This HTML5 document contains 210 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
n23http://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
n26http://www.yandell-lab.org/software/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/
n43http://www.jstacs.de/index.php/
n40http://cbcb.umd.edu/software/
dbpedia-shhttp://sh.dbpedia.org/resource/
dbpedia-arhttp://ar.dbpedia.org/resource/
n4https://web.archive.org/web/20080915090738/http:/www.cebitec.uni-bielefeld.de/groups/brf/software/gismo/
n19http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
dbpedia-frhttp://fr.dbpedia.org/resource/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n30http://dbpedia.org/resource/File:
dbphttp://dbpedia.org/property/
n12https://web.archive.org/web/20110818235355/http:/www.cbcb.umd.edu/software/GlimmerHMM/
n32https://web.archive.org/web/20110826005802/http:/www.cbcb.umd.edu/software/glimmer/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
dbpedia-srhttp://sr.dbpedia.org/resource/
n34http://genome.imim.es/software/geneid/
dbpedia-pthttp://pt.dbpedia.org/resource/
n48http://web.mit.edu/star/orf/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
n35http://genome.imim.es/software/sgp2/
dbpedia-dehttp://de.dbpedia.org/resource/
dbpedia-plhttp://pl.dbpedia.org/resource/
n31http://www.mgene.org/
yagohttp://dbpedia.org/class/yago/
dbpedia-ruhttp://ru.dbpedia.org/resource/
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
n39http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/
n44https://global.dbpedia.org/id/
yago-reshttp://yago-knowledge.org/resource/
n46http://www.scfbio-iitd.res.in/research/
dbpedia-cahttp://ca.dbpedia.org/resource/
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
n15http://bs.dbpedia.org/resource/
dbpedia-zhhttp://zh.dbpedia.org/resource/
n28http://linux1.softberry.com/
n38https://web.archive.org/web/20061116041807/http:/www.genomethreader.org/
dbpedia-fahttp://fa.dbpedia.org/resource/
dbpedia-trhttp://tr.dbpedia.org/resource/
dbpedia-eshttp://es.dbpedia.org/resource/
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#

Statements

Subject Item
dbr:Gene_prediction
rdf:type
yago:Worker109632518 yago:WikicatMarkovModels yago:CausalAgent100007347 yago:Person100007846 yago:Whole100003553 yago:Object100002684 yago:LivingThing100004258 yago:Assistant109815790 yago:Organism100004475 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Model110324560 yago:YagoLegalActor yago:YagoLegalActorGeo
rdfs:label
Gene prediction Prédiction de gènes تنبؤ بالمورثات Przewidywanie genów Predicció de gens Предсказание генов Predição de genes Genvorhersage 基因预测 Predicción de genes
rdfs:comment
Предсказа́ние ге́нов — это определение кодирующих и регуляторных последовательностей ДНК в геноме: белковых генов и генов некодирующих РНК, промоторов, энхансеров и прочее. Ранние методы поиска генов основывались на трудоёмких экспериментах с живыми организмами и клетками, которые давали лишь приближённый результат. Статистический анализ частот кроссинговера между известными генами позволял узнать, как они расположены на хромосоме относительно друг друга, и в итоге составить генетическую карту. Сегодня же, благодаря развитию компьютерной техники и методов , предсказание генов стало рутинной задачей в биоинформатике. En bio-informatique, la prédiction de gènes consiste à identifier les zones de l'ADN qui correspondent à des gènes (le reste étant non codant). إيجاد المورثات مصطلح يشير إلى أحد حقول علم الأحياء الحاسوبي الذي يهتم بالتمييز الخوارزمي لقطع من التسلسلات، عادة ما تكون جينومية من الدنا الوراثي، الفعال بيولوجيا. يتضمن هذا عادة الجينات المشفرة للبروتينات لكن يمكن أن تتضمن أيضا عناصر وظيفية أخرى مثل regulatory regions. إيجاد المرثات هي أحد أول وأهم الخطوات في فهم الجينوم للأنواع حالما يتم الانتهاء من عملية ومعرفة التسلسل الدقيق. In computational biology, gene prediction or gene finding refers to the process of identifying the regions of genomic DNA that encode genes. This includes protein-coding genes as well as RNA genes, but may also include prediction of other functional elements such as regulatory regions. Gene finding is one of the first and most important steps in understanding the genome of a species once it has been sequenced. Gene prediction is one of the key steps in genome annotation, following sequence assembly, the filtering of non-coding regions and repeat masking. 基因預測，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和。基因识别是基因组研究的基础。 在早期，基因识别的主要手段是基于活的细胞或生物的实验。通过对若干种不同基因的同源重组的速率的统计分析，我们能够获知它们在染色体上的顺序。若进行大量类似的分析，我们可以确定各个基因的大致位置。现在，由于人类已经获得了巨大数量的基因组信息，依靠较慢的实验分析已不能满足基因识别的需要，而基于计算机算法的基因识别得到了长足的发展，成为了基因识别的主要手段。 识别具有生物学功能的片段与判定该片段（或其对应的产品）的功能是两个不同的概念，后者通常需要通过基因敲除等的实验手段来决定。不过，生物信息学的前沿研究正在使得由基因序列预测基因功能变得愈发可能。 Os mecanismos ou processos de predição de genes (gene prediction em inglês, ou tambiém gene finding, literalmente descobrimento de genes) são aqueles que, dentro da área da biologia computacional, se utilizam para a identificação algorítmica de troços de sequência, usualmente ADN genómico, e que são biologicamente funcionais. Isto, especialmente, inclui os genes codificadores de proteínas, mas também poderia incluir outros elementos funcionais tais como e . A identificação de genes é um dos primeiros e mais importantes passos para entender o genoma de uma espécie uma vez tenha sido sequenciado. Los mecanismos o procesos de predicción de genes (gene prediction en inglés, o también gene finding, literalmente descubrimiento de genes) son aquellos que, dentro del área de la biología computacional, se utilizan para la identificación algorítmica de trozos de secuencia, usualmente ADN genómico, y que son biológicamente funcionales. Esto, especialmente, incluye los genes codificantes de proteínas, pero también podría incluir otros elementos funcionales tales como genes ARN y secuencias reguladoras. La identificación de genes es uno de los primeros y más importantes pasos para entender el genoma de una especie una vez ha sido secuenciado. Przewidywanie genów to procedura służąca identyfikacji regionów DNA w genomie które odpowiedzialne są za kodowanie białek. W biologicznych bazach danych deponowanych jest coraz więcej sekwencji genomów różnych organizmów, jednak ich przetwarzanie stanowi istotny problem. Przewidywanie genów jest jednym z pierwszych i najważniejszych kroków w zrozumieniu genomu organizmu. Określenie, czy sekwencja jest funkcjonalna różni się od zagadnienia określania funkcji genu. Przewidywanie funkcji genu i potwierdzenie istotności przewidywań wciąż wymaga eksperymentów in vivo. Els mecanismes o processos de predicció de gens ( general Prediction en anglès, o també general finding, literalment descobriment de gens) són aquells que, dins l'àrea de la biologia computacional, s'utilitzen per a la identificació algorísmica de trossos de seqüència, usualment ADN genòmic, i que són biològicament funcionals. Això, especialment, inclou els gens codificants de proteïnes, però també podria incloure altres elements funcionals com ara i seqüències reguladores. La identificació de gens és un dels primers i més importants passos per entendre el genoma d'una espècie un cop ha estat seqüenciat. Unter Genvorhersage oder Annotation versteht man das A-priori-Auffinden von Genen innerhalb einer Nukleotidsequenz anhand von typischen Mustern wie beispielsweise Promotor, Start und Stopsignale von Introns. Dazu werden im Rahmen der Bioinformatik verschiedene Rechenmethoden und Algorithmen verwendet, darunter statistische Sequenzanalyse, Markow-Ketten, künstliche neuronale Netze zur Mustererkennung, und andere. Die Vorhersage der Gene kann mit Hilfe der Sequenzierung von cDNA aus mRNA verifiziert werden. Ein Beispiel für ein bekanntes Modell zur Genvorhersage ist das Programm GENSCAN.
foaf:depiction
n19:Gene_Prediction.png n19:Gene_structure.svg
dcterms:subject
dbc:Mathematical_and_theoretical_biology dbc:Markov_models dbc:Bioinformatics
dbo:wikiPageID
579390
dbo:wikiPageRevisionID
1100092863
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Protein–protein_interaction dbr:Protein–protein_interaction_prediction dbr:Artificial_neural_network dbr:Discriminative_model dbr:Open_reading_frame dbr:List_of_gene_prediction_software dbr:Computational_biology dbr:BLAST dbr:Ribosomal_binding_site dbr:Genome_annotation dbr:RNA_gene dbr:Transcriptome dbr:Sequencing dbr:Natural_selection dbr:Genome dbr:Genetic_code dbr:Transcription_factors dbr:Chromosome dbr:Expressed_sequence_tag dbr:Hidden_Markov_model dbr:Transcription_(genetics) dbr:GENSCAN dbr:DNA_microarray dbr:Comparative_genomics dbr:Protein_structure_prediction dbr:Protein_function_prediction dbc:Mathematical_and_theoretical_biology dbr:In_vivo dbr:Conditional_random_field dbr:Pribnow_box dbr:Promoter_(genetics) dbr:Random_sequence dbr:Pattern_recognition dbr:Probabilistic_model dbr:Translation_(biology) dbr:Pseudogenes dbr:Pseudogene_(database) dbr:Compositional_domain dbr:Horizontal_gene_transfer dbr:Transcription_factor dbr:Machine_learning dbr:Homology_(biology) dbr:Functional_genomics dbr:Frequency dbr:GLIMMER dbr:Omics dbr:Geneid dbr:Metabolomics dbr:Ab_initio dbr:Binding_site dbr:Phylogenetic_footprinting dbr:Fractal_dimension dbr:Operon dbr:Eukaryotes dbr:Metagenomics dbr:DNA_sequencing dbr:Homologous_recombination dbr:DNA-binding_proteins n30:Gene_structure.svg dbr:Frameshift_mutation dbr:Transcriptomics dbr:Support_vector_machines dbr:DNA_sequence dbr:MGene dbr:Introns dbr:RNA_splicing dbc:Markov_models dbr:Protein dbr:Promoter_(biology) dbr:DNA dbr:Fourier_transform dbr:Sequence_mining dbr:Messenger_RNA dbr:Biochemistry dbr:Cell_(biology) dbr:Exons dbr:Type_I_and_type_II_errors dbr:Overlapping_gene dbr:FASTA dbr:Structural_genomics dbr:GeneMark dbr:Isochore_(genetics) dbr:ChIP-sequencing dbr:CpG_island dbc:Bioinformatics dbr:Gene_knockout dbr:Genomic dbr:Smith–Waterman_algorithm dbr:Gene dbr:Regulatory_regions dbr:Gene_expression dbr:RNA-Seq dbr:Polyadenylation dbr:Sequence_assembly dbr:Genetic_map dbr:RefSeq dbr:Binding_sites dbr:Proteomics dbr:Expressed_sequence_tags dbr:Bioinformatics dbr:Z-curve dbr:Sequence_homology dbr:Base_pair dbr:K-mer dbr:Genes dbr:Regulation_of_gene_expression n30:Gene_Prediction.png dbr:List_of_distinct_cell_types_in_the_adult_human_body dbr:Artificial_neural_networks dbr:Hidden_Markov_support_vector_machine dbr:Stop_codon dbr:Secondary_structure dbr:Ensembl dbr:Prokaryotes
dbo:wikiPageExternalLink
n4: n23: n26:maker.html n28:berry.phtml%3Ftopic=fgenesh&group=programs&subgroup=gfind n31: n12: n32: n34: n35: n38: n39: n40:GlimmerHMM n40:glimmer n43:GeMoMa n46:genepredictor.htm n48:
owl:sameAs
dbpedia-tr:Gen_bulma dbpedia-de:Genvorhersage dbpedia-pt:Predição_de_genes dbpedia-ru:Предсказание_генов dbpedia-zh:基因预测 n15:Predviđanje_gena yago-res:Gene_prediction freebase:m.02s0h3 dbpedia-pl:Przewidywanie_genów dbpedia-ca:Predicció_de_gens dbpedia-sr:Predviđanje_gena dbpedia-es:Predicción_de_genes dbpedia-fr:Prédiction_de_gènes dbpedia-ar:تنبؤ_بالمورثات wikidata:Q1248292 n44:HSJJ dbpedia-fa:ژن‌یابی dbpedia-sh:Predviđanje_gena
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Webarchive dbt:Biology-footer dbt:Reflist dbt:Genomics-footer
dbo:thumbnail
n19:Gene_structure.svg?width=300
dbp:date
2011-08-18 2011-08-26
dbp:url
n12: n32:
dbo:abstract
Los mecanismos o procesos de predicción de genes (gene prediction en inglés, o también gene finding, literalmente descubrimiento de genes) son aquellos que, dentro del área de la biología computacional, se utilizan para la identificación algorítmica de trozos de secuencia, usualmente ADN genómico, y que son biológicamente funcionales. Esto, especialmente, incluye los genes codificantes de proteínas, pero también podría incluir otros elementos funcionales tales como genes ARN y secuencias reguladoras. La identificación de genes es uno de los primeros y más importantes pasos para entender el genoma de una especie una vez ha sido secuenciado. Os mecanismos ou processos de predição de genes (gene prediction em inglês, ou tambiém gene finding, literalmente descobrimento de genes) são aqueles que, dentro da área da biologia computacional, se utilizam para a identificação algorítmica de troços de sequência, usualmente ADN genómico, e que são biologicamente funcionais. Isto, especialmente, inclui os genes codificadores de proteínas, mas também poderia incluir outros elementos funcionais tais como e . A identificação de genes é um dos primeiros e mais importantes passos para entender o genoma de uma espécie uma vez tenha sido sequenciado. A predição gênica dita de novo é um método em que são utilizadas apenas sequencias de um ou mais genomas, não sendo utilizado para tanto, nenhuma sequencia derivada de RNA ou proteínas. إيجاد المورثات مصطلح يشير إلى أحد حقول علم الأحياء الحاسوبي الذي يهتم بالتمييز الخوارزمي لقطع من التسلسلات، عادة ما تكون جينومية من الدنا الوراثي، الفعال بيولوجيا. يتضمن هذا عادة الجينات المشفرة للبروتينات لكن يمكن أن تتضمن أيضا عناصر وظيفية أخرى مثل regulatory regions. إيجاد المرثات هي أحد أول وأهم الخطوات في فهم الجينوم للأنواع حالما يتم الانتهاء من عملية ومعرفة التسلسل الدقيق. Предсказа́ние ге́нов — это определение кодирующих и регуляторных последовательностей ДНК в геноме: белковых генов и генов некодирующих РНК, промоторов, энхансеров и прочее. Ранние методы поиска генов основывались на трудоёмких экспериментах с живыми организмами и клетками, которые давали лишь приближённый результат. Статистический анализ частот кроссинговера между известными генами позволял узнать, как они расположены на хромосоме относительно друг друга, и в итоге составить генетическую карту. Сегодня же, благодаря развитию компьютерной техники и методов , предсказание генов стало рутинной задачей в биоинформатике. Необходимо различать предсказание функциональных участков от предсказания функции или продукта гена. Строгое определение функции или доказательство существования какого-либо белка может основываться только на экспериментальной работе, хотя современной биоинформатике уже удаётся с высокой точностью определять функцию гена только по его последовательности. Предсказание генов — один из ключевых этапов в вида, следующий за маскированием повторов и оценкой качества его сборки. Существует множество алгоритмов, разработанных в последние десятилетия, позволяющих определить точное положение гена в геноме. Существуют три основных подхода к предсказанию генов в геноме: эмпирический (внешний), неэмпирический (внутренний, ab initio) и смешанный. Przewidywanie genów to procedura służąca identyfikacji regionów DNA w genomie które odpowiedzialne są za kodowanie białek. W biologicznych bazach danych deponowanych jest coraz więcej sekwencji genomów różnych organizmów, jednak ich przetwarzanie stanowi istotny problem. Przewidywanie genów jest jednym z pierwszych i najważniejszych kroków w zrozumieniu genomu organizmu. Określenie, czy sekwencja jest funkcjonalna różni się od zagadnienia określania funkcji genu. Przewidywanie funkcji genu i potwierdzenie istotności przewidywań wciąż wymaga eksperymentów in vivo. Els mecanismes o processos de predicció de gens ( general Prediction en anglès, o també general finding, literalment descobriment de gens) són aquells que, dins l'àrea de la biologia computacional, s'utilitzen per a la identificació algorísmica de trossos de seqüència, usualment ADN genòmic, i que són biològicament funcionals. Això, especialment, inclou els gens codificants de proteïnes, però també podria incloure altres elements funcionals com ara i seqüències reguladores. La identificació de gens és un dels primers i més importants passos per entendre el genoma d'una espècie un cop ha estat seqüenciat. En bio-informatique, la prédiction de gènes consiste à identifier les zones de l'ADN qui correspondent à des gènes (le reste étant non codant). Unter Genvorhersage oder Annotation versteht man das A-priori-Auffinden von Genen innerhalb einer Nukleotidsequenz anhand von typischen Mustern wie beispielsweise Promotor, Start und Stopsignale von Introns. Dazu werden im Rahmen der Bioinformatik verschiedene Rechenmethoden und Algorithmen verwendet, darunter statistische Sequenzanalyse, Markow-Ketten, künstliche neuronale Netze zur Mustererkennung, und andere. Zur besseren Differenzierung werden beispielsweise Informationen über die offenen Leserahmen (ORF) genutzt.Da Prokaryoten keine Introns besitzen, muss das Gen in einer fortlaufenden Sequenz zwischen Startcodon und Stopcodon liegen. Die Vorhersage der Gene kann mit Hilfe der Sequenzierung von cDNA aus mRNA verifiziert werden. Ein Beispiel für ein bekanntes Modell zur Genvorhersage ist das Programm GENSCAN. 基因預測，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和。基因识别是基因组研究的基础。 在早期，基因识别的主要手段是基于活的细胞或生物的实验。通过对若干种不同基因的同源重组的速率的统计分析，我们能够获知它们在染色体上的顺序。若进行大量类似的分析，我们可以确定各个基因的大致位置。现在，由于人类已经获得了巨大数量的基因组信息，依靠较慢的实验分析已不能满足基因识别的需要，而基于计算机算法的基因识别得到了长足的发展，成为了基因识别的主要手段。 识别具有生物学功能的片段与判定该片段（或其对应的产品）的功能是两个不同的概念，后者通常需要通过基因敲除等的实验手段来决定。不过，生物信息学的前沿研究正在使得由基因序列预测基因功能变得愈发可能。 In computational biology, gene prediction or gene finding refers to the process of identifying the regions of genomic DNA that encode genes. This includes protein-coding genes as well as RNA genes, but may also include prediction of other functional elements such as regulatory regions. Gene finding is one of the first and most important steps in understanding the genome of a species once it has been sequenced. In its earliest days, "gene finding" was based on painstaking experimentation on living cells and organisms. Statistical analysis of the rates of homologous recombination of several different genes could determine their order on a certain chromosome, and information from many such experiments could be combined to create a genetic map specifying the rough location of known genes relative to each other. Today, with comprehensive genome sequence and powerful computational resources at the disposal of the research community, gene finding has been redefined as a largely computational problem. Determining that a sequence is functional should be distinguished from determining the function of the gene or its product. Predicting the function of a gene and confirming that the gene prediction is accurate still demands in vivo experimentation through gene knockout and other assays, although frontiers of bioinformatics research are making it increasingly possible to predict the function of a gene based on its sequence alone. Gene prediction is one of the key steps in genome annotation, following sequence assembly, the filtering of non-coding regions and repeat masking. Gene prediction is closely related to the so-called 'target search problem' investigating how DNA-binding proteins (transcription factors) locate specific binding sites within the genome. Many aspects of structural gene prediction are based on current understanding of underlying biochemical processes in the cell such as gene transcription, translation, protein–protein interactions and regulation processes, which are subject of active research in the various omics fields such as transcriptomics, proteomics, metabolomics, and more generally structural and functional genomics.
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:Gene_prediction?oldid=1100092863&ns=0
dbo:wikiPageLength
29581
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:Gene_prediction