This HTML5 document contains 53 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
n6http://dbpedia.org/resource/File:
n21https://global.dbpedia.org/id/
dbpedia-ruhttp://ru.dbpedia.org/resource/
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
n10http://www.polonator.org/
n19https://web.archive.org/web/20130521212447/http:/polonator.org/
n12http://arep.med.harvard.edu/Polonator/
n18http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
dbphttp://dbpedia.org/property/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/

Statements

Subject Item
dbr:Polony_sequencing
rdfs:label
Полони-секвенирование Polony sequencing
rdfs:comment
Polony sequencing is an inexpensive but highly accurate multiplex sequencing technique that can be used to “read” millions of immobilized DNA sequences in parallel. This technique was first developed by Dr. George Church's group at Harvard Medical School. Unlike other sequencing techniques, Polony sequencing technology is an open platform with freely downloadable, open source software and protocols. Also, the hardware of this technique can be easily set up with a commonly available epifluorescence microscopy and a computer-controlled flowcell/fluidics system. Polony sequencing is generally performed on paired-end tags library that each molecule of DNA template is of 135 bp in length with two 17–18 bp paired genomic tags separated and flanked by common sequences. The current read length of Полони-секвенирование (англ. polymerase colony — «полимеразная колония») — технология секвенирования нового поколения (NGS) без электрофоретического разделения, позволяющая прочитывать миллионы коротких иммобилизованных последовательностей ДНК, значительно более дешевая по сравнению с секвенированием по Сэнгеру.
foaf:depiction
n18:Illustrated_procedure_for_Polony_Sequencing.png
dcterms:subject
dbc:DNA_sequencing_methods dbc:Genetics_techniques
dbo:wikiPageID
26405771
dbo:wikiPageRevisionID
1123483609
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Bacterial_Artificial_Chromosome dbr:Primer_(molecular_biology) n6:Illustrated_procedure_for_Polony_Sequencing.png dbr:Personal_Genome_Project dbc:DNA_sequencing_methods dbc:Genetics_techniques dbr:Biotin dbr:Polystyrene dbr:Dover_Corporation dbr:Polony_(biology) dbr:Multiplex_sequencing_technique dbr:ABI_Solid_Sequencing dbr:Degenerate_bases dbr:Streptavidin dbr:Epifluorescence_microscopy dbr:Harvard_Medical_School dbr:Rolling_circle_replication dbr:Teflon dbr:Sequencing_by_ligation dbr:Nonamer dbr:Polonator dbr:Dr._George_Church dbr:Polymerase_chain_reaction dbr:Paired-end_tags dbr:Nick_translation dbr:Annealing_(biology)
dbo:wikiPageExternalLink
n10: n12: n19:
owl:sameAs
dbpedia-ru:Полони-секвенирование wikidata:Q7225962 freebase:m.0bbwk7v n21:4u67a
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:More_citations_needed dbt:Citation_needed dbt:Cite_web
dbo:thumbnail
n18:Illustrated_procedure_for_Polony_Sequencing.png?width=300
dbo:abstract
Полони-секвенирование (англ. polymerase colony — «полимеразная колония») — технология секвенирования нового поколения (NGS) без электрофоретического разделения, позволяющая прочитывать миллионы коротких иммобилизованных последовательностей ДНК, значительно более дешевая по сравнению с секвенированием по Сэнгеру. Технология была разработана в лаборатории доктора Джорджа Черча в Гарварде (Гарвардская медицинская школа). По сравнению с другими методиками секвенирования — полони-секвенирование проводится на платформе с открытым исходным кодом и протоколами. Аппаратная платформа данного метода может быть легко комбинирована с широкодоступной и микрофлюидными системами под управлением компьютера. Основная идея метода — генерация большого числа уникальных 'полоний' (молекулярных колоний, сгенерированных полимеразой), которые секвенируются в случайном порядке. Полони-секвенирование проводится для библиотеки парных концевых тэгов: каждая молекула ДНК имеет длину 135 п.о. (пар оснований), содержит два тэга длиной 17-18 п.о., разделённых и фланкированных общей последовательностью. Текущая длина прочтения для этой методики составляет 26 п.о. для ампликона и 13 п.о. для тэга (на каждом тэге остается непрочитанный зазор 4-5 п.о.). Polony sequencing is an inexpensive but highly accurate multiplex sequencing technique that can be used to “read” millions of immobilized DNA sequences in parallel. This technique was first developed by Dr. George Church's group at Harvard Medical School. Unlike other sequencing techniques, Polony sequencing technology is an open platform with freely downloadable, open source software and protocols. Also, the hardware of this technique can be easily set up with a commonly available epifluorescence microscopy and a computer-controlled flowcell/fluidics system. Polony sequencing is generally performed on paired-end tags library that each molecule of DNA template is of 135 bp in length with two 17–18 bp paired genomic tags separated and flanked by common sequences. The current read length of this technique is 26 bases per amplicon and 13 bases per tag, leaving a gap of 4–5 bases in each tag.
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:Polony_sequencing?oldid=1123483609&ns=0
dbo:wikiPageLength
13339
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:Polony_sequencing