This HTML5 document contains 292 embedded RDF statements represented using HTML+Microdata notation.

The embedded RDF content will be recognized by any processor of HTML5 Microdata.

Namespace Prefixes

PrefixIRI
dbthttp://dbpedia.org/resource/Template:
wikipedia-enhttp://en.wikipedia.org/wiki/
n40http://smart.embl-heidelberg.de/smart/
dbpedia-fihttp://fi.dbpedia.org/resource/
dbrhttp://dbpedia.org/resource/
n6https://translate.google.com/translate%3Fclient=tmpg&hl=en&u=http:/bianconiglio06.blogspot.com/2008/11/
dbpedia-shhttp://sh.dbpedia.org/resource/
n32http://www.expasy.org/cgi-bin/
n12http://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/
n37http://
dbpedia-frhttp://fr.dbpedia.org/resource/
dctermshttp://purl.org/dc/terms/
rdfshttp://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#
dbpedia-cshttp://cs.dbpedia.org/resource/
rdfhttp://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#
n22http://dbpedia.org/resource/File:
n21http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/
dbphttp://dbpedia.org/property/
xsdhhttp://www.w3.org/2001/XMLSchema#
dbpedia-ukhttp://uk.dbpedia.org/resource/
dbpedia-srhttp://sr.dbpedia.org/resource/
dbohttp://dbpedia.org/ontology/
dbpedia-pthttp://pt.dbpedia.org/resource/
dbpedia-skhttp://sk.dbpedia.org/resource/
n10http://www.ebi.ac.uk/interpro/potm/2007_3/
dbpedia-jahttp://ja.dbpedia.org/resource/
dbchttp://dbpedia.org/resource/Category:
n20https://web.archive.org/web/20120316175612/http:/znf.igb.illinois.edu/human/
n50http://znf.igb.illinois.edu/human/
dbpedia-plhttp://pl.dbpedia.org/resource/
yagohttp://dbpedia.org/class/yago/
dbpedia-ruhttp://ru.dbpedia.org/resource/
n14https://web.archive.org/web/20160215092327/http:/planttfdb.cbi.pku.edu.cn/
wikidatahttp://www.wikidata.org/entity/
dbpedia-nlhttp://nl.dbpedia.org/resource/
n47http://dbpedia.org/resource/HIV/
goldhttp://purl.org/linguistics/gold/
n27http://www.addgene.org/
yago-reshttp://yago-knowledge.org/resource/
n46https://archive.today/20130113103307/http:/www.zincfingertools.org/
n48https://global.dbpedia.org/id/
n36https://web.archive.org/web/20160422025922/http:/planttfdb.cbi.pku.edu.cn/
n24https://web.archive.org/web/20080531153036/http:/www.rcsb.org/pdb/
dbpedia-ithttp://it.dbpedia.org/resource/
dbpedia-cahttp://ca.dbpedia.org/resource/
provhttp://www.w3.org/ns/prov#
n55http://bs.dbpedia.org/resource/
foafhttp://xmlns.com/foaf/0.1/
n54http://www.rcsb.org/pdb/static.do%3Fp=education_discussion/molecule_of_the_month/
dbpedia-zhhttp://zh.dbpedia.org/resource/
dbpedia-kohttp://ko.dbpedia.org/resource/
dbpedia-glhttp://gl.dbpedia.org/resource/
n39https://web.archive.org/web/20200413060026/https:/web.expasy.org/cgi-bin/
dbpedia-trhttp://tr.dbpedia.org/resource/
dbpedia-fahttp://fa.dbpedia.org/resource/
n49http://bindr.gdcb.iastate.edu/ZiFiT/
dbpedia-eshttp://es.dbpedia.org/resource/
freebasehttp://rdf.freebase.com/ns/
owlhttp://www.w3.org/2002/07/owl#

Statements

Subject Item
dbr:Zinc_finger
rdf:type
yago:Protein114728724 yago:YagoPermanentlyLocatedEntity yago:PhysicalEntity100001930 dbo:Protein yago:WikicatProteinFolds yago:State100024720 yago:WikicatProteinDomains wikidata:Q8054 yago:Molecule114682133 yago:Macromolecule114944888 yago:Factor107327805 yago:Substance100019613 yago:Fold113907415 yago:Unit109465459 yago:PsychologicalFeature100023100 owl:Thing yago:Thing100002452 yago:AngularShape113864763 yago:Shape100027807 wikidata:Q206229 yago:WikicatTranscriptionFactors yago:Origin107323922 yago:Matter100020827 yago:Abstraction100002137 yago:Beginning107290905 yago:Cause107326557 yago:Chemical114806838 yago:Relation100031921 yago:Part113809207 yago:Attribute100024264 dbo:Biomolecule yago:Compound114818238 yago:Event100029378 yago:WikicatProteins yago:Sphere114514039 yago:Environment113934596 yago:Situation113927383 yago:Happening107283608 yago:OrganicCompound114727670 yago:Material114580897 yago:WikicatDNA-bindingSubstances
rdfs:label
ジンクフィンガー Zinc finger 锌指 Dedo de zinco Zinkvinger Doigt de zinc Palec cynkowy Цинковий палець Dit de zinc Dedo de cinc Dito di zinco 아연 집게 Zinkový prst Цинковый палец
rdfs:comment
Zinkový prst (z angl. zinc finger) je označení pro strukturní motiv běžně nacházený u celé řady bílkovin. Umožňuje především vazbu daných bílkovin na DNA (a RNA) a je proto součástí celé řady tzv. transkripčních faktorů. Je pojmenován podle toho, že má tvar zahnutého prstu, přičemž uvnitř se nachází vazebné místo pro zinek koordinačně navázaný na cysteinový a histidinový zbytek. Os dedos de zinco são domínios proteicos que têm a propriedade de se ligarem ao DNA. Um dedo de zinco é composto por duas folhas-beta antiparalelas e uma alfa-hélice. O íon de zinco é fundamental para garantir a estabilidade deste tipo de domínio. Na ausência do íon, o domínio desdobra-se e torna-se demasiado pequeno para albergar um núcleo hidrofóbico. I motivi a dito di zinco (o, con accezioni leggermente differenti tra loro, zinc finger o zinc cluster) sono specifiche regioni proteiche in grado di legare il DNA. Цинковый палец (англ. zinc finger) — небольшой структурный мотив белка, стабилизированный одним или двумя ионами цинка, связанными координационными связями с аминокислотными остатками в составе белка. Как правило, цинковый палец включает около 20 аминокислот, ион цинка связывает 2 гистидина и 2 цистеина. Цинковые пальцы являются белковыми модулями, взаимодействующими с ДНК, РНК, другими белками или небольшими молекулами. Los dedos de zinc son pequeños motivos estructurales de proteínas que pueden coordinar uno o más iones de zinc para ayudar a estabilizar sus pliegues. Normalmente funcionan como módulos de interacción que unen el ADN, ARN, proteínas y moléculas pequeñas. Estas proteínas tienen un rol estructural esencialmente. Este rol puede consistir en bajar la entalpía de plegamiento de una proteína e inducir una conformación activa, o bien, estabilizar una estructura cuaternaria en particular. El zinc también tiene un rol regulativo, es decir, no participa en los varios pasos catalíticos, pero su presencia sí incrementa la rapidez catalítica.​ El nombre de "dedo de zinc" fue acuñado para describir la hipótesis de la estructura de la unidad repetida del factor de transcripción IIIA en Xenopus laevis. ジンクフィンガー(Zinc finger)はタンパク質ドメインの大きなスーパーファミリーの1つで、DNAに結合する性質を持つ。ジンクフィンガーは2つの逆平行βシートと1つのαヘリックスからなる。小さすぎて疎水中心を持たないため亜鉛イオンが安定化にとって重要である。 Een zinkvinger is een structuurmotief in eiwitten met een zinkion (Zn2+). Het zinkion stabiliseert de eiwitvouwing. De polypeptideketen vormt door het zinkion een lusvormige structuur: de zogenoemde zinkvinger, die een specifieke wisselwerking kan hebben met het DNA of RNA. De zinkvinger werd in 1985 door Aaron Klug ontdekt bij de transcriptiefactor IIIA in de oöcyten van de klauwkikker (Xenopus laevis). Gedacht werd dat de DNA-bindingslus gevormd door de donor-acceptorbinding van de liganden vingers vertegenwoordigden, vandaar de naam zinkvingers. Palec cynkowy, palca cynkowego (ang. zinc finger domain) – rodzaj domeny białkowej występującej w białkach wiążących DNA i biorący bezpośredni udział w związaniu cząsteczki kwasu nukleinowego przez białko. Palec cynkowy składa się z dwóch antyrównoległych β-kartek i α-helisy. Obecność jonu cynku (Zn2+) jest kluczowa dla stabilności domeny – w przypadku jego braku nie dochodzi do powstania wystarczająco dużej domeny posiadającej hydrofobowy rdzeń i przez to funkcjonalnej. 锌指(英語:Zinc finger),又稱鋅手指,是一种小的蛋白质结构模体,其特征在于配合一个或多个锌离子(Zn2+)以稳定折叠。最初用来描述非洲爪蟾卵母细胞假说结构的手指状外观,锌指名称现在已经包含了各种不同的蛋白质结构。 在1983年,非洲爪蟾TFIIIA最初被证明含有锌,并且需要这种金属才能运行,这是被报道的第一个基因调节蛋白中具有锌的要求。 这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征基团与Zn2+的结合来稳定一种很短的,可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。 含有锌指的蛋白(锌指蛋白)被分为几个不同的结构家族。大多數的超二級結構,包括、,都已經被清楚定義。但鋅指的狀況並不是那麼簡單,含有鋅指的蛋白質大約分成幾類,每個鋅指結構都有相當特殊的三級結構,但其加上鋅離子的一級結構也是可以辨認配體。雖然鋅指之間有很大的變異,但大多是都是與DNA、RNA、蛋白質結合。 自从它们最初的发现和它们的结构阐明以来,这些相互作用的模块已经在生物世界中无处不在,并且可以在人类基因组的3%基因中被发现。另外,锌指在各种治疗和研究能力方面已经变得非常有用。研究者會設計出特殊的鋅手指,使其有不同的親合性。鋅指核酸酶和是當今最重要的應用。 Les proteïnes dits de zinc es troben dins del grup de les anomenades metal·loproteïnes, degut a la necessitat d'unir un o més , en aquest cas el zinc, per a dur a terme les seves funcions biològiques, regular les seves activitats o estabilitzar les seves estructures terciàries o quaternàries. Els dominis dits de zinc formen estructures úniques molt sòlides, sostingudes en la majoria dels casos per residus aminoacídics de cisteïnes (C) i histidines (H). Estudis experimentals mostren que quan el zinc és mogut del nucli de les estructures, els residus aminoacídics interaccionen entre si formant grans complexos de proteïnes que perden la seva funcionalitat, pel que l'acció coordinada entre la unió del zinc i el correcte plegament de la proteïna té moltes conseqüències tant químiques com biològ Les doigts de zinc sont de petits motifs structuraux trouvés dans les protéines et capables d'ordonner en complexe un ou plusieurs ions zinc pour stabiliser leur repliement. Ils peuvent être classés en plusieurs familles structurelles différentes (protéines à doigt de zinc) et fonctionnent typiquement comme des groupes d'interaction liant l'ADN, l'ARN, les protéines ou de petites molécules. Le nom « doigt de zinc » a initialement été donné pour décrire l'apparence semblable à des doigts d'un diagramme montrant la structure hypothétique de l'unité répétée dans le de Xenopus laevis. 아연 집게(영어: zinc finger)는 단백질의 접힌 부분을 안정시키기 위해 하나 이상의 아연 이온(Zn2+)이 존재하는 작은 구조 단백질 모티브다. 원래 아프리카발톱개구리의 전사인자 IIIA로부터 가정된 구조의 집게같은 외관을 설명하기 위해 만들어진 아연 집게는 매우 다양한 단백질 구조를 포괄하게 되었다. 아프리카발톱개구리의 TFIIIA는 원래 아연을 함유하고 기능을 위해 금속을 필요로 하는 것으로 1983년에 입증되었다. 유전자 조절 단백질의 아연이 필요하다는 것이 처음 보고되었다. 다중 도메인 단백질에서 금속 결합 도메인으로 나타나는 경우가 많다. 아연 집게는 인간 게놈의 유전자의 3%에서 발견될 수 있다. 게다가 아연 집게는 다양한 치료와 연구 능력에 매우 유용하게 쓰인다. 특정 염기서열에 대한 친화력을 가지는 아연 집게는 활성 연구의 영역이며, 아연 집게 핵산 분해 효소와 아연 집게 전사인자는 현재까지 실현되어야 할 가장 중요한 두 가지 응용 분야이다. A zinc finger is a small protein structural motif that is characterized by the coordination of one or more zinc ions (Zn2+) in order to stabilize the fold. It was originally coined to describe the finger-like appearance of a hypothesized structure from the African clawed frog (Xenopus laevis) transcription factor IIIA. However, it has been found to encompass a wide variety of differing protein structures in eukaryotic cells. Xenopus laevis TFIIIA was originally demonstrated to contain zinc and require the metal for function in 1983, the first such reported zinc requirement for a gene regulatory protein followed soon thereafter by the Krüppel factor in Drosophila. It often appears as a metal-binding domain in multi-domain proteins. Цинковий палець — це невеликий структурний мотив білка, який характеризується координацією одного або декількох іонів цинку (Zn2+) для стабілізації укладки. Спочатку створена для опису гіпотетичної пальцеподібної структури фактора транскрипції IIIA Xenopus laevis, назва цинкового пальця тепер охоплює широкий спектр різних білкових структур. Xenopus laevis TFIIIA спочатку було продемонстровано, що він містить цинк і потребує металу для функціонування в 1983 р., Перше таке повідомлення про необхідність цинку для білка, якщо регулює ген. Він часто з'являється як домен, що зв'язує метал, саме у багатодоменних білках.
dbp:name
zf-C2HC5 Zinc knuckle TFIIB zinc-binding zf-C2HC Fungal Zn-Cys binuclear cluster domain Zinc finger, C2H2 type
foaf:depiction
n12:Zinc_finger_DNA_complex.png n12:PDB_1d66_EBI.jpg n12:PDB_1ncp_EBI.jpg n12:PDB_1pft_EBI.jpg n12:PDB_1pxe_EBI.jpg n12:PDB_1zaa_EBI.jpg n12:Zinc_finger_rendered.png
dcterms:subject
dbc:Protein_structural_motifs dbc:Zinc_finger_proteins dbc:DNA-binding_substances dbc:Protein_domains dbc:Protein_folds
dbo:wikiPageID
234129
dbo:wikiPageRevisionID
1117353449
dbo:wikiPageWikiLink
dbr:Evolution dbr:Zebrafish dbr:Metal-binding_domain dbr:Zinc_finger_nuclease dbr:African_clawed_frog dbr:Protein_domain dbr:Myelin dbr:Nuclear_hormone_receptor dbr:Zinc dbr:Steroid_hormone_receptor dbr:Tobacco dbr:Amino_acid_sequence n22:PDB_1d66_EBI.jpg n22:PDB_1ncp_EBI.jpg n22:PDB_1pft_EBI.jpg n22:PDB_1zaa_EBI.jpg dbr:N-terminus dbc:Protein_structural_motifs dbr:B-box_zinc_finger dbr:Zinc_finger_nuclease_treatment_of_HIV dbr:Protein_folding dbr:Krüppel dbr:Salt_bridge_(protein_and_supramolecular) dbr:Cell_adhesion dbc:Zinc_finger_proteins n22:Zinc_finger_rendered.png dbr:Structural_motif dbr:Transcription_factor dbr:Protein dbr:Extended_x-ray_absorption_fine_structure dbr:Ion dbr:Gene dbr:Coordination_complex dbr:Secondary_structure dbr:Cytoskeleton dbr:Maize dbr:Phage_display n22:Zinc_finger_DNA_complex.png dbr:Transcription_(genetics) dbr:GTF3A dbr:Conformational_change dbr:Histone_acetyltransferase dbr:Eukaryote dbr:Eukaryotes dbr:GC_box dbr:Greek_key_(protein_structure) dbr:Epithelial dbr:Zinc_finger_inhibitor dbr:Rat dbr:RING_finger_domain dbr:Zif268 dbr:Supersecondary_structure dbr:RNA n47:AIDS dbr:Proteins dbc:DNA-binding_substances dbr:DNA dbr:Protein_superfamilies dbr:PROSITE dbr:DNA-binding_protein dbr:Xenopus dbr:Xenopus_laevis dbr:Substrate_(biochemistry) dbr:Zinc_Finger_Transcription_Factor dbr:Histidine dbr:Caenorhabditis_elegans dbr:Sequence_motif dbr:Beta_hairpin dbr:Krüppel_associated_box dbr:Drosophila_melanogaster dbr:Ligands dbr:Zinc_finger_nucleases dbc:Protein_domains dbc:Protein_folds dbr:Zinc_finger_transcription_factors dbr:Cysteine dbr:FokI dbr:Aaron_Klug dbr:TAL_effector dbr:Drosophila dbr:Protein_engineering dbr:Chromatin dbr:Gal4 dbr:Transcription_Activator-Like_Effector_Nuclease dbr:Molecular_binding dbr:Lipid dbr:Protein_motif
dbo:wikiPageExternalLink
n6:la-doppia-elica-fra-le-dita-di-zinco.html&langpair=it%7Cen n10:Page1.htm n20: n21:family.php%3Ffam=C2H2 n24:static.do%3Fp=education_discussion%2Fmolecule_of_the_month%2Fpdb87_1.html n27:zfc n32:nicedoc.pl%3FPDOC00028 n36: n37:zf.princeton.edu n37:www.zincfingers.org n40:do_annotation.pl%3FDOMAIN=ZnF_C2H2 n46: n49: n50: n54:pdb87_1.html n37:planttfdb.cbi.pku.edu.cn n39:unavailable.cgi%3Ftype=redirect&query=nicedoc.pl n14:family.php%3Ffam=C2H2
owl:sameAs
wikidata:Q204785 dbpedia-fr:Doigt_de_zinc dbpedia-cs:Zinkový_prst dbpedia-uk:Цинковий_палець dbpedia-pt:Dedo_de_zinco dbpedia-es:Dedo_de_cinc dbpedia-ja:ジンクフィンガー dbpedia-gl:Dedo_de_cinc dbpedia-pl:Palec_cynkowy dbpedia-fa:انگشت_روی freebase:m.01j071 dbpedia-sh:Cinkov_prst dbpedia-sk:Zinkový_prst yago-res:Zinc_finger dbpedia-ru:Цинковый_палец dbpedia-ko:아연_집게 dbpedia-nl:Zinkvinger dbpedia-sr:Cinkov_prst n48:wu6K dbpedia-it:Dito_di_zinco dbpedia-zh:锌指 dbpedia-tr:Çinko_parmak n55:Cinkov_prst dbpedia-ca:Dit_de_zinc dbpedia-fi:Sinkkisormi
dbp:wikiPageUsesTemplate
dbt:Short_description dbt:Infobox_protein_family dbt:Clear dbt:Webarchive dbt:Portal dbt:Cite_web dbt:Div_col dbt:Div_col_end dbt:Anchor dbt:Transcription_factors dbt:Protein_domains dbt:Reflist
dbo:thumbnail
n12:Zinc_finger_rendered.png?width=300
dbp:prosite
PS51134 PS50158 PS00463 PS00028
dbp:smart
SM00343 GAL4
dbp:caption
solution structure of a cchhc domain of neural zinc finger factor-1
dbp:date
2016-04-22 2012-03-16 2016-02-15 2020-04-13
dbp:interpro
IPR002515 IPR009349 IPR001878 IPR001138 IPR013137 IPR007087
dbp:pfam
PF08271 PF00172 PF01530 PF06221 PF00098 PF00096
dbp:pfamClan
CL0361 Zn_Beta_Ribbon
dbp:symbol
zf-C2HC zf-C2H2 TF_Zn_Ribbon zf-C2HC5 Zn_clus zf-CCHC
dbp:url
n14:family.php%3Ffam=C2H2 n20: n39:unavailable.cgi%3Ftype=redirect&query=nicedoc.pl n36:
dbo:abstract
Цинковий палець — це невеликий структурний мотив білка, який характеризується координацією одного або декількох іонів цинку (Zn2+) для стабілізації укладки. Спочатку створена для опису гіпотетичної пальцеподібної структури фактора транскрипції IIIA Xenopus laevis, назва цинкового пальця тепер охоплює широкий спектр різних білкових структур. Xenopus laevis TFIIIA спочатку було продемонстровано, що він містить цинк і потребує металу для функціонування в 1983 р., Перше таке повідомлення про необхідність цинку для білка, якщо регулює ген. Він часто з'являється як домен, що зв'язує метал, саме у багатодоменних білках. Білки, які містять цинкові пальці, класифікуються на кілька структурних родин. На відміну від багатьох інших чітко визначених надвторинних структур, таких як грецькі ключі або β-шпильки, існує ряд типів цинкових пальців, кожен з яких має унікальну тривимірну архітектуру. Конкретний клас білка цинкового пальця визначається цією тривимірною структурою, але він також може бути розпізнаний на основі первинної структури білка або ідентичності лігандів, що координують іон цинку. Незважаючи на велику різноманітність цих білків, переважна більшість, як правило, функціонує як модулі взаємодії, які зв'язують ДНК, РНК, білки або інші невеликі корисні молекули, а зміни в структурі служать, головним чином, для зміни специфічності зв'язування конкретного білка. . З часу свого первинного відкриття та з'ясування їх структури ці модулі взаємодії виявилися всюдисущими в біологічному світі і можуть бути виявлені у 3 % генів людського геному. Крім того, цинкові пальці стали надзвичайно корисними в різних терапевтичних та дослідницьких можливостях. Інженерні цинкові пальці, які мають спорідненість до певної послідовності, є сферою активних досліджень, а нуклеази цинкового пальця та фактори транскрипції з цинковим пальцем є двома найважливішими застосуваннями, які мають бути реалізовані на сьогоднішній день. 아연 집게(영어: zinc finger)는 단백질의 접힌 부분을 안정시키기 위해 하나 이상의 아연 이온(Zn2+)이 존재하는 작은 구조 단백질 모티브다. 원래 아프리카발톱개구리의 전사인자 IIIA로부터 가정된 구조의 집게같은 외관을 설명하기 위해 만들어진 아연 집게는 매우 다양한 단백질 구조를 포괄하게 되었다. 아프리카발톱개구리의 TFIIIA는 원래 아연을 함유하고 기능을 위해 금속을 필요로 하는 것으로 1983년에 입증되었다. 유전자 조절 단백질의 아연이 필요하다는 것이 처음 보고되었다. 다중 도메인 단백질에서 금속 결합 도메인으로 나타나는 경우가 많다. 아연 집게를 포함하는 단백질(아연 집게 단백질)은 여러 가지 다른 구조적 계열로 분류된다. 격자 모양이나 베타 헤어핀 구조와 같이 명확하게 정의되어 있는 많은 다른 2차 구조와는 달리, 각각 독특한 3차원 구조를 가진 아연 집게의 종류가 있다. 특정 아연 집게 단백질의 등급은 이 3차원 구조로 결정되지만, 아연 이온을 조정하는 단백질의 1차 구조나 리간드의 동일성에 근거하여도 인정될 수 있다. 그러나 이러한 단백질의 많은 다양성에도 불구하고, 대다수의 단백질은 일반적으로 DNA, RNA, 단백질 또는 기타 작고 유용한 분자를 결합하는 상호작용 모듈로서 기능하며, 구조의 변화는 주로 특정 단백질의 결합 특성을 변화시키는 역할을 한다. 아연 집게는 인간 게놈의 유전자의 3%에서 발견될 수 있다. 게다가 아연 집게는 다양한 치료와 연구 능력에 매우 유용하게 쓰인다. 특정 염기서열에 대한 친화력을 가지는 아연 집게는 활성 연구의 영역이며, 아연 집게 핵산 분해 효소와 아연 집게 전사인자는 현재까지 실현되어야 할 가장 중요한 두 가지 응용 분야이다. I motivi a dito di zinco (o, con accezioni leggermente differenti tra loro, zinc finger o zinc cluster) sono specifiche regioni proteiche in grado di legare il DNA. Palec cynkowy, palca cynkowego (ang. zinc finger domain) – rodzaj domeny białkowej występującej w białkach wiążących DNA i biorący bezpośredni udział w związaniu cząsteczki kwasu nukleinowego przez białko. Palec cynkowy składa się z dwóch antyrównoległych β-kartek i α-helisy. Obecność jonu cynku (Zn2+) jest kluczowa dla stabilności domeny – w przypadku jego braku nie dochodzi do powstania wystarczająco dużej domeny posiadającej hydrofobowy rdzeń i przez to funkcjonalnej. ジンクフィンガー(Zinc finger)はタンパク質ドメインの大きなスーパーファミリーの1つで、DNAに結合する性質を持つ。ジンクフィンガーは2つの逆平行βシートと1つのαヘリックスからなる。小さすぎて疎水中心を持たないため亜鉛イオンが安定化にとって重要である。 Цинковый палец (англ. zinc finger) — небольшой структурный мотив белка, стабилизированный одним или двумя ионами цинка, связанными координационными связями с аминокислотными остатками в составе белка. Как правило, цинковый палец включает около 20 аминокислот, ион цинка связывает 2 гистидина и 2 цистеина. Цинковые пальцы являются белковыми модулями, взаимодействующими с ДНК, РНК, другими белками или небольшими молекулами. Основными группами белков с цинковыми пальцами являются ДНК-связывающие факторы транскрипции, а также искусственные ферменты рестрикции, получаемые слиянием ДНК-связывающего домена цинкового пальца с ДНК-разрезающим доменом нуклеазы. Домен цинкового пальца может быть спроектирован так, чтобы узнавать желаемую последовательность ДНК и связываться с ней. Zinkový prst (z angl. zinc finger) je označení pro strukturní motiv běžně nacházený u celé řady bílkovin. Umožňuje především vazbu daných bílkovin na DNA (a RNA) a je proto součástí celé řady tzv. transkripčních faktorů. Je pojmenován podle toho, že má tvar zahnutého prstu, přičemž uvnitř se nachází vazebné místo pro zinek koordinačně navázaný na cysteinový a histidinový zbytek. Les proteïnes dits de zinc es troben dins del grup de les anomenades metal·loproteïnes, degut a la necessitat d'unir un o més , en aquest cas el zinc, per a dur a terme les seves funcions biològiques, regular les seves activitats o estabilitzar les seves estructures terciàries o quaternàries. Els dominis dits de zinc formen estructures úniques molt sòlides, sostingudes en la majoria dels casos per residus aminoacídics de cisteïnes (C) i histidines (H). Estudis experimentals mostren que quan el zinc és mogut del nucli de les estructures, els residus aminoacídics interaccionen entre si formant grans complexos de proteïnes que perden la seva funcionalitat, pel que l'acció coordinada entre la unió del zinc i el correcte plegament de la proteïna té moltes conseqüències tant químiques com biològiques. 锌指(英語:Zinc finger),又稱鋅手指,是一种小的蛋白质结构模体,其特征在于配合一个或多个锌离子(Zn2+)以稳定折叠。最初用来描述非洲爪蟾卵母细胞假说结构的手指状外观,锌指名称现在已经包含了各种不同的蛋白质结构。 在1983年,非洲爪蟾TFIIIA最初被证明含有锌,并且需要这种金属才能运行,这是被报道的第一个基因调节蛋白中具有锌的要求。 这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征基团与Zn2+的结合来稳定一种很短的,可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。 含有锌指的蛋白(锌指蛋白)被分为几个不同的结构家族。大多數的超二級結構,包括、,都已經被清楚定義。但鋅指的狀況並不是那麼簡單,含有鋅指的蛋白質大約分成幾類,每個鋅指結構都有相當特殊的三級結構,但其加上鋅離子的一級結構也是可以辨認配體。雖然鋅指之間有很大的變異,但大多是都是與DNA、RNA、蛋白質結合。 自从它们最初的发现和它们的结构阐明以来,这些相互作用的模块已经在生物世界中无处不在,并且可以在人类基因组的3%基因中被发现。另外,锌指在各种治疗和研究能力方面已经变得非常有用。研究者會設計出特殊的鋅手指,使其有不同的親合性。鋅指核酸酶和是當今最重要的應用。 Los dedos de zinc son pequeños motivos estructurales de proteínas que pueden coordinar uno o más iones de zinc para ayudar a estabilizar sus pliegues. Normalmente funcionan como módulos de interacción que unen el ADN, ARN, proteínas y moléculas pequeñas. Estas proteínas tienen un rol estructural esencialmente. Este rol puede consistir en bajar la entalpía de plegamiento de una proteína e inducir una conformación activa, o bien, estabilizar una estructura cuaternaria en particular. El zinc también tiene un rol regulativo, es decir, no participa en los varios pasos catalíticos, pero su presencia sí incrementa la rapidez catalítica.​ El nombre de "dedo de zinc" fue acuñado para describir la hipótesis de la estructura de la unidad repetida del factor de transcripción IIIA en Xenopus laevis. Los dedos de zinc coordinan iones de zinc con una combinación de residuos de cisteína e histidina. Pueden ser clasificados por el tipo y orden de estos residuos de coordinación con el cinc (por ejemplo, Cys2His2, Cys4, y Cys6). Un método más sistemático los clasifica en distintos "grupos de pliegues" basado en la forma de la columna de la proteína en el dominio plegado. El "grupo de pliegues" más común de dedos de zinc es el de tipo Cys2His2 (el "clásico dedo de zinc"), clave triple y cinta de cinc.​ Os dedos de zinco são domínios proteicos que têm a propriedade de se ligarem ao DNA. Um dedo de zinco é composto por duas folhas-beta antiparalelas e uma alfa-hélice. O íon de zinco é fundamental para garantir a estabilidade deste tipo de domínio. Na ausência do íon, o domínio desdobra-se e torna-se demasiado pequeno para albergar um núcleo hidrofóbico. A zinc finger is a small protein structural motif that is characterized by the coordination of one or more zinc ions (Zn2+) in order to stabilize the fold. It was originally coined to describe the finger-like appearance of a hypothesized structure from the African clawed frog (Xenopus laevis) transcription factor IIIA. However, it has been found to encompass a wide variety of differing protein structures in eukaryotic cells. Xenopus laevis TFIIIA was originally demonstrated to contain zinc and require the metal for function in 1983, the first such reported zinc requirement for a gene regulatory protein followed soon thereafter by the Krüppel factor in Drosophila. It often appears as a metal-binding domain in multi-domain proteins. Proteins that contain zinc fingers (zinc finger proteins) are classified into several different structural families. Unlike many other clearly defined supersecondary structures such as Greek keys or β hairpins, there are a number of types of zinc fingers, each with a unique three-dimensional architecture. A particular zinc finger protein's class is determined by this three-dimensional structure, but it can also be recognized based on the primary structure of the protein or the identity of the ligands coordinating the zinc ion. In spite of the large variety of these proteins, however, the vast majority typically function as interaction modules that bind DNA, RNA, proteins, or other small, useful molecules, and variations in structure serve primarily to alter the binding specificity of a particular protein. Since their original discovery and the elucidation of their structure, these interaction modules have proven ubiquitous in the biological world and may be found in 3% of the genes of the human genome. In addition, zinc fingers have become extremely useful in various therapeutic and research capacities. Engineering zinc fingers to have an affinity for a specific sequence is an area of active research, and zinc finger nucleases and zinc finger transcription factors are two of the most important applications of this to be realized to date. Een zinkvinger is een structuurmotief in eiwitten met een zinkion (Zn2+). Het zinkion stabiliseert de eiwitvouwing. De polypeptideketen vormt door het zinkion een lusvormige structuur: de zogenoemde zinkvinger, die een specifieke wisselwerking kan hebben met het DNA of RNA. De zinkvinger werd in 1985 door Aaron Klug ontdekt bij de transcriptiefactor IIIA in de oöcyten van de klauwkikker (Xenopus laevis). Gedacht werd dat de DNA-bindingslus gevormd door de donor-acceptorbinding van de liganden vingers vertegenwoordigden, vandaar de naam zinkvingers. Sinds de ontdekking en opheldering van de zinkvingerstructuren blijken ze alomtegenwoordig te zijn. Zo komen ze bijvoorbeeld voor bij 3% van de menselijke genen. De zinkvingereiwitmotieven zijn hoofdzakelijk aan DNA bindende eiwitmotieven. Daarom zijn het meestal transcriptiefactoren. Ook zijn er RNA-bindende zinkvingereiwitten bekend. Tot de zinkvingereiwitmotieven behoren echter ook receptoren voor steroïdhormonen. Les doigts de zinc sont de petits motifs structuraux trouvés dans les protéines et capables d'ordonner en complexe un ou plusieurs ions zinc pour stabiliser leur repliement. Ils peuvent être classés en plusieurs familles structurelles différentes (protéines à doigt de zinc) et fonctionnent typiquement comme des groupes d'interaction liant l'ADN, l'ARN, les protéines ou de petites molécules. Le nom « doigt de zinc » a initialement été donné pour décrire l'apparence semblable à des doigts d'un diagramme montrant la structure hypothétique de l'unité répétée dans le de Xenopus laevis.
dbp:cdd
cd00067
gold:hypernym
dbr:Motif
prov:wasDerivedFrom
wikipedia-en:Zinc_finger?oldid=1117353449&ns=0
dbo:wikiPageLength
42295
dbo:symbol
Zn_clus zf-C2HC zf-CCHC TF_Zn_Ribbon zf-C2H2 zf-C2HC5
foaf:isPrimaryTopicOf
wikipedia-en:Zinc_finger