In molecular biology and bioinformatics, the consensus sequence (or canonical sequence) is the calculated order of most frequent residues, either nucleotide or amino acid, found at each position in a sequence alignment. It serves as a simplified representation of the population. It represents the results of multiple sequence alignments in which related sequences are compared to each other and similar sequence motifs are calculated. Such information is important when considering sequence-dependent enzymes such as RNA polymerase.
| Attributes | Values |
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| rdfs:label
| - Konsensussequenz (de)
- Secuencia de consenso (es)
- Consensus sequence (en)
- Séquence consensus (fr)
- コンセンサス配列 (ja)
- Consensussequentie (nl)
- Консенсусная последовательность (ru)
- 共有序列 (zh)
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| - In molecular biology and bioinformatics, the consensus sequence (or canonical sequence) is the calculated order of most frequent residues, either nucleotide or amino acid, found at each position in a sequence alignment. It serves as a simplified representation of the population. It represents the results of multiple sequence alignments in which related sequences are compared to each other and similar sequence motifs are calculated. Such information is important when considering sequence-dependent enzymes such as RNA polymerase. (en)
- En biología molecular y bioinformática, la secuencia de consenso o secuencia canónica es el orden calculado más frecuente, ya sea de nucleótidos o aminoácidos, encontrado en cada posición en una alineación de secuencia. Representa los resultados de alineaciones de secuencia múltiples en las que las secuencias relacionadas se comparan entre sí y se calculan motivos de secuencia similares.Dicha información es importante cuando se consideran enzimas dependientes de secuencia como la polimerasa de ARN. (es)
- 分子生物学やバイオインフォマティクスにおいて、コンセンサス配列 (consensus sequence) もしくはカノニカル配列 (canonical sequence) とは、シーケンスアラインメントの各位置における最も高頻度の残基（ヌクレオチドやアミノ酸など）が計算された配列である。関連のある配列が比較され、類似の配列モチーフについて多重配列アラインメントがなされた結果を表している。このような情報は、RNAポリメラーゼのような配列依存性の酵素について考慮する場合に重要である。 (ja)
- Консенсусная последовательность (consensus sequence) — искусственная последовательность ДНК или РНК, содержащая в каждой позиции нуклеотид, наиболее часто встречающийся у нескольких гомологичных последовательностей. Она представляет собой результат множественного выравнивания последовательностей, в которых гомологичные последовательности сравниваются друг с другом. Такая информация важна при изучении ДНК- или РНК-связывающих белков, таких как транскрипционные факторы или РНК-полимераза. (ru)
- 在分子生物学和生物信息学中，共有序列是最常见的核酸或者氨基酸残基的计算规则，序列比对中的每个序列中存在，代表多个相关序列被比较，计算相似的。当考虑序列依赖酶，例如RNA聚合酶时，这些訊息十分重要。 (zh)
- Als Konsensussequenz wird diejenige Sequenz von Nukleotiden oder Aminosäuren bezeichnet, welche in der Summe am wenigsten von einer gegebenen Menge von entsprechenden Mustersequenzen abweicht. Die genaue Beschaffenheit dieser Sequenz kann hierbei je nach Wahl des Abstandsmaßes, wie etwa Hamming- oder Levenshtein-Distanz, variieren. In der Regel werden Konsensussequenzen heuristisch aus einem multiplen Sequenzalignment (MSA) erstellt. Im einfachsten Fall wird dasjenige Element in die Konsensussequenz aufgenommen, welches in der entsprechenden Spalte des MSA am häufigsten vorkommt. (de)
- En biologie moléculaire et en bioinformatique, une séquence consensus est la séquence nucléotidique ou la séquence peptidique la plus fréquente à chaque position d'un alignement de séquences. Elle représente le résultat d'alignements de séquences multiples dans lesquelles les séquences apparentées sont comparées les unes aux autres afin de déterminer les motifs les plus fréquents. Cette information est importante pour les protéines dépendantes des séquences nucléotidiques, telles que les ARN polymérases. (fr)
- Een consensussequentie is de theoretische nucleotidevolgorde die gevormd wordt door drie of meer homologe sequenties te vergelijken en de nucleotiden die het meest voorkomen op elke positie te selecteren. De consensussequentie is een soort "modus" van een groot aantal individuele sequenties die samengevoegd zijn door middel van alignment. Een populaire manier om een consensussequentie weer te geven is een sequentielogo, waarin de letters van elke nucleotide op elkaar zijn gestapeld, met de meest voorkomende letter het grootst. (nl)
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| - Als Konsensussequenz wird diejenige Sequenz von Nukleotiden oder Aminosäuren bezeichnet, welche in der Summe am wenigsten von einer gegebenen Menge von entsprechenden Mustersequenzen abweicht. Die genaue Beschaffenheit dieser Sequenz kann hierbei je nach Wahl des Abstandsmaßes, wie etwa Hamming- oder Levenshtein-Distanz, variieren. Meist liegt der Erstellung einer Konsensussequenz die Annahme zugrunde, dass die gegebenen Sequenzen einen gemeinsamen evolutionären Ursprung haben oder ein Sequenzmotiv mit einer bestimmten biologischen Aufgabe repräsentieren, wobei es oft auch sinnvoll sein kann, mehrdeutige Konsensussequenzen zu formulieren. Bei Nukleinsäuren können hierfür die Basensymbole der Nukleinsäure-Nomenklatur verwendet werden, also neben den eindeutigen Basensymbolen A,C,G,T,U auch beispielsweise R für eine beliebige Purinbase, Y für eine beliebige Pyrimidinbase oder N für ein beliebiges Nukleotid schlechthin. In der Regel werden Konsensussequenzen heuristisch aus einem multiplen Sequenzalignment (MSA) erstellt. Im einfachsten Fall wird dasjenige Element in die Konsensussequenz aufgenommen, welches in der entsprechenden Spalte des MSA am häufigsten vorkommt. (de)
- In molecular biology and bioinformatics, the consensus sequence (or canonical sequence) is the calculated order of most frequent residues, either nucleotide or amino acid, found at each position in a sequence alignment. It serves as a simplified representation of the population. It represents the results of multiple sequence alignments in which related sequences are compared to each other and similar sequence motifs are calculated. Such information is important when considering sequence-dependent enzymes such as RNA polymerase. (en)
- En biología molecular y bioinformática, la secuencia de consenso o secuencia canónica es el orden calculado más frecuente, ya sea de nucleótidos o aminoácidos, encontrado en cada posición en una alineación de secuencia. Representa los resultados de alineaciones de secuencia múltiples en las que las secuencias relacionadas se comparan entre sí y se calculan motivos de secuencia similares.Dicha información es importante cuando se consideran enzimas dependientes de secuencia como la polimerasa de ARN. (es)
- En biologie moléculaire et en bioinformatique, une séquence consensus est la séquence nucléotidique ou la séquence peptidique la plus fréquente à chaque position d'un alignement de séquences. Elle représente le résultat d'alignements de séquences multiples dans lesquelles les séquences apparentées sont comparées les unes aux autres afin de déterminer les motifs les plus fréquents. Cette information est importante pour les protéines dépendantes des séquences nucléotidiques, telles que les ARN polymérases. Par exemple, les séquences CAAT et TATA (boîte TATA) sont connues pour être des séquences promotrices d'une partie des gènes des eucaryotes. Les facteurs de transcription régulent l’expression de leurs gènes cibles en se fixant à une séquence nucléotidique spécifique, appelée site de fixation. Or la spécificité entre un facteur de transcription et son site de fixation n’est pas toujours parfaite. L’alignement de séquences correspondant au même facteur de transcription permet donc de déterminer la séquence conservée, appelée séquence consensus. (fr)
- 分子生物学やバイオインフォマティクスにおいて、コンセンサス配列 (consensus sequence) もしくはカノニカル配列 (canonical sequence) とは、シーケンスアラインメントの各位置における最も高頻度の残基（ヌクレオチドやアミノ酸など）が計算された配列である。関連のある配列が比較され、類似の配列モチーフについて多重配列アラインメントがなされた結果を表している。このような情報は、RNAポリメラーゼのような配列依存性の酵素について考慮する場合に重要である。 (ja)
- Een consensussequentie is de theoretische nucleotidevolgorde die gevormd wordt door drie of meer homologe sequenties te vergelijken en de nucleotiden die het meest voorkomen op elke positie te selecteren. De consensussequentie is een soort "modus" van een groot aantal individuele sequenties die samengevoegd zijn door middel van alignment. Een populaire manier om een consensussequentie weer te geven is een sequentielogo, waarin de letters van elke nucleotide op elkaar zijn gestapeld, met de meest voorkomende letter het grootst. Het creëren van een consensussequentie is gebaseerd op de aanname dat de gegeven set sequenties een gemeenschappelijke evolutionaire oorsprong hebben of een sequentiemotief vertegenwoordigen met een specifieke biologische taak. Individuele variaties, polymorfismen, puntmutaties en leesfouten worden meestal genegeerd in de consensussequentie, omdat ze vaak uniek zijn voor een van de gegeven sequenties. (nl)
- Консенсусная последовательность (consensus sequence) — искусственная последовательность ДНК или РНК, содержащая в каждой позиции нуклеотид, наиболее часто встречающийся у нескольких гомологичных последовательностей. Она представляет собой результат множественного выравнивания последовательностей, в которых гомологичные последовательности сравниваются друг с другом. Такая информация важна при изучении ДНК- или РНК-связывающих белков, таких как транскрипционные факторы или РНК-полимераза. (ru)
- 在分子生物学和生物信息学中，共有序列是最常见的核酸或者氨基酸残基的计算规则，序列比对中的每个序列中存在，代表多个相关序列被比较，计算相似的。当考虑序列依赖酶，例如RNA聚合酶时，这些訊息十分重要。 (zh)
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