This HTML5 document contains 82 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
n10http://dbpedia.org/resource/File:
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
n13https://global.dbpedia.org/id/
n5https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/MICROBES/
schemahttp://schema.org/
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
n9http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
dbpedia-arhttp://ar.dbpedia.org/resource/
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
dbphttp://dbpedia.org/property/
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
n14http://ccb.jhu.edu/software/glimmer/
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/
n22http://cbcb.umd.edu/software/ELPH/

Statements

Subject Item
dbr:GLIMMER
rdf:type
dbo:Software owl:Thing wikidata:Q7397 dbo:Work wikidata:Q386724 schema:CreativeWork
rdfs:label
GLIMMER جليمير
rdfs:comment
In bioinformatics, GLIMMER (Gene Locator and Interpolated Markov ModelER) is used to find genes in prokaryotic DNA. "It is effective at finding genes in bacteria, archea, viruses, typically finding 98-99% of all relatively long protein coding genes". GLIMMER was the first system that used the interpolated Markov model to identify coding regions. The GLIMMER software is open source and is maintained by Steven Salzberg, Art Delcher, and their colleagues at the Center for Computational Biology at Johns Hopkins University. The original GLIMMER algorithms and software were designed by Art Delcher, Simon Kasif and Steven Salzberg and applied to bacterial genome annotation in collaboration with Owen White. في المعلوماتية الحيوية، جليمير (بالإنجليزية: GLIMMER)‏ هو محدد للجينات ومحرف ماركوف يستخدم ل البحث عن الجينات في خلايا بدائية النواة الحمض النووي. «إنه فعال في العثور على الجينات في البكتيريا، آرتشيا، الفيروسات، عادة ما تجد 98-99% من جميع طويلة نسبيا جينات ترميز البروتين». كان جليمير النظام الأول الذي استخدم محرف نموذج ماركوف لتحديد مناطق الترميز. برنامج جليمير مفتوح المصدر ويحتفظ بها ستيفن سالزبيرغ، ديلشر الفن، وزملائهم في مركز البيولوجيا الحاسوبية في جامعة جونز هوبكنز. وقد تم تصميم خوارزميات جليميرالأصلي والبرمجيات من قبل الفن ديلشر، سيمون كاسيف وستيفن سالزبرغ وتطبيقها على الشرح الجينوم البكتيرية بالتعاون مع أوين وايت.
foaf:name
GLIMMER
foaf:homepage
n14:index.shtml
dbp:name
GLIMMER
foaf:depiction
n9:Case2.png n9:Case3.png n9:Case4.png n9:Case_1.png
dcterms:subject
dbc:Markov_models dbc:Bioinformatics
dbo:wikiPageID
1854663
dbo:wikiPageRevisionID
1097364135
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Gibbs_sampling dbr:Genetic_code dbr:Owen_White dbr:Compiler dbc:Bioinformatics dbr:Ribosomal_binding_site dbr:African_trypanosomiasis dbc:Markov_models n10:Case_1.png dbr:Oligomer dbr:Trypanosoma_brucei dbr:Training_set dbr:Markov_model dbr:Open_reading_frame dbr:Noncoding_DNA n10:Case2.png n10:Case3.png dbr:DNA n10:Case4.png dbr:K-mer dbr:Viruses dbr:Minimum_description_length dbr:GeneMark dbr:Interpolated dbr:Bacteria dbr:Genbank dbr:Archea dbr:Gene_prediction dbr:National_Center_for_Biotechnology_Information dbr:Bioinformatics dbr:Sequence_motif dbr:Amino_acid dbr:Haemophilus_influenzae dbr:Steven_Salzberg dbr:Johns_Hopkins_University
dbo:wikiPageExternalLink
n5:glimmer_3.cgi n22: n14:index.shtml
owl:sameAs
n13:4jpy4 freebase:m.06183r dbpedia-ar:جليمير wikidata:Q5513624
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Release_date dbt:Infobox_software dbt:Reflist
dbo:thumbnail
n9:Case_1.png?width=300
dbp:developer
Steven Salzberg & Arthur Delcher
dbp:genre
Bioinformatics tool
dbp:language
C++
dbp:latestReleaseDate
2006-05-09
dbp:latestReleaseVersion
3.02
dbp:license
OSI Certified Open Source Software under the Artistic License
dbp:website
n14:index.shtml
dbo:abstract
In bioinformatics, GLIMMER (Gene Locator and Interpolated Markov ModelER) is used to find genes in prokaryotic DNA. "It is effective at finding genes in bacteria, archea, viruses, typically finding 98-99% of all relatively long protein coding genes". GLIMMER was the first system that used the interpolated Markov model to identify coding regions. The GLIMMER software is open source and is maintained by Steven Salzberg, Art Delcher, and their colleagues at the Center for Computational Biology at Johns Hopkins University. The original GLIMMER algorithms and software were designed by Art Delcher, Simon Kasif and Steven Salzberg and applied to bacterial genome annotation in collaboration with Owen White. في المعلوماتية الحيوية، جليمير (بالإنجليزية: GLIMMER)‏ هو محدد للجينات ومحرف ماركوف يستخدم ل البحث عن الجينات في خلايا بدائية النواة الحمض النووي. «إنه فعال في العثور على الجينات في البكتيريا، آرتشيا، الفيروسات، عادة ما تجد 98-99% من جميع طويلة نسبيا جينات ترميز البروتين». كان جليمير النظام الأول الذي استخدم محرف نموذج ماركوف لتحديد مناطق الترميز. برنامج جليمير مفتوح المصدر ويحتفظ بها ستيفن سالزبيرغ، ديلشر الفن، وزملائهم في مركز البيولوجيا الحاسوبية في جامعة جونز هوبكنز. وقد تم تصميم خوارزميات جليميرالأصلي والبرمجيات من قبل الفن ديلشر، سيمون كاسيف وستيفن سالزبرغ وتطبيقها على الشرح الجينوم البكتيرية بالتعاون مع أوين وايت.
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:GLIMMER?oldid=1097364135&ns=0
dbo:wikiPageLength
20681
dbo:latestReleaseDate
2006-05-09
dbo:latestReleaseVersion
3.02
dbo:genre
dbr:Bioinformatics
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:GLIMMER