreillynet.com/cs/bio2003/view/e_sess/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n4http://www.genomesonline.org/
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
n5https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1732/
dbpedia-jahttp://ja.dbpedia.org/resource/
n36https://archive.today/20121228024200/http:/pathema.jcvi.org/
n13https://web.archive.org/web/20021005155457/http:/cbi.labri.fr/Genolevures/
dbpedia-ishttp://is.dbpedia.org/resource/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
goldhttp://purl.org/linguistics/gold/
n12https://global.dbpedia.org/id/
n16https://authors.library.caltech.edu/74939/2/26/299.5611.1391.DC1/
n46http://img.jgi.doe.gov/
n17https://web.archive.org/web/20060810113000/http:/www.metazome.net/
n27https://www.medicinenet.com/streptococcal_infections/
n39http://www.genome.gov/
dbpedia-ithttp://it.dbpedia.org/resource/
n29https://web.archive.org/web/20000815203739/http:/www.ensembl.org/
n11https://doi.org/
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
n49http://supfam.org/SUPERFAMILY/
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
n31http://genome.ucsc.edu/
dbpedia-zhhttp://zh.dbpedia.org/resource/
dbpedia-kohttp://ko.dbpedia.org/resource/
n21https://web.archive.org/web/20050309113725/http:/phigs.jgi-psf.org/
dbpedia-fahttp://fa.dbpedia.org/resource/
dbpedia-trhttp://tr.dbpedia.org/resource/
dbpedia-eshttp://es.dbpedia.org/resource/
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
n47http://arquivo.pt/wayback/20160516145036/http:/cmr.jcvi.org/
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#

Statements

Subject Item
dbr:Comparative_genomics
rdfs:label
比较基因组学 비교유전체학 Genómica comparativa علم الجينوم المقارن Génomique comparative 比較ゲノミクス Genomica comparativa Comparative genomics
rdfs:comment
La génomique comparative est l'étude comparative de la structure et fonction des génomes de différentes espèces. Elle permet d'identifier et de comprendre les effets de la sélection sur l'organisation et l'évolution des génomes. Ce nouvel axe de recherche bénéficie de l'augmentation du nombre de génomes séquencés et de la puissance des outils informatiques. Une des applications majeures de la génomique comparative est la découverte de gènes et de leurs séquences régulatrices non codantes basée sur le principe de conservation. 比较基因组学(Comparative genomics)是基于基因组图谱和,对已知的基因特征和基因组结构进行比较以了解基因的功能、表达机制和不同物种的生物学研究。基因组的特征可包括的DNA序列,基因,基因顺序,调控序列,和其它的基因组结构标志。 La genómica comparativa estudia las semejanzas y diferencias entre genomas de diferentes organismos. Es un intento de beneficiarse de la información proporcionada por las firmas de la selección natural para entender la función y los procesos evolutivos que actúan sobre los genomas. Aunque es todavía un campo reciente, promete adquirir nuevas percepciones sobre muchos aspectos de la evolución de las modernas especies. La cantidad total de información contenida en los genomas más complejos (750 Mbp en el caso del ser humano) requiere la automatización de los métodos de la genómica comparativa. La predicción de genes es una aplicación importante de la genómica comparativa, como también lo es el descubrimiento de nuevos y no codificantes, pero funcionales, elementos del genoma. 비교유전체학이란 인간 유전체 연구를 위해서 여러 생물종을 모델로 이용하여 인체 생명현상 및 질환을 연구하는 것을 말한다. 미생물이나 초파리 및 생쥐에서 인체 질환 모델을 분석하고 유전체의 변화를 비교 연구하거나 다른 생물의 변이형을 이용하여 인간 생명현상을 연구할 수 있다. 유전체 염기서열을 분석하거나 단백질, 구조 및 대사산물의 비교 연구를 통하여 각 생명체간의 진화학적 비교연구와 질환연구의 능력을 배양한다. 또한 사람들마다 유전체 염기서열간에 차이가 있고 이는 개인의 차이와 질병 감수성, 약물 반응성 등에 차이를 가져올 수 있다. 일염기다형성(Single nucleotide polymorphism)의 연구를 통하여 인간 다양성을 연구할 수 있고 어떻게 질환 발생에 영향을 주는지 알 수 있다. 이와 같은 비교유전체학 연구분야의 최신 지견과 연구방법을 숙지함으로써 생명정보를 활용하는 능력을 배양한다. 比較ゲノミクス(ひかく-、英語Comparative genomics)とは、異なる生物の間でゲノムの構造を比較することにより、それらの進化上の関係、および進化の過程を推定する研究をいう。進化の過程でどのような選択が働いたかを、ゲノム情報に残された痕跡から明らかにしようとするものである。ゲノムプロジェクトの進展によって生まれた新しい分野であり、生物の進化の歴史に関する多くの情報をもたらすものと期待されている。 遺伝子配列の比較により進化系統を明らかにする分子系統解析は20世紀末から盛んに行われているが、これは特定の1種類ないし数種類の遺伝子を対象とする。この方法でかなり確実性の高い系統樹を描くことができるが、このような変化は一般には進化の原因というより結果であって、進化と遺伝子との関係、そして進化の具体的な様相を明らかにするには、多数の遺伝子(さらに遺伝子以外の部分も)について比較を行う比較ゲノミクスの方法が必要である。ゲノム全体の情報量からいって、比較ゲノミクスにはコンピュータの利用が不可欠である。 塩基配列から、遺伝子および機能的に重要なノンコーディング領域を発見する方法は、バイオインフォマティクスの重要なテーマであり、比較ゲノミクスの基盤ともなるが、逆に比較ゲノミクスの進展により、この方法論の研究が促進されている面もある。 Comparative genomics is a field of biological research in which the genomic features of different organisms are compared. The genomic features may include the DNA sequence, genes, gene order, regulatory sequences, and other genomic structural landmarks. In this branch of genomics, whole or large parts of genomes resulting from genome projects are compared to study basic biological similarities and differences as well as evolutionary relationships between organisms. The major principle of comparative genomics is that common features of two organisms will often be encoded within the DNA that is evolutionarily conserved between them. Therefore, comparative genomic approaches start with making some form of alignment of genome sequences and looking for orthologous sequences (sequences that shar المحاذاة (عمل مطابقة)لكامل للجينوم هي عادة طريقة المثلى\المستخدمة في علم الجينوم المقارن. تكشف هذه المحاذاة (المطابقة) لثمانية جينومات بكتريا يرسينيا (Yersinia bacteria) عن 78 كتلة متداخلة محليًا (حيث أن إعادة التركيب يمكن أن تتسبب في إعادة ترتيب الجينوم، فقد يتم إعادة ترتيب المناطق الموروثة من نفس الأصل لأحد الجينومات أو قلبها بالنسبة لجينوم آخر.ولذلك أثناء عملية المحاذاة (المطابقة)، يحدد Mauve الأجزاء المحفوظة (لم يطرأ عليها تغير كبير (على المجموعات الوظيفية) على جيناتها عبر الزمن) التي تبدو خالية داخليًا (في نفس الجينوم) من إعادة ترتيب الجينوم. يشار إلى هذه المناطق على أنها كتل متداخلة محليًاLCBs).))محفوظة بين جميع الأصناف الثمانية. تم وضع كل كروموسوم بشكل أفقي ويتم إظهار كتل متجانسة في كل جينوم كمناطق متطابقة الألوان مرتبطة عبر الجينومات. المناطق المقلوبة بالنسبة إلى (Y. pestis KIM: وه La genomica comparativa è una branca della biologia molecolare che studia l'espressione genica del DNA umano servendosi di informazioni ricavate dallo studio del genoma appartenente ad altri organismi viventi. Mettendo a confronto le sequenze dei genomi di diversi organismi, è possibile, a livello molecolare, distingue diverse forme di vita tra loro. La Genomica comparativa è un potente strumento per lo studio dei cambiamenti evolutivi tra organismi, contribuendo a identificare i geni che sono conservati o comuni tra le specie, così come di quei geni propri di un determinato tipo di organismo, che ne determinano le sue caratteristiche uniche.
foaf:depiction
n10:New_Mouse_and_Human_Comparison_(2).png n10:A_genome_alignment_of_eight_Yersinia_isolates.png n10:Mouse_and_Human_Comparison_(2)_(2).png n10:BrowserFoxp2.jpg
dcterms:subject
dbc:Genomics dbc:Comparisons dbc:Evolutionary_biology
dbo:wikiPageID
917868
dbo:wikiPageRevisionID
1114099912
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Selection_(biology) dbr:Synteny dbr:Saccharomyces_cerevisiae dbr:Sequence_mining dbr:Phenotype dbr:Neonatal_infection dbr:Comparative_anatomy dbr:Alignment-free_sequence_analysis dbr:Japanese_pufferfish dbr:Eukaryote dbr:Eukaryotes dbr:Escherichia_coli dbr:Organism dbr:Ortholog dbr:Crop_yield dbr:Genetic_variation dbr:Caenorhabditis_briggsae dbr:Animal_model dbr:Evolutionary_theory dbr:Amylose dbr:Genes dbr:Crop_breeding dbr:Hominidae dbr:Pathogen dbr:Streptococcus_pyogenes dbr:Humans dbr:Commensal dbr:Haemophilus_influenzae dbr:Directional_selection dbr:Primate dbr:T_cells n20:BrowserFoxp2.jpg dbr:Eric_Lander dbr:Molecular_evolution dbr:Single-nucleotide_polymorphisms dbr:Regulatory_sequences dbr:Species dbr:History_of_genomics dbr:Human_Genome_Project n20:A_genome_alignment_of_eight_Yersinia_isolates.png dbr:Genome_sequencing dbr:Lior_Pachter dbr:Gerald_M._Rubin dbr:Epstein-Barr_virus dbr:Genome dbr:MUMmer dbr:Genome_wide_association_study dbr:Data_mining dbr:Locus_(genetics) dbr:Biology dbr:DNA_sequencing dbr:Caenorhabditis_elegans dbr:Next-generation_sequencing dbr:Differential_gene_expression dbr:RNA dbr:Gene_expression dbr:Drought_tolerance n20:Mouse_and_Human_Comparison_(2)_(2).png dbr:Conserved_sequence dbr:Reverse_vaccinology dbr:DNA dbc:Genomics dbr:Takifugu_rubripes dbr:Evolutionary dbr:Cowpea_mosaic_virus dbr:Population_genetics dbr:Regulatory_sequence dbr:Deletion_(genetics) dbc:Comparisons dbr:Jill_Mesirov dbr:Model_organisms dbr:Genome_browser dbr:Genome_evolution dbr:Genome_projects dbr:Ensembl dbr:Insertion_(genetics) dbr:Virus dbr:Proteins dbr:Sequence_assembly dbr:Mycoplasma_genitalium dbr:Genomics dbr:Agriculture dbr:Landrace dbr:VISTA_(comparative_genomics) dbr:Immune_cells dbr:RNA_viruses dbr:Regulatory_regions dbr:House_mouse dbc:Evolutionary_biology dbr:Varicella-zoster_virus dbr:Stabilizing_selection dbr:Prokaryote dbr:Common_chimpanzee dbr:Genome_annotation dbr:Common_descent dbr:Sequence_alignment dbr:Enhancer_(genetics) dbr:Ensembl_genome_database_project dbr:Streptococcus_agalactiae dbr:Nucleic_acid_sequence dbr:Picornaviruses n20:New_Mouse_and_Human_Comparison_(2).png dbr:Disease_resistance dbr:Bonnie_Berger dbr:Drosophila_melanogaster dbr:Homology_(biology)
dbo:wikiPageExternalLink
n4: n5: n11:10.1007%2FBF02855776 n13: n16:Boffelli.SOM.pdf n18: n21: n17: n24: n27:article.htm n29: n30: n31: n36: n39: n40:3455 n44: n46: n47: n48:smash n49:
owl:sameAs
freebase:m.03pshy n12:CWhU dbpedia-tr:Kıyaslamalı_genomik n22:Համեմատական_գենոմիկա dbpedia-it:Genomica_comparativa dbpedia-is:Samanburðarerfðamengjafræði dbpedia-he:גנומיקה_השוואתית dbpedia-ar:علم_الجينوم_المقارن dbpedia-ko:비교유전체학 dbpedia-ja:比較ゲノミクス dbpedia-zh:比较基因组学 dbpedia-fr:Génomique_comparative wikidata:Q1147112 dbpedia-es:Genómica_comparativa dbpedia-fa:ژنومیک_تطبیقی
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Cite_journal dbt:Cite_book dbt:Main dbt:Reflist dbt:Genomics dbt:External_links dbt:Webarchive dbt:Open_access
dbo:thumbnail
n10:A_genome_alignment_of_eight_Yersinia_isolates.png?width=300
dbp:date
2006-08-10
dbp:url
n17:
dbo:abstract
La genomica comparativa è una branca della biologia molecolare che studia l'espressione genica del DNA umano servendosi di informazioni ricavate dallo studio del genoma appartenente ad altri organismi viventi. Mettendo a confronto le sequenze dei genomi di diversi organismi, è possibile, a livello molecolare, distingue diverse forme di vita tra loro. La Genomica comparativa è un potente strumento per lo studio dei cambiamenti evolutivi tra organismi, contribuendo a identificare i geni che sono conservati o comuni tra le specie, così come di quei geni propri di un determinato tipo di organismo, che ne determinano le sue caratteristiche uniche. Comparative genomics is a field of biological research in which the genomic features of different organisms are compared. The genomic features may include the DNA sequence, genes, gene order, regulatory sequences, and other genomic structural landmarks. In this branch of genomics, whole or large parts of genomes resulting from genome projects are compared to study basic biological similarities and differences as well as evolutionary relationships between organisms. The major principle of comparative genomics is that common features of two organisms will often be encoded within the DNA that is evolutionarily conserved between them. Therefore, comparative genomic approaches start with making some form of alignment of genome sequences and looking for orthologous sequences (sequences that share a common ancestry) in the aligned genomes and checking to what extent those sequences are conserved. Based on these, genome and molecular evolution are inferred and this may in turn be put in the context of, for example, phenotypic evolution or population genetics. Virtually started as soon as the whole genomes of two organisms became available (that is, the genomes of the bacteria Haemophilus influenzae and Mycoplasma genitalium) in 1995, comparative genomics is now a standard component of the analysis of every new genome sequence. With the explosion in the number of genome projects due to the advancements in DNA sequencing technologies, particularly the next-generation sequencing methods in late 2000s, this field has become more sophisticated, making it possible to deal with many genomes in a single study. Comparative genomics has revealed high levels of similarity between closely related organisms, such as humans and chimpanzees, and, more surprisingly, similarity between seemingly distantly related organisms, such as humans and the yeast Saccharomyces cerevisiae. It has also showed the extreme diversity of the genecomposition in different evolutionary lineages. La génomique comparative est l'étude comparative de la structure et fonction des génomes de différentes espèces. Elle permet d'identifier et de comprendre les effets de la sélection sur l'organisation et l'évolution des génomes. Ce nouvel axe de recherche bénéficie de l'augmentation du nombre de génomes séquencés et de la puissance des outils informatiques. Une des applications majeures de la génomique comparative est la découverte de gènes et de leurs séquences régulatrices non codantes basée sur le principe de conservation. المحاذاة (عمل مطابقة)لكامل للجينوم هي عادة طريقة المثلى\المستخدمة في علم الجينوم المقارن. تكشف هذه المحاذاة (المطابقة) لثمانية جينومات بكتريا يرسينيا (Yersinia bacteria) عن 78 كتلة متداخلة محليًا (حيث أن إعادة التركيب يمكن أن تتسبب في إعادة ترتيب الجينوم، فقد يتم إعادة ترتيب المناطق الموروثة من نفس الأصل لأحد الجينومات أو قلبها بالنسبة لجينوم آخر.ولذلك أثناء عملية المحاذاة (المطابقة)، يحدد Mauve الأجزاء المحفوظة (لم يطرأ عليها تغير كبير (على المجموعات الوظيفية) على جيناتها عبر الزمن) التي تبدو خالية داخليًا (في نفس الجينوم) من إعادة ترتيب الجينوم. يشار إلى هذه المناطق على أنها كتل متداخلة محليًاLCBs).))محفوظة بين جميع الأصناف الثمانية. تم وضع كل كروموسوم بشكل أفقي ويتم إظهار كتل متجانسة في كل جينوم كمناطق متطابقة الألوان مرتبطة عبر الجينومات. المناطق المقلوبة بالنسبة إلى (Y. pestis KIM: وهي العامل المسبب للطاعون الدبلي والتهاب الرئة)يتم نقلها أسفل محور مركز الجينوم. [1] علم الجينوم المقارن) المتعلق بمقارنة السالسل الجينية (هو حقل من البحث البيولوجي الذي يتم فيه مقارنة السمات الجينومية للكائنات الحية المختلفة. ]2[ ]3 ]السمات الجينومية قد تتضمن تسلسل الحمض النووي، الجينات، ترتيب الجينات، السالسل التنظيمية)سلسلة من نيوكليوتيدات الحمض النووي التي تنظم التعبير الجيني (، وغيرها من المعالم البنائية الجينومية. ]3 ]في هذا الفرع من علم الجينوم، تتم مقارنة أجزاء كاملة أو كبيرة من الجينوم الناتجة من مشاريع الجينوم لدراسة أوجه التشابه والختالف البيولوجية األساسية وكذلك العالقات التطورية بين الكائنات الحية. ]2[ ]4[ ]5 ] المبدأ الرئيسي لمقارنة الجينومات هو أن السمات المشتركة لكائنين غالبًا ما يتم تشفيرها داخل الحمض النووي الذي يتم حفظه تطوريًا بينهما. ]6 ]لذلك، تبدأ طرق علم الجينوم المقارن بعمل شكل من أشكال مطابقة)طريقة لترتيب الجينت لنحديد مناطق التشابه (سالسل الجينوم والبحث عن سالسل من أصل مشترك في الجينومات التي تم عمل المطابقة لها والتحقق من مدى حفظ)تشابه (تلك السالسل. بنا ًء على ذلك، يتم استنتاج الجينوم والتطور الجزيئي وهذا بدوره يمكن وضعه في سياق التطور الوراثي أو الوراثة السكانية على سبيل المثال. ]7] بدأت فعليًا ما أن توفر الجينوم الكامل لكائنين)أي جينومات)أسماء بكتيريا)السم العلمي (: بكتريا المستدمية النزلية)influenzae Haemophilus)و الميكوبالزما التناسلية)genitalium Mycoplasma)))في عام 1995، أصبح علم الجينوم المقارن اآلن مكونًا قياسيًا)معياريا: يتم الرجوع إليه (في تحليل كل تسلسل جينوم جديد. ]2[ ]8 ]و مع النفجار الذي حدث في عدد من مشاريع الجينوم نظ ًرا للتطورات الحاصلة في تقنيات تسلسل الحمض النووي، وال سيما طرق/نظريات تسلسل الجيل التالي في أواخر العقد األول من القرن العشرين، أصبح هذا الحقل أكثر تطوراً، الذي يجعل من الممكن التعامل مع العديد من الجينومات في دراسة واحدة. ] 9 ]كشفت علم الجينوم المقارن عن وجود درجات عالية من التشابه بين الكائنات الحية ذات العالقة، مثل البشر والشمبانزي، واألكثر إثارة للدهشة، التشابه بين الكائنات الحية التي تبدو بعيدة الرتباط، مثل البشر والخميرة)السم العلمي للخميرة:Saccharomyces[ .) 4 ]كما أظهرت التنوع الشديد في تكوين الجينات في سالالت تطورية مختلفة. ]8] La genómica comparativa estudia las semejanzas y diferencias entre genomas de diferentes organismos. Es un intento de beneficiarse de la información proporcionada por las firmas de la selección natural para entender la función y los procesos evolutivos que actúan sobre los genomas. Aunque es todavía un campo reciente, promete adquirir nuevas percepciones sobre muchos aspectos de la evolución de las modernas especies. La cantidad total de información contenida en los genomas más complejos (750 Mbp en el caso del ser humano) requiere la automatización de los métodos de la genómica comparativa. La predicción de genes es una aplicación importante de la genómica comparativa, como también lo es el descubrimiento de nuevos y no codificantes, pero funcionales, elementos del genoma. La genómica comparativa se aprovecha tanto de las similitudes como de las diferencias en las proteínas, ARN, y regiones reguladoras de diferentes organismos para inferir cómo la selección natural ha actuado sobre tales elementos. Aquellos elementos que son responsables de similitudes entre diferentes especies se conservarían a través del tiempo (selección estabilizadora), mientras que los elementos responsables de las diferencias entre especies deberían divergir (selección direccional). Finalmente, aquellos elementos que no son importantes para los sucesos evolutivos del organismo no serán conservados (la selección es neutral). La identificación de los mecanismos de la evolución del genoma eucariota mediante genómica comparativa es uno de los objetivos importantes de esta área. Sin embargo, a menudo es complicado dada la multiplicidad de eventos que han tenido lugar a través de la historia de linajes individuales, dejando sólo trazas distorsionadas y superpuestas en el genoma de cada organismo vivo. Por esta razón, los estudios por genómica comparativa de pequeños organismos modelo (la levadura, por ejemplo) son de gran importancia para avanzar en nuestro conocimiento de los mecanismos generales de la evolución. 비교유전체학이란 인간 유전체 연구를 위해서 여러 생물종을 모델로 이용하여 인체 생명현상 및 질환을 연구하는 것을 말한다. 미생물이나 초파리 및 생쥐에서 인체 질환 모델을 분석하고 유전체의 변화를 비교 연구하거나 다른 생물의 변이형을 이용하여 인간 생명현상을 연구할 수 있다. 유전체 염기서열을 분석하거나 단백질, 구조 및 대사산물의 비교 연구를 통하여 각 생명체간의 진화학적 비교연구와 질환연구의 능력을 배양한다. 또한 사람들마다 유전체 염기서열간에 차이가 있고 이는 개인의 차이와 질병 감수성, 약물 반응성 등에 차이를 가져올 수 있다. 일염기다형성(Single nucleotide polymorphism)의 연구를 통하여 인간 다양성을 연구할 수 있고 어떻게 질환 발생에 영향을 주는지 알 수 있다. 이와 같은 비교유전체학 연구분야의 최신 지견과 연구방법을 숙지함으로써 생명정보를 활용하는 능력을 배양한다. 比較ゲノミクス(ひかく-、英語Comparative genomics)とは、異なる生物の間でゲノムの構造を比較することにより、それらの進化上の関係、および進化の過程を推定する研究をいう。進化の過程でどのような選択が働いたかを、ゲノム情報に残された痕跡から明らかにしようとするものである。ゲノムプロジェクトの進展によって生まれた新しい分野であり、生物の進化の歴史に関する多くの情報をもたらすものと期待されている。 遺伝子配列の比較により進化系統を明らかにする分子系統解析は20世紀末から盛んに行われているが、これは特定の1種類ないし数種類の遺伝子を対象とする。この方法でかなり確実性の高い系統樹を描くことができるが、このような変化は一般には進化の原因というより結果であって、進化と遺伝子との関係、そして進化の具体的な様相を明らかにするには、多数の遺伝子(さらに遺伝子以外の部分も)について比較を行う比較ゲノミクスの方法が必要である。ゲノム全体の情報量からいって、比較ゲノミクスにはコンピュータの利用が不可欠である。 塩基配列から、遺伝子および機能的に重要なノンコーディング領域を発見する方法は、バイオインフォマティクスの重要なテーマであり、比較ゲノミクスの基盤ともなるが、逆に比較ゲノミクスの進展により、この方法論の研究が促進されている面もある。 比較ゲノミクスでは、異なる生物の遺伝子や調節領域の相同性から、それらに対して選択がどう働いたかが推定される。それらが保存されるような選択が働いたならば配列類似性が高く、変化するように選択されたならば配列類似性は低くなるはずである。また全く選択が働かなかったならば保存されない(中立)。 相同性のある遺伝子は、共通の祖先遺伝子から分化したと推定される。1つの生物にこのような遺伝子が複数(機能的にはある程度異なる)ある場合、このような遺伝子を互いにパラログという。一方、別の生物にあり相同性があって機能的にも対応する遺伝子、つまり種の分化とともに分かれたと考えられる遺伝子の組み合わせをオーソログという。2つの生物種に共通のパラログの組み合わせがあれば、種の分化以前に遺伝子の分化が起きたことになり、これらの関係から、遺伝子の分化と種の分化の時間的関係を推定することが可能である。ただし進化過程での遺伝子の消滅や機能の変化により、オーソログとパラログの区別を誤るなどの可能性があるので、注意が必要である。この点を確実にするためにも、多数の生物種のゲノムを比較することが役立つ。 比较基因组学(Comparative genomics)是基于基因组图谱和,对已知的基因特征和基因组结构进行比较以了解基因的功能、表达机制和不同物种的生物学研究。基因组的特征可包括的DNA序列,基因,基因顺序,调控序列,和其它的基因组结构标志。
gold:hypernym
dbr:Field
skos:closeMatch
n42:comparative-genomics
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:Comparative_genomics?oldid=1114099912&ns=0
dbo:wikiPageLength
42668
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:Comparative_genomics